Adipogenesis related to energy consumption in DNAJC6- transfected 3T3-L1 cells

Dajeong Son,Suyeon Lee,Chanuk Heo,Myoungsook Lee 한국식품영양과학회 2021 한국식품영양과학회 학술대회발표집 Vol.2021 No.10

Resting metabolic rate accounts for 60-70% of total daily energy expenditure, is essential for establishing strategies for obesity prevention. In a previous GWAS obesity study, we found that the DNAJC6 gene was related to energy metabolism. Compared between DNAJC6-overexpressed 3T3-L1 cells (TgHsp), and the control (3T3-L1), we identified what mechanisms are involved, such as lipid metabolism, inflammatory cytokines, insulin resistance, and mitochondrial dysfunction. The adipogenesis (PPARγ, C/EBP α, aP2) and adipokines (leptin, adiponectin, leptin receptor) were significantly depressed in TgHsp cells complared to the control. The proteins involved in the insulin signals (IRS, AKT, GLUT4) were depressed in TgHsp cells, compared to the control. O₂ consumption, ATP production, and UCP1 in mitochondria were decreased in TgHsp cells. We found that the DNAJC6 gene was positively involved in inhibiting adipogenesis with the possibility of dysfunction of ATP production and insulin resistance. We elucidated the DNAJC6"s effect on energy consumption to prevent obesity. [Funds: The National Research Foundation of Korea grant funded by the Korea Government (MSIP; 2019R1A2C1008434)]

Effect of MAP2K6 Gene Overexpression on Obesity in C57BL/6 Mice

Suyeon Lee,Dajeong Son,Myoungsook Lee 한국식품영양과학회 2020 한국식품영양과학회 학술대회발표집 Vol.2020 No.10

Various expression patterns of pregnancy-associated plasma protein-A

Jeon, Eunjeong,Lee, Jihwan,Son, Junkyu,Kim, Doosan,Lim, Dajeong,Han, Man-Hye,Hwang, Seongsoo The Korean Society of Animal Reproduction and Biot 2022 한국동물생명공학회지 Vol.37 No.3

Pregnancy-associated plasma protein-A (PAPP-A) is known as an important biomarker for fetal abnormality during first trimester and has a pivotal role in follicle development and corpus luteum formation. And also, it is being revealed that an expression of PAPP-A in various cells and tissues such as cancer and lesion area. PAPP-A is the major IGF binding protein-4 (IGFBP-4) protease. Cleavage of IGFBP-4 results in loss of binding affinity for IGF, causing increased IGF bioavailability for proliferation, survival, and migration. Additionally, PAPP-A can be used as a promising therapeutic target for healthy longevity. Despite growing interest, almost nothing is known about how PAPP-A expression is regulated in any tissue. This review will focus on what is currently known about the zinc metalloproteinase, PAPP-A, and its role in cells and tissues. PAPP-A is expressed in proliferating cells such as fetus in uterus, granulosa cells in follicle, dermis in wound, cancer cells, and Sertoli cells in testis. They have common characteristics of proliferation faster than normal cells with stimulating IGFs action and inhibiting IGFBPs. The PAPP-A functions and expression studies in livestock have not yet been conducted much. Further studies are needed to use PAPP-A as a marker for healthy longevity in animal science.

Minimac3와 Beagle 프로그램을 이용한 한우 770K chip 데이터에서 차세대 염기서열분석 데이터로의 결측치 대치의 정확도 분석

안나래(Na-Rae An),손주환(Ju-Hwan Son),박종은(Jong-Eun Park),채한화(Han-Ha Chai),장길원(Gul-Won Jang),임다정(Dajeong Lim) 한국생명과학회 2018 생명과학회지 Vol.28 No.11

