수중음향렌즈 카메라에서 영상 품질 향상을 위한 SIR 분석

이지은(Jieun Lee),임성빈(Sungbin Im),심태보(Taebo Shim) 대한전자공학회 2014 전자공학회논문지 Vol.51 No.4

Construction and characterization of the bacteriophage P4 derivatives whose genome size suitable for packaging into a P2_sir3-sized head

김경진,Kim, Kyoung-Jin The Microbiological Society of Korea 2015 미생물학회지 Vol.51 No.1

"P2 sir-관련 도움파지 비효율성"이라는 용어는 P2 sir 변이체가 그들의 위성 박테리오파지인 P4에 대해 도움파지 역할을 충분히 못하는 것을 가리키는 용어이다. 이 연구의 목적은 이러한 P2 sir-관련 도움파지 비효율성을 극복하는 요인들을 조사하는 것이다. 우선 P2의 cos 영역을 함유하는 P4 sid71 cosP2가 P2 sir3의 도움파지 비효율성을 극복하는지를 조사하였다. 그 결과 P4 sid71 cosP2는 P2 sir3의 도움파지 비효율성을 극복하지 못하였다. P2의 cos 영역 대신에 $P2_{sir}$-sized head에 packaging되는 DNA 크기가 도움파지 비효율성을 극복하는 중요한 요인으로 나타났다. 이 연구에서는, DNA 조작을 통해 packaging 되는 DNA 크기가 P4 ost1과 P4 ost2 사이가 되는 세 종류의 P4 유도체를 조성하였다. 그 중 하나인 P4 sid71 delRI::apr의 CsCl 균등밀도차실험을 거쳐 packaging되는 DNA의 크기를 확인하였다. P4 유도체들의 후손방출량 실험에 따르면 그들은 모두 P2sir3-관련 도움파지 비효율성을 극복하였다. $P2_{sir3}$-sized head에 잘 packaging되는 P4 유도체의 크기는 28-29 kb로 나타났다. The term "P2 sir-associated helper inefficiency" has been used to define the inefficient helper capability of P2 sir mutants for their satellite bacteriophage P4. The aim of this study was to investigate the factors overcoming P2 sir-associated helper inefficiency. At first, we verified whether the P2 cos region containing P4 sid71 cosP2 could overcome P2 sir-associated helper inefficiency with P2 sir3. The result was that P4 sid71 cosP2 could not overcome P2 sir-associated helper inefficiency with P2 sir3. Instead of cos region of P2, the size of the DNA packaged into a $P2_{sir}$-sized head seems to be important for overcoming P2 sir-associated helper inefficiency. In the present work, three kinds of P4 derivatives with packaged DNA sizes between those of P4 ost1 and P4 ost2, were constructed through DNA manipulation. In one P4 derivative, P4 sid71 delRI::apr, the size of the packaged DNA was identified with a CsCl buoyant equilibrium density gradient experiment. According to the burst sizes of the P4 derivatives, they could overcome P2 sir3-associated helper inefficiency. The size of the P4 derivative DNA suitable for packaging into a $P2_{sir3}$-sized head was 28-29 kb.

