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바이오제닉아민 분해 유전자 보유 Bacillus 균주 선발 및 특성
허소정 ( Sojeong Heo ),정근철 ( Keuncheol Jeong ),이현동 ( Hyundong Lee ),정도원 ( Do-won Jeong ),이종훈 ( Jong-hoon Lee ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2017 한국미생물·생명공학회지 Vol.45 No.2
메주와 된장에서 분리한 Bacillus 속 126균주를 대상으로 amine oxidase 활성을 나타낸 10균주를 분리하였다. 그 중, B. licheniformis 8MI05와 8MS03 균주는 동일한 염기서열을 가진 amine oxidase 유전자(yobN)를 보유하고 있었다. 공개된 B. licheniformis 유전체 정보를 대상으로 yobN 유전자의 보유를 검색한 결과, yobN 유전자 보유는 균주 특이적인 특성으로 확인되었다. 두 균주 모두 4종류 바이오제닉아민(cadaverine, histamine, putrescine, tyramine) 분해 활성을 나타냈고, yobN 유전자를 보유한 재조합균주에서도 바이오제닉아민 분해 활성이 확인되었다. Amine oxidase 유전자보유 균주들은 14% NaCl 농도에서 생육 가능하였고, 균주특이적인 protease 및 lipase 활성을 나타내었다. Ten Bacillus strains possessing amine oxidase activity were selected from 126 Bacillus isolates from meju and doenjang (two traditional Korean soybean foods). Among the isolates, two B. licheniformis strains (8MI05 and 8MS03) harbored the amine oxidase gene yobN. By conducting a gene search against published B. licheniformis genomes, the possession of yobN was proved to be a strain-specific property. Both strains degraded four types of biogenic amines (cadaverine, histamine, putrescine, and tyramine) supplemented in tryptic soy broth during their culture. A recombinant harboring yobN also degraded the four types of bio-genic amines during cultivation. Both Bacillus strains could grow at a NaCl concentration of 14% and exhibited strain-specific protease and lipase activities.
허소정,이종훈,정도원,Heo, Sojeong,Lee, Jong-Hoon,Jeong, Do-Won The Microbiological Society of Korea 2019 미생물학회지 Vol.55 No.3
메주로부터 분리한 Enterococcus faecalis DM01 균주는 8종의 항생제(ampicillin, chloramphenicol, ciprofloxacin, erythromycin, gentamicin, penicillin G, tetracycline, vancomycin) 저항성, 바이오필름 및 용혈현상을 나타내지 않았다. GC 함량 37.68%, 2,785,968 bp 크기의 단일 chromosome을 보유하고 있는 DM01 균주의 유전체 정보는 콩발효식품 제조용 종균 적용에 요구되는 항생물질 저항성, 바이오필름 및 용혈현상 관련의 안전성을 뒷받침하는 것으로 확인되었다. Enterococcus faecalis strain DM01 was isolated from meju, a traditional Korean fermented soybean product. The strain did not exhibit resistance to eight antibiotics (ampicillin, chloramphenicol, ciprofloxacin, erythromycin, gentamicin, penicillin G, tetracycline, and vancomycin), biofilm formation, and hemolytic activity. The genome of strain DM01 consists a single circular 2,785,968-bp chromosome with a G + C content of 37.68%. The complete genomic sequence of strain DM01 provides genetic information to support the absence of antibiotic resistance, biofilm formation, and hemolytic activity.
정도원,이병훈,허소정,장미현,이종훈,Jeong, Do-Won,Lee, Byunghoon,Heo, Sojeong,Jang, Mihyun,Lee, Jong-Hoon The Microbiological Society of Korea 2018 미생물학회지 Vol.54 No.4
된장으로부터 콩발효 종균후보 Bacillus licheniformis 0DA23-1가 분리되었다. 0DA23-1 균주는 GC 함량 45.96%, 약 4.4 Mb 크기의 단일 chromosome을 보유하고 있었고, 식중독균 Bacillus cereus 및 Staphylococcus aureus가 보유한 위해성 유전자는 유전체로부터 확인되지 않았다. 또한, 8종의 항생물질(chloramphenicol, clindamycin, erythromycin, gentamicin, kanamycin, streptomycin, tetracycline, vancomycin) 저항성 및 혈청분해 활성, 바이오필름 생성 관련 유전자도 확인되지 않았다. Bacillus licheniformis strain 0DA23-1, a potential fermentation starter candidate, was isolated from doenjang, a Korean high-salt-fermented soybean food. Strain 0DA23-1 contains a single circular 4,405,373-bp chromosome with a G + C content of 45.96%. The complete genome of strain 0DA23-1 does not include any of the virulence factors found in the well-known pathogens Bacillus cereus and Staphylococcus aureus. Additionally, no genes associated with resistance to eight antibiotics (chloramphenicol, clindamycin, erythromycin, gentamicin, kanamycin, streptomycin, tetracycline, and vancomycin), hemolysis, or biofilm formation were identified.
Pyrosequencing을 이용한 메주, 천일염, 된장의 곰팡이 군집 분석
이림기 ( Limgi Lee ),허소정 ( Sojeong Heo ),정도원 ( Do-won Jeong ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2019 한국미생물·생명공학회지 Vol.47 No.3
메주를 염수에 침지하여 된장을 만드는 과정 동안 진균의 군집 변화와 재료가 된 메주와 천일염의 균총 천이를 확인하고자 진균의 ITS (internal transcribed spacer) 유전자 서열을 기반으로 하는 pyrosequencing을 통해 미생물 군집을 확인하였다. 된장의 주요 원료인 메주는 Botrytis spp. (57.94%)와 Dothiorella samentorum (24.08%)가 우점종으로 확인되었다. 천일염은 확인되지 않은 종들이(70.13%) 검출되었고, 그 외 종들은 적은 비율로 다양하게 검출되었다. 된장은 진균 중 곰팡이가 아닌 효모인 Candida versatilis (92.62%)가 가장 높은 우점진균으로 확인되었다. 메주의 저염은 곰팡이 생육이 용이 했고, 천일염은 고세균 또는 호염진균, 된장은 고염 효모의 생존에 용이했던 것으로 판단된다. 메주와 천일염의 우점진균이 된장의 균총에 직접적인 영향을 미치지 못하는 것으로 판단된다. In order to evaluate the migration of fungi into doenjang from its materials, meju and solar salt, microbial communities were analyzed using pyrosequencing. Dominant fungi of meju were Botrytis spp. (57.94%) and Dothiorella samentorum (24.08%). Unidentified fungal species (37.53%), unassigned species (32.60%) and several fungal species of small portion were identified in solar salt. In doenjang, Candida versatilis were predominantly detected (92.62%). Non-halophilic mold were dominantly identified from meju (low-salt fermented soybean), while halophilic bacteria and archaea for solar salt and salt-tolerance fungi such as C. versatilis for doenjang (high-salt fermented soybean) were frequently detected. These results implied that most predominant fungal species might not be migrated from meju and/or solar salt into doenjang.