DNA 염기서열의 발전과 많은 단일염기서열변이 정보(Single Nucleotide polymorphism, SNP)의 발굴은 유전분석을 가능하게 만들었다. 단일염기서열변이 정보가 사람의 유전체뿐만 아니라 가축의 유전체에서도 이용할 수 있게 됨에 따라서 SNP 칩 마커를 통해 유전자형의 분석이 가능하게 되었다. 여러 유전자형 대치프로그램 중에서도 Minimac3 소프트웨어는 비교적 정확성이 높고, 계산의 효율성을 위해 분석을 단순화하여 유전자형의 결측치 대치 분석 시간을 단축시킨다. 따라서 본 연구에서는 Minimac3 프로그램을 사용하여 한우 1,226두 770K SNP 칩데이터와 311두 차세대 염기서열분석 데이터를 이용하여 유전자형 결측치 대치를 실행해 보았다. 그 결과 염색체별 정확도는 약 94~96%의 정확도를 나타냈으며, 개체별 정확도는 약 92~98%의 정확도를 나타냈다. 유전자형의 결측치 대치의 완료 후, R Square (R²) 값이 0.4 이상인 SNP는 총 SNP의 약 91%였다. R2 값이 0.6 이상인 SNP는 84%였으며, R² 값이 0.8 이상인 SNP는 70%였다. 대립유전자형빈도 차이를 기준으로 (0, 0.025), (0.025, 0.05), (0.05, 0.1), (0.1, 0.2), (0.2, 0.3), (0.3, 0.4), (0.4, 0.5)의 7구간에 해당하는 R2 값은 64~88%였다. 결측치 대치의 총 분석 시간은 약 12시간이 걸렸다. 추후의 유전체 데이터 세트의 크기와 복잡성이 증가하는 SNP 칩 연구에서 Minimac3를 사용한 유전체 결측치 대치법은 한우의 판별에 있어서 칩 데이터의 신뢰도를 향상 시킬 수 있을 것으로 본다. Whole genome analysis have been made possible with the development of DNA sequencing technologies and discovery of many single nucleotide polymorphisms (SNPs). Large number of SNP can be analyzed with SNP chips, since SNPs of human as well as livestock genomes are available. Among the various missing nucleotide imputation programs, Minimac3 software is suggested to be highly accurate, with a simplified workflow and relatively fast. In the present study, we used Minimac3 program to perform genomic missing value substitution 1,226 animals 770K SNP chip and imputing missing SNPs with next generation sequencing data from 311 animals. The accuracy on each chromosome was about 94~96%, and individual sample accuracy was about 92~98%. After imputation of the genotypes, SNPs with R Square (R²) values for three conditions were 0.4, 0.6, and 0.8 and the percentage of SNPs were 91%, 84%, and 70% respectively. The differences in the Minor Allele Frequency gave R2 values corresponding to seven intervals (0, 0.025), (0.025, 0.05), (0.05, 0.1), (0.1, 0.2), (0.2, 0.3). (0.3, 0.4) and (0.4, 0.5) of 64~88%. The total analysis time was about 12 hr. In future SNP chip studies, as the size and complexity of the genomic datasets increase, we expect that genomic imputation using Minimac3 can improve the reliability of chip data for Hanwoo discrimination.

Biological control of entomopathogenic nematode Heterorhabditis megidis (Rhabditida: Heterorhabditidae) GJ1-2 from Korea

Namjun Chung,Youngjoon Kim,Geungon Kim,Dajeong Son,Youngmoo Choo,GilSang Jeong 한국응용곤충학회 2024 한국응용곤충학회 학술대회논문집 Vol.2024 No.04

곤충병원성 선충인 Heterorhabditis. megidis(큰형광병원선충)는 참나무 군락지(광주광역시 소재) 사양토에 서 분리 동정되었고, 곤충병원성을 가지는 공생세균은 Photorhabdus temperata로 분리 동정되어 각각 GJ1-2로 명명하였다. H. megidis GJ1-2는 고구마(주황미) 큰 검정풍뎅이 Holotrichia parallela에 대한 방제 효과는 평택시 (경기도 소재)와 논산시(충청북도 소재)의 노지 재배 사양토에서 관주처리 30일 후 각가 81.1%, 78.9%로 나타났 으며, 인삼(재래종) 거세미나방 Agrotis segetum에 대한 방제 효과는 이천시(경기도 소재)와 청주시(충청북도 소재)의 비가림 재배(차광막 설치) 사양토에서 관주처리 14일 후 방제가는 각각 79.9%, 80,2%로 나타났다. H. megidis GJ1-2는 고구마(주황미)와 인삼(재래종)에서 약제 처리 후 3, 7, 14일 후 외관상 약해는 나타나지 않았다.