DNA 형태 적응을 거쳐 P2sir-관련 도움파지 비효율성을 극복하는 박테리오파지 P4 sid⁺ 유도체 정성 연구

김경진,Kim, Kyoung-Jin 한국미생물학회 2016 미생물학회지 Vol.52 No.1

P2-크기 머리에 packaging 될 특정 DAN 크기(28-29 kb long)와 박테리오파지 P4 유전자 sid의 변이가 "P2 sir-관련 도움파지 비효율성"을 극복할 수 있는 요소로 압축되었다. 유전자 sid의 변이 여부가 필수적인지를 확인하기 위해, 정상적인 sid 유전자를 가지며 $P2_{sir3}$-크기의 큰 머리에 packaging 될 DNA 크기가 28.5 kb되는 P4 delRI::kmr을 사용하여 실험하였다. P4 delRI::kmr이 P2 sir3 용원소에 대해 낮은 EOP를 보이므로, 이를 증가시키기 위해 P2 sir3 용원소를 숙주세포로 하여 파지 stock을 제조하였다. 이 과정에서 P4 delRI::kmr이 P2 sir3 용원소에 대해 적응하는 것을 관찰하고, CsCl 부양 균등밀도 편차실험과 분리된 DNA의 전기영동을 통해 그것이 packaging 될 머리 크기에 따른 DNA 형태 변화에 의한 적응이라는 것을 알아냈다. P2 sir3 용원소에 적응된 P4 delRI::kmr과 적응되지 않은 P4 delRI::kmr stock의 burst size 결정 실험은, sid 유전자 변이에 상관없이 packaging 될 DNA 크기에 의해 "P2 sir-관련 도움파지 비효율성"이 극복된다는 것을 보여주었다. A certain size of DNA (28-29 kb long) to be packaged into P2-size head and the mutation in sid gene of bacteriophage P4 are the major factors to overcome "P2 sir-associated helper inefficiency". To clarify whether the presence of sid mutation is essential to overcome "P2 sir-associated helper inefficiency" or not, we tested the P4 derivative, P4 delRI::kmr, which is $sid^+$ and whose genome size supposed to be 28.5 kb long in the case of being packaged into $P2_{sir3}$-sized large head. As P4 delRI::kmr showed the low EOP with P2 sir3 lysogen, P4 delRI::kmr phage stock was prepared in P2 sir3 lysogen host to increase the EOP with P2 sir3 lysogen. Through this process, P4 delRI::kmr had been adapted for P2 sir3 lysogen. With a CsCl buoyant equilibrium density gradient experiment and gel electrophoresis of the isolated DNA, it was evident that the adaptation of P4 delRI::kmr for P2 sir3 lysogen was caused by the conformational change of DNA to be packaged into large head. The burst size determination experiments with P4 delRI::kmr phage stock adapted for P2 sir3 lysogen and normal P4 delRI::kmr phage stock showed that not the sid mutation but the size of DNA to be packaged (28-29 kb long) was essential to overcome "P2 sir-associated helper inefficiency".

Spreading-dependent or independent Sir2-mediated gene silencing in budding yeast

Yeom Soojin,Oh Junsoo,Lee Jung-Shin 한국유전학회 2022 Genes & Genomics Vol.44 No.3

Background: In the budding yeast Saccharomyces cerevisiae, a silent chromatin structure is formed at three distinct loci, including telomeres, rDNA, and mating-type loci, which silence the expression of genes within their structures. Sir2 is the only common factor, regulating the three silent chromatin regions. S. cerevisiae has 32 telomeres, but studies on gene silencing in budding yeast have been performed using some reporter genes, artificially inserted in the telomeric regions. Therefore, insights into the global landscape of Sir-dependent silencing of genes within the silent chromatin regions are required. Objective: This study aimed to obtain global insights into Sir2-dependent gene silencing on all silent chromatin regions in budding yeast. Methods: RNA-sequencing was performed to identify genes that are silenced by Sir2. By comparing with the chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-seq) of Sir2 in the wild-type strain, we confirmed Sir2-regulated genes. Results: Using Sir2 ChIP-seq data, we identified that the Sir2 binding domain length caused by Sir2 spreading from the chromosomal end is different in each telomere in budding yeast. Expression of most subtelomeric genes increased in the ∆sir2 strain. Some Sir2-regulated subtelomeric genes were positioned within the telomeric Sir2-binding domain, while the others were outside the Sir2-binding domain. In addition, Sir2 was bound to the mating-type loci and rDNA region, and gene expression increased in the ∆sir2 strain. Conclusion: We concluded that S. cerevisiae has two modes of Sir2-mediated gene silencing: one is dependent on chromatin binding and spreading of Sir2, and the other is independent of spreading of Sir2.

