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CYC8에 의한 rad53 돌연변이의 표현형 억제에 대한 연구
박경준,최도희,권성훈,김준호,배성호,Park, Kyoung-Jun,Choi, Do-Hee,Kwon, Sung-Hun,Kim, Joon-Ho,Bae, Sung-Ho 한국미생물학회 2010 미생물학회지 Vol.46 No.2
RAD53은 효모의 검문지점 경로가 DNA 손상을 감지하여 여러 가지 후속적인 세포 내 반응을 일으키는 데 핵심적인 역할을 하는 인산화 효소일 뿐만 아니라, dNTP 생성에 중요한 RNR 유전자 등의 전사 활성화 과정에도 관여하는 효모의 생존에 필수적인 유전자이다. 본 연구에서는 rad53${\Delta}$ 돌연변이의 hydroxyurea에 대한 민감성을 억제하는 억제자로서 CYC8을 동정하였다. CYC8 유전자가 많은 사본으로 존재할 때 rad53${\Delta}$ 균주의 hydroxyurea에 대한 내성이 증가하였으나, CYC8과 복합체로 작용하는 TUP1은 다사본 억제자로 작용하지 못하였다. 반면, 삭제 돌연변이의 경우, cyc8${\Delta}$과 tup1${\Delta}$ 모두 억제자로 작용하였다. CYC8은 효모에서 프리온 단백질로 작용하기 때문에 과량 발현되면 정상적인 CYC8 단백질의 잘못된 접힘을 유발하게 되고, 결과적으로 우성의 $cyc8^-$ 표현형이 나타나게 된다. 따라서 CYC8이 다사본 억제자로 작용하는 이유는 이러한 프리온의 특성 때문으로 추측된다. CYC8이 다사본이거나 cyc8${\Delta}$ 돌연변이일 경우 모두 RNR 유전자의 전사가 증가되는 것을 관찰하였다. 따라서 CYC8에 의한 rad53${\Delta}$ 돌연변이의 억제는 RNR 증가에 따른 세포 내 dNTP 증가 때문으로 생각된다. RAD53 functions as an effector kinase of checkpoint pathways in Saccharomyces cerevisiae, which plays a central role to regulate many downstream cellular processes in response to DNA damage. It also involves in transcriptional activation of various genes including RNR genes which encode the key enzyme required for dNTP synthesis. In this study, we identified CYC8 as a suppressor for the hydroxyurea sensitivity of $rad53{\Delta}$ mutation. $Rad53{\Delta}$ mutant transformed with a multi-copy plasmid containing CYC8 showed increased hydroxyurea resistance. In contrast, TUP1 which forms a complex with CYC8 did not function as a suppressor. In the case of mutations, both $cyc8{\Delta}$ and $tup1{\Delta}$ suppressed hydroxyurea sensitivity of $rad53{\Delta}$. Since CYC8 can propagate as a prion in yeast, overexpression of CYC8 induced misfolding of the normal CYC8 proteins, resulting in dominant cyc8-phenotype. Therefore, it is suggested that CYC8 can act as a multi-copy suppressor due to its prion property. It was observed that the levels of RNR transcription were increased in the yeast strains containing either multi-copies of CYC8 gene or $cyc8{\Delta}$ mutation, suggesting that the increased level of RNR will elevate the intracellular pools of dNTPs, which, in turn, suppress the phenotype of $rad53{\Delta}$ mutation.