Characteristics of entomopathogenic nematode Heterorhabditis megidis (Rhabditida: Heterorhabditidae) GJ1-2 from Korea

Namjun Chung,Youngjoon Kim,Geungon Kim,Dajeong Son,Youngmoo Choo,GilSang Jeong 한국응용곤충학회 2023 한국응용곤충학회 학술대회논문집 Vol.2023 No.10

곤충병원성 선충인 Heterorhabditis. megidis(큰형광병원선충)는 참나무 군락지(광주광역시 소재) 사양토에 서 분리 동정되었고, 곤충병원성을 가지는 공생세균은 Photorhabdus temperata로 분리 동정되어 각각 GJ1-2로 명명하였다. H. megidis GJ1-2는 고추(녹광), 애호박(농우), 오이(백다다기), 참외(금싸라기), 토마토(베타티니) 유묘기 경엽처리와 배추(씨알천하일품), 상추(진청맛), 완두(청진주), 수박(삼복꿀), 무(서호) 유묘기 관주처리 에서 21일차까지 기준량과 배량에 대하여 약해(약해 판정기준결과: 0)가 나타나지 않았다, H. megidis GJ1-2는 배추 파밤나방에 대한 방제 효과는 이천시(경기도 소재)와 수원시(경기도 소재)의 시설재배 포장에서 각각 경엽 처리 3일차 71.8%. 73.9%, 7일차 86.2%, 84.6%로 나타났으며, 옥수수 열대거세미나방에 대한 방제 효과는 제주시 (제주특별자치도 소재)의 노지(미사질 양토)에서 경엽처리 7일차 82.6%로 나타났다. 그리고 H. megidis GJ1-2는 랫드를 이용한 급성경구와 급성경피 독성시험 반수치사농도(LD50) 값은 2,000 mg/kg B.W 초과로 IV급(저독성) 으로 구분되었고, 토끼를 이용한 피부와 안점막에 자극성이 없는 것으로 구분되었다. 그리고 담수어류(송사리) 에 대한 급성독성시험 반수치사농도(LD50) 값은 영향을 미치지 않는 기초시험농도 100 mg/L를 초과하였다.

A study on entomopathogenic nematode symbiotic bacteria in Korea

Namjun Chung,Seongmo Koo,Youngjoon Kim,Geungon Kim,Dajeong Son,Youngmoo Choo,Yeojin Kim,Gilsang Jeong 한국응용곤충학회 2022 한국응용곤충학회 학술대회논문집 Vol.2022 No.10

에피소드 요소와 직무 몰입의 이론적 관계와 에피소드 요소 탐색을 통한 구조적인 개념적 통합 모형

최순리(Soonri Choi),최서현(Seohyun Choi),손채현(Chaehyeon Son),김다정(Dajeong Kim),송지훈(Jihoon Song) 한국기업교육학회 2021 기업교육과인재연구 Vol.23 No.3

본 연구의 연구1은 에피소드 요인, 번성, 가변적 직무 몰입, 안정적 직무 몰입의 이론적 관계를 밝히고, 연구2는 에피소드 요소들을 탐색하여 구조적인 개념적 통합 모형을 구성함으로써 개인이 직무 몰입 상태에 이끌어지는 총체적인 구조를 밝히는 데 그 목적이 있다. 에피소드는 선행연구에서 밝히고 있는 JD-R 요인들과 최근 코로나19로 인해 업무 환경이 가정으로 확대됨에 따라 가정 자원 요인을 포함하였다. 문헌 분석은 2019년 1월부터 2021년 4월 15일까지 국외에서 연구된 논문 268편을 확인하였다. 연구1의 결과로 에피소드 요인, 번성, 가변적 직무 몰입, 안정적 직무 몰입의 이론적 관계는 직무-요구 자원이론(Job and demand-resource theory), 확장-형성 이론(Broaden-build theory), 인지평가이론(Cognitive evaluation theory)으로 관계를 확인했고, 연구2의 결과로 에피소드 요소 탐색은 1차 인지와 정서의 요인으로 분류하고, 2차 정신적 업무 중심 내부와 외부, 심리적 자기중심 내부와 외부로 분류하였다. 결론적으로 연구1의 이론적 모형과 연구2 에피소드 요소 탐색의 구조적인 개념적 통합 모형을 제시하여 일상생활과 업무 상황에 따라 나타나는 인지와 정서의 요인간의 관계를 확인하였다. 이러한 결과를 통해 확장된 업무 환경 확장에서 직무 몰입 상태에 도달할 수 있도록 하는 에피소드 요인과 요소의 개념적 영향 관계와 직무 몰입의 실증 연구를 위한 이론적 기반을 제시했다. The aim of this study 1 is to identify theoretical relationships among episodic resources, thriving, variable work engagement, and stable work engagement, and the study 2 has its aim to explore the episodic resources and to construct a conceptual integration model to find structure in which individuals are driven to work engagement. ‘Episodes’ included job demands and job resources identified in previous research and home resources as the work environment expanded to home due to COVID-19. The literature review identified 268 articles published overseas from January, 2019 to April 15th, 2021. As a result of study 1, the theoretical relationships of episodic resources, thriving, variable work engagement and stable work engagement were identified based on Job demand-resource theory (JD-R theory), Broaden-build theory, and Cognitive evaluation theory. As a result of study 2, episodic resources were primarily classified as cognitive and emotional factors, and reclassified as cognitive task-oriented internal and external factors, emotional egocentric internal and external factors. To sum up, this study identified how cognitive and emotional factors are related within daily life and work situation through integrated conceptual model. These findings provide theoretical foundation for the empirical study of the episodic resources and work engagement and the episodic factors that can be experienced through the expansion of work environment.

