수중음향렌즈 카메라에서 영상 품질 향상을 위한 SIR 분석

이지은(Jieun Lee),임성빈(Sungbin Im),심태보(Taebo Shim) 대한전자공학회 2014 전자공학회논문지 Vol.51 No.4

Spreading-dependent or independent Sir2-mediated gene silencing in budding yeast

Yeom Soojin,Oh Junsoo,Lee Jung-Shin 한국유전학회 2022 Genes & Genomics Vol.44 No.3

Background: In the budding yeast Saccharomyces cerevisiae, a silent chromatin structure is formed at three distinct loci, including telomeres, rDNA, and mating-type loci, which silence the expression of genes within their structures. Sir2 is the only common factor, regulating the three silent chromatin regions. S. cerevisiae has 32 telomeres, but studies on gene silencing in budding yeast have been performed using some reporter genes, artificially inserted in the telomeric regions. Therefore, insights into the global landscape of Sir-dependent silencing of genes within the silent chromatin regions are required. Objective: This study aimed to obtain global insights into Sir2-dependent gene silencing on all silent chromatin regions in budding yeast. Methods: RNA-sequencing was performed to identify genes that are silenced by Sir2. By comparing with the chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) of Sir2 in the wild-type strain, we confirmed Sir2-regulated genes. Results: Using Sir2 ChIP-seq data, we identified that the Sir2 binding domain length caused by Sir2 spreading from the chromosomal end is different in each telomere in budding yeast. Expression of most subtelomeric genes increased in the ∆sir2 strain. Some Sir2-regulated subtelomeric genes were positioned within the telomeric Sir2-binding domain, while the others were outside the Sir2-binding domain. In addition, Sir2 was bound to the mating-type loci and rDNA region, and gene expression increased in the ∆sir2 strain. Conclusion: We concluded that S. cerevisiae has two modes of Sir2-mediated gene silencing: one is dependent on chromatin binding and spreading of Sir2, and the other is independent of spreading of Sir2.

얼굴 없는 사내와 죽음의 극복

황현산 한국비교문학회 2012 비교문학 Vol.0 No.57

Dans sa Chanson du mal-aimé, Apollinaire affirme savoir “des chansons pour les sirènes”. La question qui se pose alors est de savoir ce que signifie cette simple affirmation ; en effet, s’agit-il de chansons ayant pour sujet les sirènes, de chansons destinées à ê̂tre chantées par les sirènes ou encore de chansons pour rivaliser avec le chant des sirènes. La réponse à cette interrogation se trouve peut-ê̂tre dans un autre poème d’Apollinaire, le de Saint dans lequel il évoque un “homme sans yeux ni nez ni oreille”. Et tout comme les sirènes attirent par leur chant les hommes dans leurs bras mortels, cet homme sans visage attire les femmes en un lieu inconnu. Ces deux images qui se ressemblent et s’opposent nous parle de l’attitude d’Apollinaire devant l’acte poétique et le statut du poète. Une comparaison avec un poème de Gautier nous apprend que ce thème des sirènes et de l’errance du poète a rapport avec la mémoire et la mort. Si bien que dans un autre poème dans lequel il évoque les sirènes, Lul de Phaltenin, Apollinaire s’adresse directement aux sirènes, disant qu’il est venu “rampé vers leurs grottes”. Autrement dit, le poète choisit la mort, une mort qui était “heureuse” chez Gautier puisqu’elle s’opposait à la vie impuissante, mais cette attirance vers la mort, chez Apollinaire, s’identifie à l’élan poétique, mais qui n’a rien d’‘heureux’. Dans sa Chanson du mal-aimé, Apollinaire affirme savoir “des chansons pour les sirènes”. La question qui se pose alors est de savoir ce que signifie cette simple affirmation ; en effet, s’agit-il de chansons ayant pour sujet les sirènes, de chansons destinées à ê̂tre chantées par les sirènes ou encore de chansons pour rivaliser avec le chant des sirènes. La réponse à cette interrogation se trouve peut-ê̂tre dans un autre poème d’Apollinaire, le de Saint dans lequel il évoque un “homme sans yeux ni nez ni oreille”. Et tout comme les sirènes attirent par leur chant les hommes dans leurs bras mortels, cet homme sans visage attire les femmes en un lieu inconnu. Ces deux images qui se ressemblent et s’opposent nous parle de l’attitude d’Apollinaire devant l’acte poétique et le statut du poète. Une comparaison avec un poème de Gautier nous apprend que ce thème des sirènes et de l’errance du poète a rapport avec la mémoire et la mort. Si bien que dans un autre poème dans lequel il évoque les sirènes, Lul de Phaltenin, Apollinaire s’adresse directement aux sirènes, disant qu’il est venu “rampé vers leurs grottes”. Autrement dit, le poète choisit la mort, une mort qui était “heureuse” chez Gautier puisqu’elle s’opposait à la vie impuissante, mais cette attirance vers la mort, chez Apollinaire, s’identifie à l’élan poétique, mais qui n’a rien d’‘heureux’.