WSN을 위한 테스트베드와 가상환경의 효율적인 통합 테스트 시뮬레이션 환경 구축
박경준,최대담,서민석,박현주,Park, Kyung-Joon,Choi, Dae-Dam,Seo, Min-Seok,Park, Hyun-Ju 한국정보통신학회 2013 한국정보통신학회논문지 Vol.17 No.3
WSN (Wireless Sensor Network), to take advantage of the range was gradually expanded. So WSN access from public network to the desire to be increased. As a result, the test network environment for research has been progressing steadily. Because it requires a lot of sensor nodes, to establish of Testbed for WSN is difficult. in this paper suggests efficient integration test simulation environment of Testbed and Virtual environment for WSN. In addition to this paper suggests simulation environment able to integration of simulation time of Testbed and NS-3. WSN(Wireless Sensor Network)를 활용하는 범위가 점차 확대 되면서 TCP/IP 기반의 공용 네트워크에서 WSN에 접근하고자 하는 요구가 증가 하였고, 이로 인해 이 네트워크 환경 모델을 테스트하기 위한 연구가 꾸준히 진행 되었다. 하지만 다수의 센서 노드들을 필요로 하는 WSN을 위한 테스트 베드를 구축하는 것은 매우 어려운 일이다. 본 논문에서는 이러한 네트워크 환경 모델을 테스트베드와 NS-3를 통합한 테스트 시뮬레이션 환경을 제공한다. 뿐만아니라 테스트베드의 시뮬레이션 시간도 NS-3의 리얼타임 스케줄러를 이용하여 통합할 수 있는 시뮬레이션 환경을 제공한다.
박경준,서민석,박현주,Park, Kyung-Joon,Seo, Min-Seok,Park, Hyun-Ju 한국정보통신학회 2013 한국정보통신학회논문지 Vol.17 No.4
최근의 C++ 개발자들은 개발 시 메모리 관리에 장점을 지닌 참조 카운팅 방식의 스마트 포인터를 많이 활용한다. 그러나 스마트 포인터는 빠른 응답성을 요구하는 시스템에서는 일반 포인터에 비해 효율적이지 못한 동작 방식 때문에 문제가 생길 수 있다. 본 논문에서는 이러한 점을 보완하여 참조 카운팅 방식 스마트 포인터가 가리키는 객체에 대한 삭제 작업을 수행 시 삭제 작업을 위한 쓰레드를 생성하여 성능을 개선하는 방법을 제안 하였다. 또한 이를 일반화 시켜서 모든 자료 형에서 동작시키기 편리한 방법을 제안하였다. Recent C ++ developers take advantage of the many advantages in memory management in the development of reference counting smart pointer. However, these have a problem more than the normal pointer. In this paper, we not only complement these by reference counting smart pointer which pointing a large dynamic object to perform a delete operation to improve performance by creating a thread for the delete operation but also Generalize all data types, we propose a convenient way to operate.
박경준(KyungJun Park),이기준(KiJun Lee),Bettar El Hadi,이재효(Jaihyo Lee),신동일(Dongil Shin) 한국가스학회 2011 한국가스학회지 Vol.15 No.3
본 연구에서는 미국 NIST의 Fire Dynamics Simulator (FDS) ver. 5.4.8을 이용하여 지하철 터널 안의 지하철에서 화재가 발생한 경우에 터널에 설치된 환기팬의 제연효과를 검증하였다. 시뮬레이션을 위해 서울 지하철의 실측자료를 활용하여 지하터널과 지하철을 모델링 하였다. 이를 바탕으로 환기용량을 2.0~3.0 ㎧ 범위에서 변화시키면서 CO와 CO₂의 제거 효율을 예측한 결과, 0.5 ㎧의 용량 증가에 의해 평균 35 % 이상의 제거효과가 있음을 확인하였다. 또한 FDS의 결과값이 전체 그리드 개수와 크기에 영향을 받는 점을 고려하여 정확한 결과값을 얻기 위해 FDS의 그리드 민감성을 검토하였다. 그리고 그리드 크기를 변화시켜 CO와 CO₂ 농도 산출값과 계산에 걸리는 시간을 비교한 결과를 바탕으로 최적의 그리드를 선정하여 시뮬레이션에 적용하였다. In this study, we investigate simulation studies to confirm the removal of smoke through ventilation when the subway car is on fire and stopped in an underground subway tunnel, by using Fire Dynamics Simulator (FDS) which is being upgraded by NIST. The structure of subway tunnel and train for simulation modeling are based actual data from Seoul metropolitan subway. The main purpose of this study is to assure the removal efficiency of the ventilation when changing the ventilation capacity between 2.0 ㎧ and 3.0 ㎧. The results of the study shows that carbon monoxide (CO) and carbon dioxide (CO₂) are reduced by about 35% as the ventilation capacity is increased by 0.5 ㎧. This study also performs the grid sensitivity verification of FDS for improved accuracy of the results. To find the effective size of the grid, three cases are simulated and the results are compared.