염화 크로틸과 염화 신남일의 오존화 반응. 일차오존화물의 위치 선택적 분해로 생성된 O-산화물의 고리화첨가반응

이강렬,박현정,허태성,Lee, Kang-Ryul,Park, Hyun-Jung,Huh, Tae-Sung 대한화학회 1995 대한화학회지 Vol.39 No.10

1-Halo-3-Phenyl-1,2-Propadiene들의 가수분해에 대한 반응속도론적 연구

이강렬,유힐라,정인찬,허태성,Lee, Kang Ryul,Yoo, Hil Ra,Jung, In Chan,Huh, Tae Sung 대한화학회 1997 대한화학회지 Vol.41 No.7

haloallene 유도체(1-halo-3-phenyl-1,2-propadiene)에 대해 EHMO계산을 하여, 에너지적으로 안정한 haloallene 분자의 구조를 결정하였다. MO 계산 데이터와 속도론적인 실험 결과로부터 haloallene의 가수분해반응 메카니즘을 제안하였다. pH 8.0 이하에서는 중간체로 carbonium ion Ⅱ이 생성되는 용매도움 $S_N1$ 메카니즘에 의해 진행된다. 그러나 pH 9.5 이상에서는 전위상태 Ⅲ를 거치는 $S_N2'$ 메카니즘에 의해 진행된다. Extended Huckel Molecular Orbital (EHMO) calculations of haloallene (1-halo-3-phenyl-1,2-propadiene) derivatives have been performed. From the MO calculation data and kinetic experimental results, the mechanism for the hydrolysis of haloallenes is proposed.; Below pH 8.0, the hydrolysis proceeds through a solvent assisted $S_N1$ mechanism involving the formation of carbonium ion Ⅱ as intermediate. However above pH 9.5, the hydrolysis proceeds through an $S_N2'$ mechanism via transition state Ⅲ.

tRNA 의 화학적 변형에 관한 연구

박인원,이강렬,남정이,Park, In-Won,Lee, Kang-Ryul,Nam, Jeong-Ee 생화학분자생물학회 1974 한국생화학회지 Vol.7 No.1

At $37^{\circ}C$, phenylglyoxalation of yeast tRNA proceeds for two hours and no further reaction could be detected. Number of guanine residues modified after two hours' phenylglyoxalation is about six moles per tRNA molecule. Twenty-four hours' reaction produces at most seven residues of modified guanine. As the extent of tRNA modification increased, amino acid acceptor activity of phenylalanine tRNA decreased. Since the phenyl glyoxal modifies tRNA's no more than six residues of their guanine residues after two hours' reaction, phenylglyoxalation might be a recommendable means for the modification of exposed guanine residues on tRNA molecules. $37^{\circ}C$에서 효모 tRNA의 구아닌 잔기에 대한 페닐글리옥실화반응은 2시간이 지난 후에는 더 이상 진행되지 않았다. 변형된 구아닌 잔기의 수는 2시간 반응에서 tRNA 한 분자 당 6개이었다. 24시간 반응시켰을 때는 변형된 잔기의 수는 7개가 되었다. tRNA의 변형의 정도가 클 수록 tRNA의 페닐알라닌에 대한 수용능력이 감소된다. tRNA를 페닐글리옥살과 24시간 작용시켰을 때 구아닌 잔기가 6개 이상 변형되지 않으므로 페닐글리옥살은 tRNA에 있어서 노출된 구아닌 잔기들을 변형시키는 적당한 시약으로 생각한다.

tRNA의 생합성에 관한 연구 : 효모 선구 tRNA의 Intervening Sequence의 Processing

김상희,이강렬,박인원,Kim, Sang-Hee,Lee, Kang-Ryul,Park, In-Won 생화학분자생물학회 1981 한국생화학회지 Vol.14 No.4