포크 형태의 개방형 스터브 및 SIR 구조를 이용한 이중대역 대역통과 여파기의 설계

이태현 한국ITS학회 2023 한국ITS학회논문지 Vol.22 No.1

This paper proposes a design of a dual-band band-pass filter that integrates a λg/2 open SIR structure, a transmission line, and a fork-type structure with symmetric and asymmetric open stubs. To obtain the dual-band effect, the proposed filter uses the SIR structure and adjusts the impedance ratio of the SIR structure. Therefore, the position of the harmonics of the filter is shifted through the adjustment of the impedance ratio, and this can obtain a double-band effect. In order to obtain the dual-band characteristics, the dual-band effect is obtained by inserting a open stub between the SIR structures with the SIR structure divided in half. In addition, the second frequency response is obtained by adjusting the length of the open symmetrical stub in the fork-shaped structure. The asymmetrical open stub in the fork form achieves optimum bandwidth by adjusting the length. Therefore, the first center frequency of the proposed band-pass filter is 5.896 GHz and the bandwidth is 13.6 %. At this time, the measurement results are 0.13 dB and 33.6 dB. The second center frequency is 5.906 GHz and the bandwidth is 13.6 %. At this time, the measurement results are 0.15 dB and 19.8 dB. The reason is that when the impedance ratio (Δ) is higher than 1, the position of the harmonic is shifted to a lower frequency band. However, if the impedance ratio (Δ) is lowered by one step, the position of harmonics will move to a higher frequency band. The function of the filter designed using these characteristics can be obtained from the measurement result. The proposed band-pass filter has no coupling loss and no via energy concentration loss because there is no coupling structure of input/output and no via hole. Therefore, system integration is possible due to its excellent performance, and it is expected that dedicated short-range communication (DSRC) system applications used in traffic communication systems will be possible. 본 논문은 λg/2 개방형 SIR 구조와 전송선로와 대칭 및 비대칭 개방형 스터브를 가진 포크- 형태의 구조를 일체화한 이중대역 대역통과 여파가 설계에 대해 제안을 한다. 이중대역 효과를 얻기 위해, 제안된 여파기는 SIR 구조를 이용했고, SIR 구조의 임피던스 비율을 조절한다. 그러므로 여파기의 고조파는 임피던스 비율의 조절을 통해 위치가 이동하게 되며 이는 이중대역 효과를 얻을 수 있다. 이중대역 특성을 얻기 위해 SIR 구조를 반으로 나눈 상태에서 SIR 구조 사이에 개방형 스터브를 삽입하여 이중대역 효과를 얻는다. 또한 포크 형태의 구조에서개방형 대칭 스터브의 길이를 조절함으로써 두 번째 주파수 응답을 얻는다. 포크 형태에서 비대칭 개방형 스터브는 길이의 조절을 통해 최적의 대역폭을 얻는다. 그러므로 제안된 대역통과 여파기의 첫 번째 중심 주파수는 5.896 GHz이며 대역폭은 13.6 % 이다. 이때, 측정 결과는0.13 dB 및 33.6 dB이다. 두 번째 중심 주파수는 5.906 GHz이며 대역폭은 13.6 % 이다. 이때, 측정 결과는 0.15 dB 및 19.8 dB이다. 그 이유는 임피던스 비율(Δ)이 1보다 높으면 고조파의위치는 낮은 주파수 대역으로 이동하게 된다. 그러나 임피던스 비율(Δ)이 1보 낮아지게 된다면고조파의 위치는 높은 주파수 대역으로 이동하게 될 것이다. 이러한 특징을 이용하여 설계된여파기의 기능은 측정 결과에서 얻을 수 있다. 제안한 대역통과 여파기는 입출력의 결합구조와 비아 홀이 없기 때문에 결합손실과 비아 에너지 집중 손실이 없다. 그러므로 성능이 우수하여 시스템 집적화가 가능하며 교통통신 시스템에서 활용되는 DSRC (dedicated short-range communication) 시스템 응용이 가능할 것으로 기대된다.