얼굴 없는 사내와 죽음의 극복

황현산 한국비교문학회 2012 比較文學 Vol.0 No.57

Dans sa Chanson du mal-aimé, Apollinaire affirme savoir “des chansons pour les sirènes”. La question qui se pose alors est de savoir ce que signifie cette simple affirmation ; en effet, s’agit-il de chansons ayant pour sujet les sirènes, de chansons destinées à ê̂tre chantées par les sirènes ou encore de chansons pour rivaliser avec le chant des sirènes. La réponse à cette interrogation se trouve peut-ê̂tre dans un autre poème d’Apollinaire, le de Saint dans lequel il évoque un “homme sans yeux ni nez ni oreille”. Et tout comme les sirènes attirent par leur chant les hommes dans leurs bras mortels, cet homme sans visage attire les femmes en un lieu inconnu. Ces deux images qui se ressemblent et s’opposent nous parle de l’attitude d’Apollinaire devant l’acte poétique et le statut du poète. Une comparaison avec un poème de Gautier nous apprend que ce thème des sirènes et de l’errance du poète a rapport avec la mémoire et la mort. Si bien que dans un autre poème dans lequel il évoque les sirènes, Lul de Phaltenin, Apollinaire s’adresse directement aux sirènes, disant qu’il est venu “rampé vers leurs grottes”. Autrement dit, le poète choisit la mort, une mort qui était “heureuse” chez Gautier puisqu’elle s’opposait à la vie impuissante, mais cette attirance vers la mort, chez Apollinaire, s’identifie à l’élan poétique, mais qui n’a rien d’‘heureux’. Dans sa Chanson du mal-aimé, Apollinaire affirme savoir “des chansons pour les sirènes”. La question qui se pose alors est de savoir ce que signifie cette simple affirmation ; en effet, s’agit-il de chansons ayant pour sujet les sirènes, de chansons destinées à ê̂tre chantées par les sirènes ou encore de chansons pour rivaliser avec le chant des sirènes. La réponse à cette interrogation se trouve peut-ê̂tre dans un autre poème d’Apollinaire, le de Saint dans lequel il évoque un “homme sans yeux ni nez ni oreille”. Et tout comme les sirènes attirent par leur chant les hommes dans leurs bras mortels, cet homme sans visage attire les femmes en un lieu inconnu. Ces deux images qui se ressemblent et s’opposent nous parle de l’attitude d’Apollinaire devant l’acte poétique et le statut du poète. Une comparaison avec un poème de Gautier nous apprend que ce thème des sirènes et de l’errance du poète a rapport avec la mémoire et la mort. Si bien que dans un autre poème dans lequel il évoque les sirènes, Lul de Phaltenin, Apollinaire s’adresse directement aux sirènes, disant qu’il est venu “rampé vers leurs grottes”. Autrement dit, le poète choisit la mort, une mort qui était “heureuse” chez Gautier puisqu’elle s’opposait à la vie impuissante, mais cette attirance vers la mort, chez Apollinaire, s’identifie à l’élan poétique, mais qui n’a rien d’‘heureux’.