한우 태아기 6, 9개월령 등심 조직의 전사체 분석을 통한 근생성 및 지방생성 관여 유전자 발굴

정태준(Taejoon Jeong),정기용(Ki-Yong Chung),박원철(Woncheol Park),손주환(Ju-Hwan Son),박종은(Jong-Eun Park),채한화(Han-Ha Chai),권응기(Eung-Gi Kwon),안준상(Jun-Sang Ahn),이지웅(Jiwoong Lee),임다정(Dajeong Lim),Mi-Rim Park 한국생명과학회 2020 생명과학회지 Vol.30 No.1

동물의 근섬유는 배아기와 태아기를 거치며 형성하게 되며 출생 후에는 상처 치유를 위한 것 외에 근섬유 수를 늘리는 순수한 근섬유 형성은 없으며, 이미 존재하고 있는 근섬유의 비대로 근육의 성장이 이뤄진다. 따라서 태아기의 근육의 성장과 발달이 성체의 근육량 및 조성에 미치는 영향이 매우 크며 이 시기에 발현되는 유전자 및 기능을 구명하는 것은 최종적으로 육질, 육량에 개선시키기 위한기초 자료로 활용될 수 있을 것이다. 하지만 한우에서의 연구는 전무한 실정이다. 본 연구는한우 태아기 성장 단계별 근육의 성장과 발달에 관여하는 유전자를 찾기 위한 전사체 분석을 수행하였다. 한우 태아기 6, 9개월령 등심 조직 시료에서 생산한 전사체 자료를 대상으로 DESeq2와 edgeR을 활용하여 성장단계별 유전자의 발현량을 분석하여 차등발현유전자군을 추출했으며, 2개 소프트웨어서 공통적으로 추출된 유전자군(6개월령 특이 발현 유전자 913개, 9개월령 특이 발현 유전자 233개)을 차등발현유전자로 구명 하였다. 차등발현유전자군으로 분류하였다. 차등발현유전자군을 활용하여공발현 유전자 네트워크 분석을 구성하였으며, 유사한 발현 양상을 보이는 유전자들을 그룹화하여 6개월령 특이 발현 유전자군 5개, 9개월령 특이 발현 유전자군 2개의 모듈로 분류했다. 각 모듈은 Gene Ontology (GO) 및 KEGG pathway 분석으로 유의한 기능을 확인하였다. 그 결과, 한우 태아기 6, 9개월령 특이 발현 유전자 네트워크 중, 근육과 지방생성 대사회로와 관련된 2개의 모듈에 대해 네트워크 내에 허브 유전자를 선정할 수 있었다. STRING을 활용하여 단백질 상호작용 네트워크를 구성하고, MCC (maximal clique centrality) 점수를 활용하여 상위 10%의 유전자들을 공발현 분석의 모듈내 허브 유전자로 선정하였다. 그 결과 6개월령 특이 발현 유전자군의 모듈에서는 axin1(AXIN1) 유전자, 9개월령 특이 발현 유전자군 모듈에서는 succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit (SUCLA2) 유전자가 허브 유전자로 확인되었다. AXIN1 유전자는 선행 연구를 통해 6개월령에서 9개월령으로 넘어가면서 근섬유 수의 증식이 억제되고 지방생성이 활발히 이뤄지는 것에 핵심적인 역할을 하는 것으로 추정할 수 있었다. 또한, 시트르산 회로의 중요 요소인 SUCLA2 유전자는 소의 태아기 지방 조직 성장단계에 따라 유전자의 발현이 증가된다는 보고에 따라, 지방 대사와 관련된 유전자임을 알 수 있었다. 추후 한우 태아기 6, 9개월령에 특이적으로 발현된 유전자들을 대상으로 근육 및 지방 형성 관련 기능을 검증하는 후속 연구가 필요할 것이다. The prenatal period in livestock animals is crucial for meat production because net increase in the number of muscle fibers is finished before birth. However, there is no study on the growth and development mechanism of muscles in Hanwoo during this period. Therefore, to find candidate genes involved in muscle growth and development during this period in Hanwoo, mRNA expression data of longissimus in Hanwoo at 6 and 9 months post-conceptional age (MPA) were analyzed. We independently identified differentially expressed genes (DEGs) using DESeq2 and edgeR which are R software packages, and considered the overlaps of the results as final-DEGs to use in downstream analysis. The DEGs were classified into several modules using WGCNA then the modules’ functions were analyzed to identify modules which involved in myogenesis and adipogenesis. Finally, the hub genes which had the highest WGCNA module membership among the top 10% genes of the STRING network maximal clique centrality were identified. 913(6 MPA specific DEGs) and 233(9 MPA specific DEGs) DEGs were figured out, and these were classified into five and two modules, respectively. Two of the identified modules’(one was in 6, and another was in 9 MPA specific modules) functions was found to be related to myogenesis and adipogenesis. One of the hub genes belonging to the 6 MPA specific module was axin1 (AXIN1) which is known as an inhibitor of Wnt signaling pathway, another was succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit (SUCLA2) which is known as a crucial component of citrate cycle.