DNA 형태 적응을 거쳐 P2sir-관련 도움파지 비효율성을 극복하는 박테리오파지 P4 sid⁺ 유도체 정성 연구

김경진,Kim, Kyoung-Jin 한국미생물학회 2016 미생물학회지 Vol.52 No.1

A certain size of DNA (28-29 kb long) to be packaged into P2-size head and the mutation in sid gene of bacteriophage P4 are the major factors to overcome "P2 sir-associated helper inefficiency". To clarify whether the presence of sid mutation is essential to overcome "P2 sir-associated helper inefficiency" or not, we tested the P4 derivative, P4 delRI::kmr, which is $sid^+$ and whose genome size supposed to be 28.5 kb long in the case of being packaged into $P2_{sir3}$-sized large head. As P4 delRI::kmr showed the low EOP with P2 sir3 lysogen, P4 delRI::kmr phage stock was prepared in P2 sir3 lysogen host to increase the EOP with P2 sir3 lysogen. Through this process, P4 delRI::kmr had been adapted for P2 sir3 lysogen. With a CsCl buoyant equilibrium density gradient experiment and gel electrophoresis of the isolated DNA, it was evident that the adaptation of P4 delRI::kmr for P2 sir3 lysogen was caused by the conformational change of DNA to be packaged into large head. The burst size determination experiments with P4 delRI::kmr phage stock adapted for P2 sir3 lysogen and normal P4 delRI::kmr phage stock showed that not the sid mutation but the size of DNA to be packaged (28-29 kb long) was essential to overcome "P2 sir-associated helper inefficiency".

SIR 알고리즘을 이용한 홍수량 빈도해석에 관한 연구

문기호,경민수,김덕길,곽재원,김형수 한국습지학회 2008 한국습지학회지 Vol.10 No.3

일반적으로 빈도해석을 진행할 경우 자료는 정상성을 가정하고 분석하게 된다. 그러나 최근 들어 기후변화 등의 원인으로 인하여 강우나 유출량이 변화하고 있어 변화하는 강우나 유출량을 고려해서 빈도해석을 해야 한다는 주장이 제기되고 있다. 이에 본 연구에서는 Bootstrap을 기반으로 개발된 SIR 알고리즘을 이용하여 홍수빈도해석을 수행하기위한 방안을 제시하였다. SIR 알고리즘은 우도함수를 고려하여 자료를 재추출하기 위해서 사용되어 왔으며, 본 연구에서도 최근에 변화하는 홍수량의 변화 양상을 고려하여 홍수량 자료를 재추출하기 위해서 적용되었다. 증가된 홍수 특성을 고려하여 재추출된 홍수량자료는 매개변수적 빈도해석을 함으로써 지속시간별 홍수량을 산정하였으며, 산정된 빈도별 홍수량들을 Bootstrap을 이용해서 재추출한 자료를 이용한 빈도해석 결과와 원자료를 이용하여 분석한 빈도해석 결과를 비교하였다. 비교결과 SIR알고리즘을 이용해서 빈도해석을 진행한 경우의 빈도별 홍수량이 가장 크게 나타났다. 따라서 홍수빈도해석시 현재까지의 변화하는 홍수량 패턴을 고려할 경우, 확률홍수량이 증가하는 것을 확인하였다. Generally, stationary is considered as a basic assumption in frequency analysis. However, rainfall and flood discharge are changing due to the climate change and climate variability. Therefore, there is a new opinion that changing pattern of rainfall and flood discharge must be considered in frequency analysis. This study suggests the flood frequency analysis methodology using SIR algorithm which was developed from bootstrap could be used for considering climate change. Than is, SIR algorithm is selected for resampling method considering changing pattern of flood discharge and it has been used for resampling method with likelihood function. Resampled flood discharge data considering the increase of flood discharge pattern are used for parametric flood frequency analysis and this results are compared with frequency analysis results by Bootstrap and original observations. As the results, SIR algorithm shows the greatest flood discharge than other methods in all frequencies and this may reflect the increasing pattern of flood discharge due to the climate change and climate variability.