포크 형태의 개방형 스터브 및 SIR 구조를 이용한 이중대역 대역통과 여파기의 설계

이태현 한국ITS학회 2023 한국ITS학회논문지 Vol.22 No.1

This paper proposes a design of a dual-band band-pass filter that integrates a λg/2 open SIR structure, a transmission line, and a fork-type structure with symmetric and asymmetric open stubs. To obtain the dual-band effect, the proposed filter uses the SIR structure and adjusts the impedance ratio of the SIR structure. Therefore, the position of the harmonics of the filter is shifted through the adjustment of the impedance ratio, and this can obtain a double-band effect. In order to obtain the dual-band characteristics, the dual-band effect is obtained by inserting a open stub between the SIR structures with the SIR structure divided in half. In addition, the second frequency response is obtained by adjusting the length of the open symmetrical stub in the fork-shaped structure. The asymmetrical open stub in the fork form achieves optimum bandwidth by adjusting the length. Therefore, the first center frequency of the proposed band-pass filter is 5.896 GHz and the bandwidth is 13.6 %. At this time, the measurement results are 0.13 dB and 33.6 dB. The second center frequency is 5.906 GHz and the bandwidth is 13.6 %. At this time, the measurement results are 0.15 dB and 19.8 dB. The reason is that when the impedance ratio (Δ) is higher than 1, the position of the harmonic is shifted to a lower frequency band. However, if the impedance ratio (Δ) is lowered by one step, the position of harmonics will move to a higher frequency band. The function of the filter designed using these characteristics can be obtained from the measurement result. The proposed band-pass filter has no coupling loss and no via energy concentration loss because there is no coupling structure of input/output and no via hole. Therefore, system integration is possible due to its excellent performance, and it is expected that dedicated short-range communication (DSRC) system applications used in traffic communication systems will be possible. 본 논문은 λg/2 개방형 SIR 구조와 전송선로와 대칭 및 비대칭 개방형 스터브를 가진 포크- 형태의 구조를 일체화한 이중대역 대역통과 여파가 설계에 대해 제안을 한다. 이중대역 효과를 얻기 위해, 제안된 여파기는 SIR 구조를 이용했고, SIR 구조의 임피던스 비율을 조절한다. 그러므로 여파기의 고조파는 임피던스 비율의 조절을 통해 위치가 이동하게 되며 이는 이중대역 효과를 얻을 수 있다. 이중대역 특성을 얻기 위해 SIR 구조를 반으로 나눈 상태에서 SIR 구조 사이에 개방형 스터브를 삽입하여 이중대역 효과를 얻는다. 또한 포크 형태의 구조에서개방형 대칭 스터브의 길이를 조절함으로써 두 번째 주파수 응답을 얻는다. 포크 형태에서 비대칭 개방형 스터브는 길이의 조절을 통해 최적의 대역폭을 얻는다. 그러므로 제안된 대역통과 여파기의 첫 번째 중심 주파수는 5.896 GHz이며 대역폭은 13.6 % 이다. 이때, 측정 결과는0.13 dB 및 33.6 dB이다. 두 번째 중심 주파수는 5.906 GHz이며 대역폭은 13.6 % 이다. 이때, 측정 결과는 0.15 dB 및 19.8 dB이다. 그 이유는 임피던스 비율(Δ)이 1보다 높으면 고조파의위치는 낮은 주파수 대역으로 이동하게 된다. 그러나 임피던스 비율(Δ)이 1보 낮아지게 된다면고조파의 위치는 높은 주파수 대역으로 이동하게 될 것이다. 이러한 특징을 이용하여 설계된여파기의 기능은 측정 결과에서 얻을 수 있다. 제안한 대역통과 여파기는 입출력의 결합구조와 비아 홀이 없기 때문에 결합손실과 비아 에너지 집중 손실이 없다. 그러므로 성능이 우수하여 시스템 집적화가 가능하며 교통통신 시스템에서 활용되는 DSRC (dedicated short-range communication) 시스템 응용이 가능할 것으로 기대된다.

WCDMA 단말 모뎀을 위한 개선된 SIR 측정 알고리즘 설계

한정수,도주현,최형진,Han, Jung-Su,Doo, Joo-Hyun,Choi, Hyung-Jin 한국통신학회 2005 韓國通信學會論文誌 Vol.30 No.2a

본 논문에서는 WCDMA(Wideband Code Division Multiple Access) 단말 모뎀을 위한 개선된 SIR 측정 알고리즘을 제안한다. 제안된 알고리즘은 속도 적응형 IIR 타입의 channel estimator를 적용함으로써 DPCH(Dedicated Physical Channel)의 채널 보상으로 인한 처리 지연을 최소화하였으며, 파일럿 채널인 CPICH(Common Pilot Channel)를 사용하여 페이딩 채널 환경에서 발생하는 신호 전력 감쇄를 보상함으로써 페이딩 환경에서 SIR 측정시 발생하는 SIR 측정 오차를 대폭 감소시켰다. 또한 fading의 변화를 적절히 반영할 수 있도록 IIR 필터를 신호 전력 및 간섭 전력 측정 시에 추가함으로써 SIR 측정에 대한 안정도를 향상시켰다. 제안된 알고리즘과 기존의 SIR 측정 알고리즘과의 성능 비교를 통하여 무선 이동 채널, 특히 고속 이동체 환경에서 제안된 알고리즘의 측정된 SIR의 mean은 최대 약 8dB, jitter는 약 2dB의 향상된 우수한 성능을 보임을 입증하였다. In this paper, we propose an enhanced SIR measurement algorithm for WCDMA mobile station modem. The proposed algorithm minimizes processing delay by applying velocity estimation-based channel estimator with IIR filter and reduces measured SIR offset by compensating attenuated signal power by using pilot channel(CPICH) in fading channel environment. To improve stability of SIR measurement, we also adopt an IIR filter which can properly reflect variation of fading channel in signal and interference power measurement. We prove that the proposed algorithm outperforms conventional SIR measurement algorithm in mean and jitter of measured SIR. Computer simulation shows that performance results using the proposed algorithm have improvement of approximately 8dB for measured mean and 2dB for measured jitter in the wireless mobile channel, especially in fast mobile speed environment.