Anti-Helicobacter pylori effects of IgY from egg york of immunized hens

Yun-Hui Yang,Dongsun Park,Goeun Yang,Sun Hee Lee,Dae Kwon Bae,Jangbeen Kyung,Dajeong Kim,Ehn-Kyoung Choi,Jae-Cheol Son,Seock-Yeon Hwang,Yun-Bae Kim 한국실험동물학회 2012 Laboratory Animal Research Vol.28 No.1

Effects of egg york containing IgY specific for Helicobacter pylori on the bacterial growth and intragastric infection were investigated in comparison with a proton-pump inhibitor pantoprazole. For in vitro antibacterial activity test, H. pylori (1*108 CFU/mL) was incubated with a serially diluted IgY for 3 days. As a result, IgY fully inhibited the bacterial growth at 16 mg/mL, which was determined to a minimal inhibitory concentration. In vivo elimination study, male C57BL/6 mice were infected with the bacteria by intragastric inoculation (1*108 CFU/mouse) 3 times at 2-day intervals, and 2 weeks later, orally treated twice a day with 50, 100, 200 or 500 mg/kg IgY for 18 days. After the final administration, biopsy sample of the gastric mucosa was assayed for the bacterial identification via urease, oxidase, catalase, nitrate reduction and H2S tests in addition to microscopic examination for mucosal inflammation. In CLO kit test, 75, 50, 12.5 and 12.5% of the animals revealed positive reaction following treatment with 50, 100, 200 and 500 mg/kg IgY, respectively, resulting in a superior efficacy at 200 mg/kg than 30 mg/kg pantoprazole that displayed 75% elimination. The CLO test results were confirmed by bacterial identification. Microscopic examination revealed that H. pylori infection caused severe gastric mucosal inflammation, which were not observed in the CLO-negative mice following treatment with IgY or pantoprazole. Taken together, IgY inhibited the growth of H. pylori, and improved gastritis and villi injuries by eliminating the bacteria from the stomach. The results indicate that IgY could be a good candidate overcoming tolerance of antibiotics for the treatment of H. pylori-mediated gastric ulcers.