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Hwang, Yongsung,Broxmeyer, Hal E.,Lee, Man Ryul CURRENT SCIENCE 2017 CURRENT OPINION IN HEMATOLOGY Vol.24 No.4
<P>Purpose of reviewHematopoietic cell transplantation (HCT) is a successful treatment modality for patients with malignant and nonmalignant disorders, usually when no other treatment option is available. The cells supporting long-term reconstitution after HCT are the hematopoietic stem cells (HSCs), which can be limited in numbers. Moreover, finding an appropriate human leukocyte antigen-matched donor can be problematic. If HSCs can be stably produced in large numbers from autologous or allogeneic cell sources, it would benefit HCT. Induced pluripotent stem cells (iPSCs) established from patients' own somatic cells can be differentiated into hematopoietic cells in vitro. This review will highlight recent methods for regulating human (h) iPSC production of HSCs and more mature blood cells.Recent findingsAdvancements in transcription factor-mediated regulation of the developmental stages of in-vivo hematopoietic lineage commitment have begun to provide an understanding of the molecular mechanism of hematopoiesis. Such studies involve not only directed differentiation in which transcription factors, specifically expressed in hematopoietic lineage-specific cells, are overexpressed in iPSCs, but also direct conversion in which transcription factors are introduced into patient-derived somatic cells which are dedifferentiated to hematopoietic cells. As iPSCs derived from patients suffering from genetically mutated diseases would express the same mutated genetic information, CRISPR-Cas9 gene editing has been utilized to differentiate genetically corrected iPSCs into normal hematopoietic cells.SummaryIPSCs provide a model for molecular understanding of disease, and also may function as a cell population for therapy. Efficient differentiation of patient-specific iPSCs into HSCs and progenitor cells is a potential means to overcome limitations of such cells for HCT, as well as for providing in-vitro drug screening templates as tissue-on-a-chip models.</P>
김용성 ( Yongsung Kim ),전상훈 ( Sanghoon Jun ),유제혁 ( Jehyeok Rew ),황인준 ( Eenjun Hwang ) 한국정보처리학회 2014 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.21 No.2
최근 SNS 사용자가 급증하면서 매우 다양하고 방대한 양의 글이 여러 종류의 SNS를 통해 생성되고있다. 그중 트위터는 정보의 전달 및 확산에 상당히 유용한 도구로 사용되고 있다. 이러한 트위터의 사용자 트윗은 뉴스,음악,사진,여행 등 다양한 형태로 등장한다. 또한 트위터는 해시태그라는 사용자 정의 태그를 사용하는데 이는 트윗의 키워드 및 핵심을 쉽게 표현할 수 있도록 해주는 효과적인 수단이다. 최근 상당히 많은 양의 트윗의 생성에도 불구하고 이를 다양한 카테고리별로 분류할 수 있는 연구가 많이 진행되지 않았다. 따라서 본 논문에서는 해시태그를 이용해 트윗의 핵심을 파악하고 수많은 트윗을 다양한 토픽별로 분류할 수 있는 기법을 제안한다. 우선 다양한 카테고리의 인기 해시태그가 포함된 트윗을 수집하고 수집 한 트윗에서 해시태그별 키워드를 추출한다. 그리고 코사인 유사 도를 통해 해시태그별 내용 유사도를 파악하여 각 카테고리 내의 해시태그가 얼마나 유사한 내용을 지니고 있는지 파악한다. 마지막으로 사용자 트윗이 입력되면 모든 카테고리와 유사도를 비교하여 가장 유사도가 높은 카테고리를 찾아 추천해준다. 제안된 기법을 바탕으로 프로토타입을 구현하고 실험을 통해 성능을 평가한다.
