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지반 조사를 위한 PC 기반의 3차원 탄성파 자료처리시스템 개발
신동훈,지준,이두성 한국자원공학회 2003 한국자원공학회지 Vol.40 No.1
The primary goal of the system in this study is developing the 3-D seismic data processing system for an underground investigation, which is developed on a Linux-based PC. Basic data processing modules are originated from the SU(Seismic Unix) which is widely used in 2-D seismic data processing and auxiliary modules are developed for 3-D data processing. This system is developed for the users to analyze seismic data readily and is designed to have a user friendly GUI(Graphic User Interface) which is easy to control. For the purpose of it, the GTK(Gimp Tool Kit) is employed as conventional Linux application tools. This system will help a processor to manipulate huge 3-D data easily and be able to handle complex process for huge 3-D seismic data with ease. This will be useful especially for the processes that require interactive processing such as the identification of geometry, trace editing, gain control, mute, velocity analysis and recognition of first arrivals, reflection surface and faults. 본 연구에서 개발한 시스템은 지반조사에 사용될 3차원 탄성파 자료처리시스템으로써, Linux 환경의 PC를 기반으로 하고있다. 시스템을 이루는 기본적인 자료처리 모듈들은 2차원 탄성파 자료처리에 널리 사용되고 있는 SU(Seismic Unix)를 기반으로 하여 사용자들이 자료처리의 과정들을 쉽게 이해할 수 있을 뿐만 아니라, 3차원 지반조사에 적합하도록 추가적인 자료처리 모듈들을 개발하였다. 이러한 자료처리 모듈들을 이용하여 구축된 시스템은, 처리과정 중에 사용자가 쉽게 QC(Quality Control)를 할 수 있도록 GUI (Graphic User Interface)환경으로 설계되었으며, 이를 구현하기 위해 최근 Linux용 어플리케이션 개발에 보편적으로 쓰이는 GTK(Gimp Tool Kit)가 사용되었다. 이와 같은 3차원 탄성파 자료처리 시스템을 통하여, 사용자는 방대한 양의 3차원 탄성파 자료들을 다루어야 하는 복잡한 처리과정을 손쉽게 진행할 수 있게 된다. 특히 자료처리 과정들 중에서 대화식 방법이 요구되는, geometry의 확인, 트레이스 편집, 이득 조절, 뮤트, 속도분석 등과 초동/반사면/단층들의 인식 등에 유용하게 사용할 수 있다.
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신동훈,김주원,어영,이세일,서동민,김갑성,장재윤,이만희,윤광로,윤갑준 대한진단검사의학회 2014 Annals of Laboratory Medicine Vol.34 No.4
Background: Hemolysis, icterus, and lipemia (HIL) cause preanalytical interference and vary unpredictably with different analytical equipments and measurement methods. We developed an integrated reporting system for verifying HIL status in order to identify the extent of interference by HIL on clinical chemistry results. Methods: HIL interference data from 30 chemical analytes were provided by the manu- facturers and were used to generate a table of clinically relevant interference values that indicated the extent of bias at specific index values (alert index values). The HIL results generated by the Vista 1500 system (Siemens Healthcare Diagnostics, USA), Advia 2400 system (Siemens Healthcare Diagnostics), and Modular DPE system (Roche Diagnostics, Switzerland) were analyzed and displayed on physicians’ personal computers. Results: Analytes 11 and 29 among the 30 chemical analytes were affected by interfer- ence due to hemolysis, when measured using the Vista and Modular systems, respec- tively. The hemolysis alert indices for the Vista and Modular systems were 0.1-25.8% and 0.1-64.7%, respectively. The alert indices for icterus and lipemia were <1.4% and 0.7% in the Vista system and 0.7% and 1.0% in the Modular system, respectively. Conclusions: The HIL alert index values for chemical analytes varied depending on the chemistry analyzer. This integrated HIL reporting system provides an effective screening tool for verifying specimen quality with regard to HIL and simplifies the laboratory workflow.. Background: Hemolysis, icterus, and lipemia (HIL) cause preanalytical interference and vary unpredictably with different analytical equipments and measurement methods. We developed an integrated reporting system for verifying HIL status in order to identify the extent of interference by HIL on clinical chemistry results. Methods: HIL interference data from 30 chemical analytes were provided by the manu- facturers and were used to generate a table of clinically relevant interference values that indicated the extent of bias at specific index values (alert index values). The HIL results generated by the Vista 1500 system (Siemens Healthcare Diagnostics, USA), Advia 2400 system (Siemens Healthcare Diagnostics), and Modular DPE system (Roche Diagnostics, Switzerland) were analyzed and displayed on physicians’ personal computers. Results: Analytes 11 and 29 among the 30 chemical analytes were affected by interfer- ence due to hemolysis, when measured using the Vista and Modular systems, respec- tively. The hemolysis alert indices for the Vista and Modular systems were 0.1-25.8% and 0.1-64.7%, respectively. The alert indices for icterus and lipemia were <1.4% and 0.7% in the Vista system and 0.7% and 1.0% in the Modular system, respectively. Conclusions: The HIL alert index values for chemical analytes varied depending on the chemistry analyzer. This integrated HIL reporting system provides an effective screening tool for verifying specimen quality with regard to HIL and simplifies the laboratory workflow.
