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      • KCI등재

        ‘홍로’ 사과 과피 및 과육의 단백질체 비교 분석

        정정성(Jung-Sung Chung),최성환(Sung Hwan Choi),김재호(Jae Ho Kim),심수용(Soo Yong Shim),모크 아드난(Moch R. Adnan),장은실(Eun-Sil Chang),손영걸(Young-Geol Sohn),김윤희(Yun-Hee Kim),김진국(Jin Gook Kim),이증주(Jeung Joo Lee) 한국원예학회 2021 원예과학기술지 Vol.39 No.2

        국내 육종 사과 품종인 ‘홍로’의 과피와 과육에서 발현되는 단백질체를 추출하여 이차원 전기영동으로 분리하였다. 그 결과 대부분의 단백질들은 과피와 과육에서 유사한 정도로 발현되었으나, 30개의 단백질 spot들은 과피 또는 과육에서의 발현 정도가 2배 이상 차이가 났다. 이들 중 25개는 과피에서, 5개는 과육에서 더 높게 발현되었다. 이들 단백질들을 MALDI-TOF/TOF로 분석한 결과, 과피에서 더 높게 발현된 단백질 spot들 중 18개는 각각의 기능을 갖는 단백질로 동정 되었고, 나머지 7개는 기능이 밝혀지지 않은 것으로 동정되었거나 미동정 되었다. 과육에서 더 높게 발현된 단백질 spot들의 경우 2개는 각각의 기능을 갖는 단백질로 동정 되었고, 나머지 3개는 미동정 되었다. 과피에서 더 높게 발현된 단백질은 에틸렌의 생합성과 관련된 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog(spot 21번), 이차대사산물의 생합성과 관련된 acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1(spot 148), acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1-like(spot 316) 및 8-hydroxygeraniol dehydrogenase-like(spot 348), 광합성과 관련된 oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic(spot 210) 및 ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit(spot 273), 생체방어 및 스트레스 반응과 관련된 (+)-neomenthol dehydrogenase-like(spot 216 및 219), formate dehydrogenase, mitochondrial(spot 305), glutathione S-transferase-like(spot 483 및 484) 및 acidic endochitinase SE 2-like, partial(spot 391 및 392), 항산화효소인 L-ascorbate peroxidase 2(spot 221), 알레르기 관련 단백질인 MLP-like protein 34(spot 406), major allergen Mal d 1(spot 451 및 452) 및 major allergen Mal d 1.06A01(spot 457)이었다. 한편 과육에서 더 높게 발현된 단백질은 protein folding과 관련된 chaperonin 60 subunit alpha 1, chloroplastic(spot 8) 및 탄수화물 대사와 관련된 NADP-dependent D-sorbitol-6-phosphate dehydrogenase(spot 380)이었다. 이상의 연구 결과들은 사과의 육종, 저장, 품질, 환경에 대한 내성 등과 관련된 광범위한 연구에 유용하게 이용될 수 있을 것으로 사료되었다. The proteome expressed in the peel and flesh of ‘Hongro’, a domestic breeding apple cultivar, was extracted and separated by two-dimensional electrophoresis. Most of the proteins were expressed at similar levels in the peel and flesh, but 30 protein spots showed a difference of more than two times higher in expression level in the peel and flesh. Of these, 25 were higher in the peel and 5 were higher in the flesh. By analyzing these proteins with MALDI-TOF/TOF, 18 of the protein spots that were higher in the peel were identified as proteins with their respective functions, and the remaining 7 were identified as having unknown function or were unidentified. In the case of the protein spots expressed higher in the flesh, two were identified as proteins having respective functions, and the other three were unidentified. Proteins more highly expressed in the peel were 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog (spot 21) related to the biosynthesis of ethylene; acetyl-CoA acetyltransferase (spot 148), cytosolic 1, acetyl-CoA acetyltransferase, cytosolic 1-like (spot 316) and 8-hydroxygeraniol dehydrogenase-like (spot 348) related to the biosynthesis of secondary metabolites; oxygen-evolving enhancer protein 1, chloroplastic (spot 210), and ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase large subunit (spot 273) related to the photosynthesis;(+)-neomenthol dehydrogenase-like (spot 216 and 219), formate dehydrogenase, mitochondrial (spot 305), glutathione S-transferase-like (spot 483 and 484), and acidic endochitinase SE 2-like, partial (spot 391 and 392) related to the biological defense and stress response; and antioxidant enzyme L-ascorbate peroxidase 2 (spot 221), MLP-like protein 34 (spot 406), major allergen Mal d 1 (spot 451 and 452), and major allergen Mal d 1.06A01 (spot 457) related to allergies. On the other hand, proteins that were more highly expressed in the flesh were chaperonin 60 subunit alpha 1, chloroplastic (spot 8) related to protein folding, and NADP-dependent D-sorbitol-6-phosphate dehydrogenase (spot 380) related to carbohydrate metabolism. These results will be useful in a wide range of studies related to apple breeding, storage, quality, and environmental tolerance.