SIR 알고리즘을 이용한 홍수량 빈도해석에 관한 연구

문기호,경민수,김덕길,곽재원,김형수 한국습지학회 2008 한국습지학회지 Vol.10 No.3

일반적으로 빈도해석을 진행할 경우 자료는 정상성을 가정하고 분석하게 된다. 그러나 최근 들어 기후변화 등의 원인으로 인하여 강우나 유출량이 변화하고 있어 변화하는 강우나 유출량을 고려해서 빈도해석을 해야 한다는 주장이 제기되고 있다. 이에 본 연구에서는 Bootstrap을 기반으로 개발된 SIR 알고리즘을 이용하여 홍수빈도해석을 수행하기위한 방안을 제시하였다. SIR 알고리즘은 우도함수를 고려하여 자료를 재추출하기 위해서 사용되어 왔으며, 본 연구에서도 최근에 변화하는 홍수량의 변화 양상을 고려하여 홍수량 자료를 재추출하기 위해서 적용되었다. 증가된 홍수 특성을 고려하여 재추출된 홍수량자료는 매개변수적 빈도해석을 함으로써 지속시간별 홍수량을 산정하였으며, 산정된 빈도별 홍수량들을 Bootstrap을 이용해서 재추출한 자료를 이용한 빈도해석 결과와 원자료를 이용하여 분석한 빈도해석 결과를 비교하였다. 비교결과 SIR알고리즘을 이용해서 빈도해석을 진행한 경우의 빈도별 홍수량이 가장 크게 나타났다. 따라서 홍수빈도해석시 현재까지의 변화하는 홍수량 패턴을 고려할 경우, 확률홍수량이 증가하는 것을 확인하였다. Generally, stationary is considered as a basic assumption in frequency analysis. However, rainfall and flood discharge are changing due to the climate change and climate variability. Therefore, there is a new opinion that changing pattern of rainfall and flood discharge must be considered in frequency analysis. This study suggests the flood frequency analysis methodology using SIR algorithm which was developed from bootstrap could be used for considering climate change. Than is, SIR algorithm is selected for resampling method considering changing pattern of flood discharge and it has been used for resampling method with likelihood function. Resampled flood discharge data considering the increase of flood discharge pattern are used for parametric flood frequency analysis and this results are compared with frequency analysis results by Bootstrap and original observations. As the results, SIR algorithm shows the greatest flood discharge than other methods in all frequencies and this may reflect the increasing pattern of flood discharge due to the climate change and climate variability.