효모 균주 SUP 7 Mod II-3B에서 이차원 폴리아크릴아미드 겔 전기영동법으로 약 20개의 선구 tRNA를 분리했다. 이 선구 tRNA의 분자 크기는 5.8S와 4.5S RNA 크기 사이의 것으로서 모두 소수염기를 가지고 있었다. 이중 몇가지 선구 tRNA는 intervening sequence를 가지고 있음이 확인되었다. Intervening sequence를 가지고 있는 선구 tRNA를 S-30 분획과 핵분획으로 처리하면 tRNA의 분자 크기의 조각과 약 20개 정도의 누클레오티드의 작은 조각으로 절단 되었는데, 이것은 S-30 분획과 핵분획에 선구 tRNA의 intervening sequence를 절단하는 가공효소가 들어 있다는 가능성을 암시한다. Some 20 precursor tRNAs were isolated from yeast cell, SUP 7 Mod II-3B by two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis. These precursors were in the 4.5S~5.8S size range and contained already moidified miner bases at precursor level. Some of the precursor tRNAs were identified to have an intervening sequence in the anticodon region. The treatment of precursor tRNA with S-30 fraction and nuclei fraction gave rise to half-sized tRNA fragments and the fragments of about 20 nucleotides long. This result suggests that tRNA processing enzyme activity which removes the intervening sequence is present in the S-30 fraction as well as in the nuclei fraction.

The Primary and Secondary Structure of 5S rRNA from Pseudomonas testosteroni

고문주,박인원,이강렬,Koh, Moon-Joo,Park, In-Won,Lee, Kang-Ryul 생화학분자생물학회 1987 한국생화학회지 Vol.20 No.4

P. testosteroni의 5S rRNA의 일차구조를 효소적 및 화학적 방법을 병용하여 결정하였다. 이 5S rRNA는 116개의 누클레오티드로 이루어져 있으며 변형된 누클레오시드를 전혀 함유하지 않는다. 이 5S rRNA는 지금까지 조사된 다른 Pseudomonas의 것들과 비교할 때 낮은 상동성 (75%-79%)을 가지고 있다. 핵산가수분해효소 S1, RNase T1 그리고 RNase V1들에 의한 절단 자리들을 보면 5S rRNA는 다소 신축성이 있음을 짐작할 수 있다. The primary structure of 5S rRNA from Pseudomonas testosteroni was determined by enzymatic and chemical methods. The 5S rRNA consists of 116 nucleotides and contains no modified nucleoside. The 5S rRNA has somewhat low homology (75% - 79%) compared with those of the four other Pseudomonas species studied to date. Data on the cleavage sites by nuclease S1, RNase T1 and RNase V1 suggest that the molecule of 5S rRNA is rather flexible.

Ozonolyses of Cyclopolyenes Adsorbed on Polyethylene

이아영,허태성,이강렬,Lee, A-Yeong,Huh, Tae-Sung,Lee, Kang-Ryul Korean Chemical Society 2004 대한화학회지 Vol.48 No.2

Pseudomonas mendocina의 5S rRNA의 일차구조 및 이차구조

고문주,박인원,이강렬,Koh, Moon-Joo,Park, In-Won,Lee, Kang-Ryul 생화학분자생물학회 1988 한국생화학회지 Vol.21 No.3

The primary structure of 5S rRNA from P. mendocina has been determined by enzymatic and chemical methods. The 5S rRNA consists of 116 nucleotides and contains no modified nucleotides. We have constructed a possible secondary structure and discussed some of its features on the basis of cleavage sites by single strand specific nucleases and a double strand specific ribonuclese, and also of chemical modification sites by phenyldiglyoxal and diethyl pyrocarbonate on the 5S rRNA. P. mendocina의 5S rRNA의 일차구조를 효소적 방법과 화학적 방법으로 결정하였다. 이 5S rRNA는 116개의 누클레오티드로 구성되었으며, 변형된 누클레오티드를 가지지 않는다. 단일가닥에 특이하게 작용하는 핵산 가수분해효소들과 이중 가닥에 특이하게 작용하는 리보핵산 가수분해효소에 의한 5S rRNA에서의 절단 자리들, 그리고 페닐글리옥살 및 피로탄산 이에틸에 의한 화학 변형이 일어나는 자리들에 근거하여 P. mendocina의 5S rRNA의 이차구조를 구성하고 논의하였다.