      • SCOPUSKCI등재

        큐어링 후 저장에 따른 고구마 저장뿌리 단백질체의 비교분석

        신호용,지창윤,김호수,정정성,최성환,곽상수,김윤희,이증주,Ho Yong Shin,Chang Yoon Ji,Ho Soo Kim,Jung-Sung Chung,Sung Hwan Choi,Sang-Soo Kwak,Yun-Hee Kim,Jeung Joo Lee 한국식물생명공학회 2023 JOURNAL OF PLANT BIOTECHNOLOGY Vol.50 No.1

        고구마(Ipomoea batatas L. Lam)는 영양소, 가공 식품, 동물 사료 및 색소 재료의 유용한 공급원으로 이용 가능한 경제적으로 중요한 대표적인 뿌리 작물이다. 일반적으로 고구마의 저장 뿌리는 수확 후 저장 기간 동안 다양한 미생물과 질병에 의한 부패에 노출되기 쉽다. 수확 후 큐어링은 저장기간 동안 상처를 치유하고 미생물에 의한 부패를 방지하기 위한 가장 적합한 수단으로 알려져 있다. 본 연구에서는 큐어링과 연관된 분자적 기작에 관여하는 단백질들을 확인하기 위해, 큐어링 처리 후 저장기간 동안 단백질체의 변화를 분석하였다. 33℃ (큐어링) 및 15℃ (대조군)에서 3일 동안 처리하고 8주의 저장 기간이 지난 후 2D 전기영동 분석을 통해 단백질 spot의 변화를 확인한 결과, 31개 단백질 spot의 발현량이 차이 나는 것을 확인하였으며, 이들 중 15개의 단백질 spot을 동정하여 그 특성을 분석하였다. 동정된 단백질 중 alphaamylase (spot 1)는 큐어링 처리구에서만 발현량이 증가하였으며, probable aldo-keto reductase 2-like (spot 3) 및 hypothetical protein CHGG_01724 (spot 4)는 큐어링 및 대조구에서 동시에 발현량이 증가하였으나, sporamin A (spot 10)는 큐어링 및 대조구에서 발현량이 감소하였다. 한편, 대조구에서 enolase (spot 14)는 발현량이 증가하였으나, chain A of actinidin-E-64 complex+ (spot 19), ascorbate peroxidase (spot 22) 및 여러 sporamin 단백질들(spot 20, 21, 23, 24, 27, 29, 30 및 31)은 발현량이 감소하였다. 본 연구의 결과는 고구마 저장 뿌리에서 큐어링 처리와 관련된 단백질의 동정 및 수확 후 저장 기간동안 병 저항성과 관련된 기작에 대한 이해를 높이며, 향후 저온 저장 능력이 향상된 신품종 개발을 위한 후보 유전자의 도출에도 기여할 수 있을 것이다. Sweet potato (Ipomoea batatas L. Lam) is an economically important root crop and a valuable source of nutrients, processed foods, animal feeds, and pigment materials. However, during post-harvest storage, storage roots of sweet potatoes are susceptible to decay caused by various microorganisms and diseases. Post-harvest curing is the most effective means of healing wounds and preventing spoilage by microorganisms during storage. In this study, we aimed to identify proteins involved in the molecular mechanisms related to curing and study proteomic changes during the post-curing storage period. For this purpose, changes in protein spots were analyzed through 2D-electrophoresis after treatment at 33℃ (curing) and 15℃ (control) for three days, followed by a storage period of eight weeks. As a result, we observed 31 differentially expressed protein spots between curing and control groups, among which 15 were identified. Among the identified proteins, the expression level of 'alpha-amylase (spot 1)' increased only after the curing treatment, whereas the expression levels of 'probable aldo-keto reductase 2-like (spot 3)' and 'hypothetical protein CHGG_01724 (spot 4)' increased in both the curing and control groups. However, the expression level of 'sporamin A (spot 10)' decreased in both the curing and control treatments. In the control treatment, the expression level of 'enolase (spot 14)' increased, but the expression levels of 'chain A of actinidin-E-64 complex+ (spot 19)', 'ascorbate peroxidase (spot 22)', and several 'sporamin proteins (spot 20, 21, 23, 24, 27, 29, 30, and 31)' decreased. These results are expected to help identify proteins related to the curing process in sweet potato storage roots, understand the mechanisms related to disease resistance during post-harvest storage, and derive candidate genes to develop new varieties with improved low-temperature storage capabilities in the future.