형사책임능력 감정척도 SIRS-2의 도입을 위한 예비 연구 - 대학생 집단을 대상으로 -

이지연,이수정 한국보호관찰학회 2016 보호관찰 Vol.16 No.2

옳고 그름의 본질을 가릴 수 없거나 행동을 통제할 수 없는 경우의 범죄 행위는 정신장애에 기인한 것으로 보고 책임을 묻지 않는 것이 원칙이다. 우리나라에서는 이들 범법 정신장애인의 건강권을 보장하고 안정적인 사회 복귀를 돕기 위해 2016년 12월에 치료감호제도 시행을 앞두고 있다. 한편 범죄 행위에 대한 처벌을 회피하고 일종의 치료적 혜택을 편취하기 위해 정신장애를 가장하는 자들을 사병을 시도하는 자(Malingerer)라고 지칭하는데, 사병의 유병률은 정신감정 사례 중 최소 20% 이상을 유지하고 있는 것으로 보고되고 있다. 따라서 본 논문에서는 치료감호법을 악용하려는 시도가 보다 늘어날 것으로 추정하고 이에 대비하기 위해 사병을 평가하는 전문화된 검사 도구인 SIRS-2를 국내에 도입하기 위한 타당도 연구를 진행하였다. 모사 설계에서는 대학생 106명을 대상으로 하여 실험 상황에서 검사 도구의 진단 효과성을 규명하고자 하였다. 연구 결과, 솔직한 답변을 요청한 통제 집단과 조현병 증상을 가장하도록 요청한 사병 집단 간 SIRS-2의 진단 결과에서 유의미한 차이가 발생하였다. 또한 SIRS-2 하위 척도 점수들의 평균 점수를 산출하고 집단 간 차이를 분석한 결과 모든 척도 점수에서 사병 집단의 평균이 월등히 높은 것으로 나타났다. 이러한 결과는 SIRS-2가 증상을 가장하려는 시도를 정확하게 감별하는 기능이 뛰어나다는 것을 의미한다. 마지막으로 본 연구의 의의와 한계점을 기술하였다. In the principle of criminal justice, mentally disordered offenders who can not distinguish the essence of right and wrong or control one’s own behavior have no criminal responsibility. To guarantee their health rights and help adapting to the community, Mental Health Treatment Order was legislated and are in the process of implementing in December 2016. The problem is how to accurately detect the malingerers who fake the mental disorder, avoid criminal responsibility and even snatch away the therapeutic benefits. Even though the prevalence of malingering is maintained at least 20% of criminal cases, it is estimated that there will be more attempts to abuse the Mental Health Treatment Order. Therefore, the purpose of present study was to examine the applicability of the Korean version of SIRS-2. The 106 college students was randomly assigned to the control-genuine group or malingering group and their SIRS-2 data was used to analyze the internal validity. The results of the study showed that there was significant difference both in the SIRS-2 diagnosis and subscale scores between the control-genuine group and the malingering group. These results indicate that SIRS-2 has an excellent function to accurately distinguish the feigned symptoms. Finally, the implications and limitations of this study were discussed for the future research.