Pseudomonas Mendocina 의 5S rRNA의 일차구조 및 이차구조

고문주,박인원,이강렬 ( Moon Joo Koh,In Won Park,Kang Ryul Lee ) 생화학분자생물학회 1988 BMB Reports Vol.21 No.3

The primary structure of 5S rRNA from P. mendocina has been determined by enzymatic and chemical methods. The 5S rRNA consists of 116 nucleotides and contains no modified nucleotides. We have constructed a possible secondary structure and discussed some of its features on the basis of cleavage sites by single strand specific nucleases and a double strand specific ribonuclese, and also of chemical modification sites by phenyldiglyoxal and diethyl pyrocarbonate on the 5S rRNA.

Formation of Methylene Bis-derivatives of Cytosine

박인원,이윤배,이강렬,Park, In-Won,Lee, Yun-Bae,Lee, Kang-Ryul 생화학분자생물학회 1973 한국생화학회지 Vol.6 No.1

pH 5.6에서 시토신과 포름알데히드 사이의 반응에 의하여 세 가지 생성물질을 얻었다. 형성된 생성물질을 $2\;cm{\times}36\;cm$ 크기의 Dowex AG 50 W - X4 대롱으로 분리하였다. 대롱은 1 ml/분의 유속으로 2N HCl로 용리하였다. 생성물질을 아질산으로 처리한 결과로부터 그들의 구조가 다음과 같음을 결론짓는다. 모노에틸올 유도체는 1-N 위치에서 변형된 것이다. 그밖의 두 생성물질은 메틸렌 비스유도체이고 그 중 하나는 두 시토신 잔기의 1-N 위치에서 다리결함을 이루고 있고 다른 하나는 시토신 잔기의 $N^4$ 위치에서 다리결합을 이루고 있다. 버스유도체들의 자외선스펙트럼은 두 개의 시토신 잔기에 위하여 가산적으로 기여되고 있는 것과 같은 성질을 나타낸다. 세 생성물질은 모두 2N HCl 용액에서는 안정하고 알칼리성 용액에서는 비교적 불안정하다. Three reaction products were obtained by the reaction between cytosine and formaldehyde at pH 5.6. The products formed were separated by using Dowex AG 50W - X4 column, $2\;cm{\times}36\;cm$. The column was eluted with 2N HCl at a flow rate of 1 ml/min. From the nitrous acid treatment of the products, we conclude the structures to be as following; the monomethylol derivative is modified at 1-N position, and other two products are methylene bis-derivatives, one of which is bridged at 1-N positions of two cytosine residues and the second one is bridged at $N^4$ positions of two cytosine residues. The ultraviolet absorption of the bis-derivatives behaves as it is additively contributed by the two cytosine residues. All three products are stable in 2N HCl solution, and relatively unstable in alkaline solution.

효모의 선구 tRNA들에서의 tRNA2 선구체의 확인

강석찬,박인원,이강렬,남정이 ( Seok Chan Kang,In Won Park,Kang Ryul Lee,Jeong E . Nam ) 생화학분자생물학회 1985 BMB Reports Vol.18 No.2

One of the hitherto not characterized precursor tRNAs in yeast, which was previously designated as RNA 9a, was identified to be a precursor to tRNA₂^(LYs), by comparing the fingerprints of RNA 9a and spliced product of RNA 9a. Minor base analysis of RNA 9a showed that its 5`-end nucleotide was pψp like in native tRNA₂^(Lys), and also that the bases positioned at 34, 37, and 47 are not modified at the precursor level. We also found that splicing enzyme from temperature sensitive mutant cells of yeast had the splicing activity even at the nonpermissive temperature.