      • KCI등재

        경남지방 수집종 올챙이고랭이의 ALS 저해 제초제에 대한 저항성 기작

        심수용(Soo Yong Shim),최성환(Sung Hwan Choi),김재호(Jae Ho Kim),정정성(Jung-Sung Chung),가유강(WeiQiang Jia),박기웅(Kee Woong Park),이증주(Jeung Joo Lee) 한국잡초학회·한국잔디학회 2020 Weed & Turfgrass Science Vol.9 No.4

        본 연구는 경상남도 8개의 시군에서 수집한 20개의 올챙이고랭이 수집종의 ALS 저해 제초제에 대한 저항성 정도를 확인하고, 그 원인을 구명하기 위해 수행되었다. 여러 올챙이고랭이 수집종들 가운데 고성28번은 penoxsulam 및 flucetosulfuron에 대해 매우 높은 저항성을 나타냈다. als 유전자 염기서열 분석 결과 고성28번 수집종에서는 돌연변이가 발견되지 않았다. 또한, ALS의 in vitro 활성 측정 결과, 고성28번은 penoxsulam에 대해 감수성을 나타낸 통영238번과 큰 차이가 없었다. 한편 고성28번에 대하여 P450 inhibitor인 fenitrothion의 전처리 시 penoxsulam과 flucetosulfuron에 대한 감수성이 현저하게 증가하였다. 상기의 결과로부터 ALS 저해 제초제에 대한 고성28번의 저항성은 als의 돌연변이나 효소 활성의 증가에 의한 것이 아니고, P450의 NTSR에 의한 것으로 사료되었다. 한편 flucetosulfuron에 대한 함안135 및 통영 238번의 낮은 저항성은 als 유전자의 Pro197이 Ser 및 Ala으로 돌연변이된 것에 기인하는 것으로 판단되었다. 상기의 연구는 ALS저해형 제초제에 대한 올챙이고랭이의 비작용점 저항성과 관련된 최초의 보고이며, 올챙이고랭이의 제초제 저항성 관련 연구를 위한 중요한 참고자료로 활용될 수 있을 것이다. This study was conducted to determine the degree of resistance and resistance mechanism to acetolactate synthase (ALS) inhibiting herbicides in Scirpus juncoides biotypes collected in eight cities and counties in Gyeongsangnam-do. Among the S. juncoides biotypes, Goseong28 biotype was highly resistant to penoxsulam and flucetosulfuron. Based on the als gene sequencing, no mutation was found in the Goseong28 biotype. When the ALS activity of Goseong28 biotype was compared with Tongyeong238 biotype which was susceptible to penoxsulam, no significant difference was found. On the other hand, the sensitivity to penoxsulam and flucetosulfuron in the Goseong28 biotype was significantly increased in pretreatment of fenitrothion, a P450 inhibitor. It was considered that the resistance to the ALS-inhibiting herbicide in the Goseong28 biotype was not due to the mutation of als or an increase in enzymatic activity, but due to the non-target site resistance (NTSR) of P450. The low resistance to flucetosulfuron in Haman135 and Tongyeong238 was considered to be due to mutations of Pro197 of the als gene to Ser and Ala. This is the first report related to the NTSR in the S. juncoides to ALS-inhibiting herbicides, and may be used as an important reference material for studies related to the herbicide resistance in S. juncoides.