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신동훈,윤능기,서석권,예민해,Shin, Dong-Hoon,Yoon, Nung-Ki,Suh, Suk-Kwon,Yeh, Min-Hae 대한예방의학회 1990 예방의학회지 Vol.23 No.3
1989년 11월부터 4개월간 대구시내 소재 일부, 6가 크롬(삼산화크롬)으로 피막처리하는 도금작업장의 남성근로자를 대상으로 비중격천공이 있는 근로자 12명과 비중격천공이 없는 근로자 12명을 폭로군으로 하고 크롬에 폭로된 적이 없는 정상인 20명을 대조군으로 하여 개별면담을 통해 연령, 직업력, 흡연습관을 파악하였으며, 정맥혈을 채취하여 원자화 무염광로를 부착한 원자흡광도계로 혈중 크롬농도를 측정하였으며 말초혈액 중 임파구의 자매염색분체교환의 발현빈도를 조사하고 연령, 흡연습관, 직업력 및 혈중 크롬농도 등이 임파구 자매염색분체교환의 발현빈도에 미치는 영향을 조사했다. 크롬 도금작업의 말초혈액 중 임파구 자매염색분체교환의 발현빈도는 비중격 천공이 있는 군이 $10.1{\pm}1.6$, 비중격천공이 없는 군이 $8.5{\pm}3.4$이었고 대조군 $6.1{\pm}2.1$으로 세군간에 유의한 차이가 있었으며 (p<0.01), 비중격천공 군에서 가장 높은 빈도를 보였으며, 대조군에 비해 1.7배의 높은 빈도를 나타냈다. 혈중 크롬농도는 대조군이 $0.060{\pm}0.043{\mu}g/ml$, 크롬도금 작업자 중 비중격천공이 있는 군 $0.114{\pm}0.030{\mu}g/ml$, 비중격천공이 없는 군 $0.090{\pm}0.050{\mu}g/ml$로 세군간의 차이는 유의하였다 (p<0.01). 크롬도금 작업자와 대조군 모두 연령군별, 흡연습관별 및 근속년수에 따른 자매염색분체교환의 발현빈도에는 유의한 차이가 없었다. 혈중 크롬농도와 자매염색분체교환 발현빈도의 상관성은 상관계수, r=0.007로서 상관관계가 없었다 (Y=0.638 X+0.191, r=0.007. p>0.05). SCE 평균 발현빈도를 $y=(sum\;SCE)^{\frac{1}{2}}+(sum\;SCE+1)^{\frac{1}{2}}$를 이용하여 변형한 변수 y에 대해 연령, 흡연습관, 직업 및 혈중 크롬농도의 요인들로서 설명력은 32.3%였으며 가장 중요한 변수는 직업으로 나타났다. 이상의 결과로 보아 직업적인 크롬폭로에 의한 유전적 손상의 위험성이 어느 정토 있을 것으로 추측되며 생물학적 독성검정 지표로서 유용성이 있을 것으로 생각된다. To investigate the possibility of utilizing of sister chromatid exchange(SCE) analysis in lymphocytes as an indicator which could evaluate the effects of mutagenicity after in vivo exposure to hexavalent chromium, this study was conducted using some of chromium plating workers occupationally exposed to hexavalent chromium, chromium trioxide ($CrO_3$) in Taegu city. The study population was 12 Cr platers with perforation of nasal septum, 12 Cr platers without perforation of nasal septum and 20 controls. The SCE in peripheral blood lymphocytes of the subjects was analyzed and blood chromium concentration was estimated using the atomic absorption spectrophotometer (IL551) equipped with furnace atomizer (IL755). The mean SCE frequencies for Cr platers with and without perforation of nasal septum were statistically higher than those for control. The difference in SCE frequencies by age, smoking habits were not statistically significant both in Cr platers and controls. There was no difference in SCE frequencies by career of Cr platers workers. In Cr platers, the correlation between the mean SCE frequencies and chromium concentration in blood was not statistically significant. Using the transformation $y=(sum\;SCE)^{\frac{1}{2}}+(sum\;SCE+1)^{\frac{1}{2}}$, when the data was studied by multiple regression, it appeared that the influence of the occupation was the most important. Age, smoking, occupation and CrB(blood chromium concentration) together explain only 32.3% of interpersonal variation on SCE. The results in this study suggest tt a genetic risk due to occupationally exposure to hexavalent chromium is clearly inferable and thus, SCE analysis in human lymphocytes may be used indicator of biological toxic effects of chromium. Further, populatio analysis stuies are required before SCE frequency can be used as a mutagenic indicator in human population.
