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오늘 본 자료
유전체 염기서열의 base - composition에 대한 연구
정철희(Chol-Hee Jung),윤경오(Kyong-Oh Yoon),최진영(Jin-Young Choi),박현석(Hyun-Seok Park) 한국정보과학회 2001 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.28 No.1A
생물체가 생명을 영위하기 위해 수행하는 모든 기능들에 대한 정보는 각 개체가 가지고 있는 유전체에 들어있다. 그런데 각 생물체마다, 심지어는 한 생물체의 서로 다른 염색체마다 그 전체 염기서열에서의 base-composition 은 같지 않고, 또한 이 구성비에는 일정한 특징이 있다. 따라서 이 논문에서는 각 생물체들의 전체 염기서열을 구성하는 염기의 구성비에 대해 조사하고 비교해 보고자 한다.
Fragment Assembly를 위한 시스템의 설계 및 구현
김명선(Myung-Sun Kim),정철희(Chol-Hee Jung),박현석(Hyun-Seok Park) 한국정보과학회 2001 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.28 No.1A
지금까지 인간이나 다른 생물체의 전체 유전체 염기서열을 밝혀내는 작업은 크게 세가지 방법으로 진행되었다. Clone-by-clone approach, sequence tagged connector approach, random shotgun approach[1]가 그것인데 마지막의 random shotgun approach는 fragment assembly problem을 비롯한 여러 가지 전산학적인 문제들을 수반한다. 미생물체의 전체 염기서열을 random shotgun approach를 이용하여 밝혀낼 때 몇 가지 전산학적인 문제가 테크닉이 필요하며 그 중에서도 서열간의 forward, reverse의 mating 정보를 이용하는 것이 매우 중요하다. 본 논문은 이러한 mating 작업을 한 눈에 볼 수 있게 하는 소프트웨어 패키지 “Mater”에 대해 소개하고자 하며 그 의미에 대해 논하고자 한다.