      • KCI등재

        연구보문 : 자연과학 ; 수수 포장출현력 예측을 위한 종자세 적합도 검사

        김석현 ( Seok Hyeon Kim ),이명희 ( Myeong Hee Lee ),강경희 ( Kyeong Hee Kang ),박민우 ( Min Woo Park ),심상인 ( Sang In Shim ),정정성 ( Jung Sung Chung ),나영왕 ( Young Wang Na ) 한국국제농업개발학회 2013 韓國國際農業開發學會誌 Vol.25 No.1

        본 연구는 실험실에서 인위노화처리로 종자활력을 조절한 후 실시한 몇 가지 종자세 검정치와 포장출현력과의 관계를 설정하여 수수의 포장출현력 예측에 가장 적합한 종자세 검사 방법을 구명하고자 수행하였다. 수수 종자의 종자세가 높은 상태에서는 표준발아검사에서의 유아장이 포장출현력 예측에 효과적이며, 노화된 종자에서는 저온발아검사(CGT)에서의 정상묘율이 포장출현율과 높은 상관관계를 가지고 있었다(r = -0.998, p < 0.01). 포장출현력 예측에 효과적인 몇가지 종자세지수를 이용하여 stepwise multiple regression 분석을 실시한 결과 표준발아검사에서의 종자세 지수(vigor, SGT)가 95%의 높은 포장출현력 예측효과를 나타내었으며, 표준발아검사에서의 정상묘율(% normal seedling), 테트라졸리움의 종자세(vigor, TZ), 저온검사(cold test)에서의 정상묘율과 저온발아검사(CGT)에서의 정상 묘율과 같은 변수를 회귀방정식에 추가함에 따라 포장출현율 예측효율을 증가시킬 수 있었다. 표준발아검사와 저온발아검사는 노화정도가 다른 수수 종자의 종자세 검사방법으로 적합하다고 사료된다. In this study, several attempts were made to develop prediction method based on regression analysis for field emergence of sorghum using various seed vigor tests in laboratory. Sorghum seeds artificially aged to provide various levels of seed quality were evaluated by the standard germination test (SGT), cool germination test (CGT), cold germination test (CT), tetrazolium vigor test, electroconductivity test and complex stressing vigor test (CSVT). The most suitable criterion for identifying the degree of seed vigor was plumule length in the seeds shown higher seed vigor in the SGT. The field emergence rate and % normal seedling were highly correlated with performance in the aged condition (lowered seed vigor) of the CGT (r = -0.998, p < 0.01). In a multiple correlation analysis, seed vigor in the SGT accounted for 95% of the variation in seedling emergence in sorghum. Also, % normal seedling in SGT, TZ vigor test, % normal seedling in cold test (CT) and cool germination test (CGT) were useful for predicting field emergence in sorghum. The standard and cool germination tests therefore appear to be suitable for evaluating a wide range of seed vigor of sorghum seeds in field and could be used as a rapid vigor test.

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