형사책임능력 감정척도 도입을 위한 예비연구 : M-FAST와 SIRS-2를 중심으로

손세림,이수정,이지연 한국경찰연구학회 2016 한국경찰연구 Vol.15 No.2

본 연구의 목적은 수사 단계에서 프로파일러들이 간단한 훈련을 통해 빠르게 사병을 감별할 수 있도록 전문화된 검사 도구인 SIRS-2를 국내에 도입하기에 앞서 국내 표본을 대상으로 사병 변별에서의 적합성이 있는지를 알아보는 데 있다. 이를 위해 전국 7개 교도소에 수감 중인 M급 수형자 48명을 면담하였으며, M-FAST를 기준으로 SIRS-2의 사병 진단의 효과성을 규명하고자 하였다. 연구 결과, SIRS-2에서 허위증상 및 판단불가-평가 진단을 받은 집단은 M-FAST에서도 6점 이상인 것으로 나타나 증상 가장의 가능성을 공통적으로 제시하였다. 또한, SIRS-2 하위 척도 8개의 변별 점수를 기준점으로 삼아 사병 가능성 유, 무의 두 집단으로 나눈 뒤 M-FAST 총점 상 평균을 산출한 결과 사병 가능성이 있는 집단의 평균이 월등히 높은 것으로 나타났다. 특히 사병 의심 집단은 SIRS-2의 주요 척도 4개 모두에서 M-FAST 총점 상 유의미한 차이를 보였다. 마지막으로, 본 연구의 의의와 제한점을 기술하였다. The purpose of the present study was to examine whether SIRS-2 developed to detect malingering is possibly applicable to Korean population. The 48 criminal offenders' SIRS-2 data and M-FAST data were used to analyze the reliability and validity of the SIRS-2. The probable malingering group that was categorized as feigning and indeterminate according to SIRS-2 protocol obtained scores above 6 on M-FAST. On the other hand, The non-probable malingering group that was classified as genuine patients obtained scores below 6 on M-FAST. To further examine the utility of cutoff scores of primary scales, two groups were divided into feigning and genuine and their mean total scores of M-FAST were compared. Results indicated that the M-FAST score of the probable malingering group was significantly higher than that of the genuine group. Finally the implication and limitation of this study were discussed for the future research.

HST1 increases replicative lifespan of a sir2Δ mutant in the absence of PDE2 in Saccharomyces cerevisiae

강우규,Mayur Devare,김정윤 한국미생물학회 2017 The journal of microbiology Vol.55 No.2

Silent information regulator 2 (Sir2), which is the founding member of the sirtuin family of proteins, is a pro-longevity factor for replicative lifespan (RLS) in Saccharomyces cerevisiae. Sir2 is required for transcriptional silencing at mating type loci, telomeres, and rDNA loci. Sir2 also represses transcription of highly expressed growth-related genes, such as PMA1 and some ribosomal protein genes. Although the Sir2 paralogues Hst1, Hst2, Hst3, and Hst4 occur in S. cerevisiae, none of them could replace the transcriptional regulation of PMA1 by Sir2 in the wild type. In this study, we demonstrate that Hst1, the closest Sir2 paralogue, deacetylates the acetylated lysine 16 of histone H4 (H4K16Ac) and represses PMA1 transcription in the sir2Δ pde2Δ mutant. We further show that Hst1 plays a role in extending the RLS of the sir2Δ pde2Δ mutant. Collectively, our results suggest that Hst1 can substitute for Sir2 by deacetylating H4K16Ac only in the sir2Δ pde2Δ.

Construction and characterization of the bacteriophage P4 derivatives whose genome size suitable for packaging into a P2_sir3-sized head

김경진,Kim, Kyoung-Jin The Microbiological Society of Korea 2015 미생물학회지 Vol.51 No.1

"P2 sir-관련 도움파지 비효율성"이라는 용어는 P2 sir 변이체가 그들의 위성 박테리오파지인 P4에 대해 도움파지 역할을 충분히 못하는 것을 가리키는 용어이다. 이 연구의 목적은 이러한 P2 sir-관련 도움파지 비효율성을 극복하는 요인들을 조사하는 것이다. 우선 P2의 cos 영역을 함유하는 P4 sid71 cosP2가 P2 sir3의 도움파지 비효율성을 극복하는지를 조사하였다. 그 결과 P4 sid71 cosP2는 P2 sir3의 도움파지 비효율성을 극복하지 못하였다. P2의 cos 영역 대신에 $P2_{sir}$-sized head에 packaging되는 DNA 크기가 도움파지 비효율성을 극복하는 중요한 요인으로 나타났다. 이 연구에서는, DNA 조작을 통해 packaging 되는 DNA 크기가 P4 ost1과 P4 ost2 사이가 되는 세 종류의 P4 유도체를 조성하였다. 그 중 하나인 P4 sid71 delRI::apr의 CsCl 균등밀도차실험을 거쳐 packaging되는 DNA의 크기를 확인하였다. P4 유도체들의 후손방출량 실험에 따르면 그들은 모두 P2sir3-관련 도움파지 비효율성을 극복하였다. $P2_{sir3}$-sized head에 잘 packaging되는 P4 유도체의 크기는 28-29 kb로 나타났다.