Kang, Yongsung,Kim, Jinwoo,Kim, Suhyun,Kim, Hongsup,Lim, Jae Yun,Kim, Minkyun,Kwak, Jangyul,Moon, Jae Sun,Hwang, Ingyu WILEY-VCH Verlag 2008 Proteomics Vol.8 No.1
<P>Plant pathogenic bacteria transfer effector proteins into plant cells via the hypersensitive response and pathogenicity (Hrp) type III protein secretion system (T3SS) during infection. The genes encoding the Hrp T3SS are expressed only under plant apoplast-mimicking conditions in an AraC-type transcriptional activator HrpB-dependent manner. To identify the proteins controlled by HrpB in Burkholderia glumae in vitro, we constitutively expressed hrpB and analyzed the proteins showing altered expression using 2-DE and ESI-MS/MS. Among 46 proteins exhibiting consistently altered expression, which were encoded by 34 different genes, 34 were secretory proteins and 12 were cytoplasmic. Twenty-eight of the secreted proteins showed increased accumulation, whereas the other six showed decreased accumulation. None of the HrpB-dependent proteins had significant homology to known T3SS-dependent proteins, except for HrpK from Pseudomonas syringae pv. syringae and two T3SS-associated cytoplasmic proteins from Ralstonia solanacearum. Twenty-one of the 34 genes had putative HrpB-binding sequences in their upstream regulatory regions. Secretion of all 34 extracellular proteins was independent of the Hrp T3SS, and 16 were secreted via a type II protein secretion system (T2SS). Mutants lacking the T2SS or Hrp T3SS produced toxoflavin but were less virulent to rice panicles, indicating the importance of these proteins in pathogenicity.</P>
유전자 알고리즘과 신경망을 이용한 웹 서비스 정보 클러스터링
황중연(JoongYoun Hwang),유춘식(Chun Sik Yoon),김용성(YongSung Kim) 한국정보과학회 2004 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.31 No.2Ⅰ
오늘날, 웹서비스를 이용한 정보 검색을 하기 위해서는 UDDI 레지스트리의 전문적인 지식이 필요하다. 즉 웹 서비스를 명시하기 위해 사용된 카테고리와 이에 대한 값, 이름 등을 사전에 알고 있어야 한다. 그러나 일반 사용자들은 이러한 사전지식을 충분히 알고 있지 못하면 웹서비스에 대한 정보 검색을 쉽게 할 수 없다. 그러므로 일반 사용자들을 위해 웹서비스에 대한 정보를 카테고리에 맞게 분류하여 검색을 용이하게 할 수가 있다. 따라서 본 논문에서는 보다 효율적으로 웹서비스 정보를 분류하기 위해서 유전자 알고리즘과 신경망을 이용한 클러스터링 기법을 제안하는데 목적이 있다.
움직이는 물체의 시공간 분석을 위한 동영상 빅 데이터 처리 방안
정승원 ( Seungwon Jung ),김용성 ( Yongsung Kim ),정상원 ( Sangwon Jung ),김윤기 ( Yoonki Kim ),황인준 ( Eenjun Hwang ) 한국정보처리학회 2017 한국정보처리학회 학술대회논문집 Vol.24 No.1
최근 블랙박스 및 CCTV 같은 영상 촬영 장치가 보편화되면서, 방대한 양의 영상 데이터가 실시간으로 생성되고 있다. 만약 이 대용량 데이터 안의 차량 정보를 추출할 수 있다면 범죄 차량 추적, 교통 혼잡도 측정 등의 활용이 가능할 것이다. 이를 구현하기 위해서는 수많은 자동차에서 실시간으로 생성되는 영상 데이터를 처리할 수 있는 시스템이 필수적이나, 이러한 시스템을 찾기 힘든 것이 현실이다. 이를 위해 이 논문에서는 아파치 카프카, Hbase를 이용한 영상 빅데이터 처리 시스템을 제안한다. 아파치 카프카는 시스템 내에서 영상 손실이 없는 전송과 영상 처리 노드의 스케줄링을 수행하며, Hbase는 처리된 데이터를 테이블로 저장하고 사용자가 보낸 쿼리를 처리한다. 더불어, Hbase에 인덱스를 구성하여 빠른 쿼리 처리가 가능하도록 만든다. 실험 결과, 제안된 시스템은 인덱스가 없을 때보다 뛰어난 쿼리 처리 성능을 보이는 것을 확인할 수 있었다.
Shih, Yu-Ru V.,Hwang, YongSung,Phadke, Ameya,Kang, Heemin,Hwang, Nathaniel S.,Caro, Eduardo J.,Nguyen, Steven,Siu, Michael,Theodorakis, Emmanuel A.,Gianneschi, Nathan C.,Vecchio, Kenneth S.,Chien, Shu National Academy of Sciences 2014 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF Vol.111 No.3
<P>Synthetic matrices emulating the physicochemical properties of tissue-specific ECMs are being developed at a rapid pace to regulate stem cell fate. Biomaterials containing calcium phosphate (CaP) moieties have been shown to support osteogenic differentiation of stem and progenitor cells and bone tissue formation. By using a mineralized synthetic matrix mimicking a CaP-rich bone microenvironment, we examine a molecular mechanism through which CaP minerals induce osteogenesis of human mesenchymal stem cells with an emphasis on phosphate metabolism. Our studies show that extracellular phosphate uptake through solute carrier family 20 (phosphate transporter), member 1 (SLC20a1) supports osteogenic differentiation of human mesenchymal stem cells via adenosine, an ATP metabolite, which acts as an autocrine/paracrine signaling molecule through A2b adenosine receptor. Perturbation of SLC20a1 abrogates osteogenic differentiation by decreasing intramitochondrial phosphate and ATP synthesis. Collectively, this study offers the demonstration of a previously unknown mechanism for the beneficial role of CaP biomaterials in bone repair and the role of phosphate ions in bone physiology and regeneration. These findings also begin to shed light on the role of ATP metabolism in bone homeostasis, which may be exploited to treat bone metabolic diseases.</P>