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대뇌 기저핵 신경세포 일차배양에서 망간에 의해 유도된 Appoptosis : 형태학적인 소견
신동훈,김상표,정용욱,배재훈,송대규,백원기 大韓産業醫學會 2000 대한직업환경의학회지 Vol.12 No.1
목적 : 본 실험은 대뇌기저핵의 신경세포를 배양하여 망간(MnCl₂)을 투여한 후 망간독성에 의한 신경세포의 apoptosis를 형태학적인 소견으로 관찰하였다. 방법 : 배양된 신경세포에 0.01에서 10μM Mnc12를 48시간동안 처리한 후 TUNEL (TdT-mediated dUTP Nick End Labelling)법 및 투과전자현미경학적으로 관찰하였다. 결과 : TUNEL방법을 이용하여 관찰한 결과 TUNEL반응에 갈색으로 양성반응을 나타내는apoptotic 세포의 수가 대조군에 비해 MnCl₂를 투여한 군에서 유의하게 높게 나타났으며(P〈0.05), 투과전자현미경학적 소견상 대조군의 신경세포들은 핵인(nucleolus)이 두드러지게 특징적으로 보이면서 핵막과 세포질내 소기관들이 잘 보존되어 있으며, 세포질내망(ER)과 사립체(mitochondria)를 특히 많이 가지고 있었다. Mnc12를 48시간 동안 처리한 군에서 이질염색질(heterochromatin)이 핵막으로 이동하면서 응집되어 있었으며, 핵내 불규칙한 형태의 염색질이 나타나 분절이 진행되는 소견을 보였고, Apoptosis의 가장 특징적인 초기 소견인 막으로 둘러싸인 반달모양의 핵내염색질의 분절편(fragment-ed chromatin)과 주위의 상대적으로 정상적인 소기관으로 구성된 apoptotic body를 관찰할 수 있었다. 결론 : 신경세포에서 망간에 의해 apoptosis가 유도됨을 형태학적인 방법으로 확인할 수 있었으며 망간에 의한 세포사망양상에 apoptosis가 하나의 기전이 될 수 있을 것이다. Objectives : Manganese is cytotoxic to the central nervous system including basal gan-glia. Its toxic mechanism is related to oxidative stress, mediated by toxic free radicals but is specultives. In the present study , we have investigated to manifest apoptosis in man-ganese-induced cytotoxicity in primary neuronal cell culture of rat basal ganglia. Methods : To detect apoptotic neuronal cells were stained by the terminal deoxynu-cleotide (TdT) -mediated dUTP nick end-labelling (TUNEL) method and apoptotic changesin nuclei of neurons were observed by electron microscopy. Results : We showed that TUNEL immunostain showed brownish signal in the nuclei of apoptotic cells and the proportions of apoptotic cells in Manganese treatment groups were more higher than controls. On transmission electron microscopy, there were chromatine condensation with margination toward nuclear membrane and condensation of cyto-plasm in the treated with luM MnCl²for 48 hours in a basal ganglia neurons. Apoptotic bodies were found and consisted of semilunar-like condensed nuclei with relatively intact cytoplasmic organelles. Conclusions : Apoptosis appears to be one mechanism in the manganese-induced net-ronal cell death. Manganese intoxication is a convenient model for apoptosis study.
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