형사책임능력 감정척도 SIRS-2의 도입을 위한 예비 연구 - 대학생 집단을 대상으로 -

이지연,이수정 한국보호관찰학회 2016 보호관찰 Vol.16 No.2

옳고 그름의 본질을 가릴 수 없거나 행동을 통제할 수 없는 경우의 범죄 행위는 정신장애에 기인한 것으로 보고 책임을 묻지 않는 것이 원칙이다. 우리나라에서는 이들 범법 정신장애인의 건강권을 보장하고 안정적인 사회 복귀를 돕기 위해 2016년 12월에 치료감호제도 시행을 앞두고 있다. 한편 범죄 행위에 대한 처벌을 회피하고 일종의 치료적 혜택을 편취하기 위해 정신장애를 가장하는 자들을 사병을 시도하는 자(Malingerer)라고 지칭하는데, 사병의 유병률은 정신감정 사례 중 최소 20% 이상을 유지하고 있는 것으로 보고되고 있다. 따라서 본 논문에서는 치료감호법을 악용하려는 시도가 보다 늘어날 것으로 추정하고 이에 대비하기 위해 사병을 평가하는 전문화된 검사 도구인 SIRS-2를 국내에 도입하기 위한 타당도 연구를 진행하였다. 모사 설계에서는 대학생 106명을 대상으로 하여 실험 상황에서 검사 도구의 진단 효과성을 규명하고자 하였다. 연구 결과, 솔직한 답변을 요청한 통제 집단과 조현병 증상을 가장하도록 요청한 사병 집단 간 SIRS-2의 진단 결과에서 유의미한 차이가 발생하였다. 또한 SIRS-2 하위 척도 점수들의 평균 점수를 산출하고 집단 간 차이를 분석한 결과 모든 척도 점수에서 사병 집단의 평균이 월등히 높은 것으로 나타났다. 이러한 결과는 SIRS-2가 증상을 가장하려는 시도를 정확하게 감별하는 기능이 뛰어나다는 것을 의미한다. 마지막으로 본 연구의 의의와 한계점을 기술하였다. In the principle of criminal justice, mentally disordered offenders who can not distinguish the essence of right and wrong or control one’s own behavior have no criminal responsibility. To guarantee their health rights and help adapting to the community, Mental Health Treatment Order was legislated and are in the process of implementing in December 2016. The problem is how to accurately detect the malingerers who fake the mental disorder, avoid criminal responsibility and even snatch away the therapeutic benefits. Even though the prevalence of malingering is maintained at least 20% of criminal cases, it is estimated that there will be more attempts to abuse the Mental Health Treatment Order. Therefore, the purpose of present study was to examine the applicability of the Korean version of SIRS-2. The 106 college students was randomly assigned to the control-genuine group or malingering group and their SIRS-2 data was used to analyze the internal validity. The results of the study showed that there was significant difference both in the SIRS-2 diagnosis and subscale scores between the control-genuine group and the malingering group. These results indicate that SIRS-2 has an excellent function to accurately distinguish the feigned symptoms. Finally, the implications and limitations of this study were discussed for the future research.

미사용 OVSF 부호를 이용한 WCDMA 역방향 링크 수신기의 SIR 기반 전력제어 성능 분석

이영용,박수진,안재민,임민중,정성현,최형진 대한전자공학회 2003 電子工學會論文誌-TC (Telecommunications) Vol.40 No.7

본 논문에서는 폐루프 고속 전력 제어를 수행하여 WCDMA(Wideband Code Division Multiple Access) 역방향 링크 수신기 시스템의 성능을 분석하였다. 고속 전력 제어를 수행하기 위해서는 기지국에서 SIR(Signal to Interference power Ratio)이 정확히 측정되어야 한다. 이를 위해 본 논문에서는 간단한 구조를 갖는 SIR 측정 알고리즘을 제안하였다. 제안한 구조는 미사용 OVSF(Orthogonal Variable Spreading Factor) 부호를 이용하여 간섭 전력을 측정하는 새로운 방식이다. 본 논문에서 제안된 SIR 측정 알고리즘과 참고 문헌 [1]에 제시된 기존외 SIR 측정 알고리즘을 폐루프 고속 전력 제어에 적용하여 성능을 비교하였다. 동기 데이터 복조를 수행하기 위한 채널 추정 알고리즘으로는 Κ=2인 WMSA (Weighted Multi-Slot Averaging) 채밀 추정 필터를 적용하였다. 모의 실험 결과를 통해 제안한 SIR 측정 방식이 평균 BER 10/sup -3/관점에서 수신 Ε/sub b//Ι/sub 0/를 최대 0.9㏈ 감소시킬 수 있으며 다중 경로 수가 증가할수록 그리고 페이딩 속도가 더 빨라질수록 성능 차이는 더욱 커진다는 것을 제시하였다. In this paper, we evaluate the performance of WCDMA reverse link receiver system with closed loop fast transmit power control (TPC). For fast power control, SIR must be measured precisely. We propose a new SIR measurement algorithm having a simple structure. The proposed algorithm uses unused OVSF code for interference power evaluation. The proposed SIR measurement algorithm is compared to the conventional SIR measurement algorithm in Ref.$^{[1]}$ under closed loop fast TPC. We adopted WMSA channel estimation filter with Κ=2 for mobile radio channel estimation and considered one slot TPC delay. Extensive computer simulation results show that the proposed algorithm using unused OVSF code reduces the required Ε$_{b}$ /Ι$_{0}$ at the BER of 10$^{-3}$ up to 0.9㏈ and has an improved TPC error performance compared to the conventional algorithm.