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      • SCOPUSKCI등재

        Transformation-associated recombination cloning에 의한 유전자 분리에 사용되는 target hook에 대한 GC content의 영향

        김중현,신영선,윤영호,장형진,김은아,김광섭,정정남,박인호,임선희 한국미생물학회 2003 미생물학회지 Vol.39 No.3

        Transformation-associated recombination (TAR) 클로닝법은 목적 유전자를 포함한 게놈 DNA와 그 유전자의 5' 또는 3' 말단 서열을 포함하고 있는 선형의 TAR vector를 동시에 출아효모의 spheroplast내로 co-penetration 시켜 상동부위에서 일어나는 재조합에 의해 환형의 Yeast Artification Chromosome(YAC)으로 분리되는 방법이다. 일반적으로 TAR 클로닝법에 의한 목적의 single-copy 유전자 분리 빈도는 전체 형질전환체의 0.01~1% 정도이다. 이러한 TAR 클로닝법을 개선하기 위하여 Tg.AC transgenic mouse를 모델계로 사용하여 유전자 분리에 대한 target hook 내의 GC content 가 미치는 영향을 조사하였다. 이러한 목적으로 한쪽에는 다양한 GC content(18~45%)를 지닌 transgene 특이적 hook을 포함하고 다른 한쪽은 B1 반복서열을 가지는 radial TAR vector를 사용하여 transgene 분리 빈도를 측정하였다. 그 결과 target hook의 GC content는 23% 이하의 경우, ~40%인 경우에 비해 두 배 정도 클로닝 빈도가 감소하였다. 따라서 TAR vector를 제작할 때, 유전자 분리에 이용되는 target hook의 GC content는 약 40% 일때 가장 적정한 것으로 나타났다. 또한 높은 target hook 내의 GC content(65%)위치분포에 의한 차이는 클로닝 빈도에 큰 영향을 미치지 않는 것으로 나타났다. Transformation-associated recombination (TAR) cloning is based on co-penetration into yeast spheroplasts of genomic DNA along with TAR vector DNA that contains 5'- and 3'-sequences (hooks) specific for a gene of interest, followed by recombination between the vector and the human genomic DNA to establish a circular YAC. Typically, the frequency of recombinant insert capture is 0.01-1% for single-copy genes by TAR cloning. To further refine the TAR cloning technology, we determined the effect of GC content on target hooks required for gene isolation utilizing the $Tg\cdot\AC$ mouse transgene as the targeted region. For this purpose, a set of vectors containing a B1 repeated hook and Tg AC-specific hooks of variable GC content (from 18 to 45%) was constructed and checked for efficiency of transgene isolation by radial TAR cloning. Efficiency of cloning decreased approximately 2-fold when the TAR vector contained a hook with a GC content ~${\leq}23$% versus ~40%. Thus, the optimal GC content of hook sequences required for gene isolation by TAR is approximately 40%. We also analyzed how the distribution of high GC content (65%) within the hook affects gene capture, but no dramatic differences for gene capturing were observed.

      • KCI등재

        치악산국립공원 성남지구 관속식물의 고도별 수직분포

        김중현,안지홍,홍정기,김선유,박성애,이병윤,박찬호 경상대학교 농업생명과학연구원 2016 농업생명과학연구 Vol.50 No.5

        치악산국립공원 성남지구의 고도별 온도변화에 따른 관속식물의 수직분포 및 분포변화를 파악하기 위 해 성남공원지킴터(450m)에서 남대봉(1,181m)까지 해발 100m단위로 등분하여 8개 구간에 대한 식물목 록을 작성하였다. 총 4회에 걸쳐 현지조사를 실시한 결과 관속식물은 99과 275속 419종 6아종 39변종 5 품종 1교잡종의 총 470분류군으로 조사되었다. 해발 600m(WI=78.2℃·month)를 경계로 관속식물의 출 현종 수가 급격히 감소하였다. 귀화식물은 저지대(해발 600m 이하)에서 높은 비율로 출현하였다. DCA기 법을 이용하여 출현종의 고도별 분포변화를 분석한 결과, 해발 600m와 900m를 경계로 3개의 그룹으로 구분되었다. 구간별 관속식물 분포의 유사성 및 상이성을 확인함으로써, 고도에 따른 온도변화가 그 식 물분포의 양상에 영향을 미칠 수 있음을 확인할 수 있었다. 호적범위는 식물종의 분포를 결정하기 때문 에 기후변화에 의한 기온상승은 현재 생물종의 분포와 그 다양성에 영향을 미칠 것으로 판단된다. 따라 서 식물의 생태․환경적 특징과 분포역, 생육지의 변화를 파악하기 위한 지속적인 모니터링이 필수적이다. 나아가 이러한 자료를 토대로 기후변화에 따른 식물자원의 보전 및 관리방안을 마련해야 할 것이다. In order to investigate vertical plant distribution on Seongnam district of Chiaksan National Park, vascular plants of eight areas with 100-meter-high difference were surveyed from the Seongnam park ranger post(450m elev.) to the Namdaebong(1,181m elev.). The vascular plants identified during the four-round field surveys were a total of 470 taxa: 99 families, 275 genera, 419 species, 6 subspecies, 39 varieties, 5 forms and 1 hybrid. Around 600m high, species diversity of vascular plants decrease rapidly. The proportion of exotic species is the highest in the lowland(below 600m elev.). The detrended correspondence analysis(DCA) divided distribution of vascular plants into three groups; areas below 600m elev., 600~900m elev., and areas above 900m elev. These results showed that similarity and dissimilarity of distribution of vascular plants has high correlation with elevation. Also, change of distribution of vascular plants was directly affected by climate elements. Continuous monitoring is necessary to confirm eco-environmental characteristics of vascular plants and changes of their optimal ranges. Based on results of this monitoring, conservation and management measures of plant resources will be prepared against climate change.

      • SCOPUSKCI등재
      • 미소물체의 변형 측정을 위한 광학적 방법

        김중현,김기세,문성수 전남도립대학교 1999 전남도립대학교 논문집 Vol.S No.-

        Rapid development of micromaching techology has recently attracted considerable attention in the application of microstructure in many ares. In this paper, the principle, the merits and the demerits of methods such as moire, holography and ESPI which apply optics to measure displacement of microstructure are investigated. Through the wide review, we evalute the design criteria for the future application. They should have high sensitivity, possibility of continuous monitoring, 3-dimentional measurement, easy installation, operation and maintenance and cost effectiveness.

      • KCI등재
      • KCI등재

        한반도 동해안 석호의 관속식물상

        김중현,김선유,홍정기,남기흠,안지홍,이병윤,김진석,Kim, Jung-Hyun,Kim, Sun-Yu,Hong, Jeong-Ki,Nam, Gi-Heum,An, Ji-Hong,Lee, Byoung Yoon,Kim, Jin-Seok 한국식물분류학회 2017 식물 분류학회지 Vol.47 No.1

        동해안 석호는 해수와 담수가 섞인 독특한 형태의 기수호이며, 수변식생이 발달되어 생물다양성이 풍부한 지역이다. 본 연구는 국내에 분포하는 17개소의 석호에 대한 식물상과 식물 종조성 등의 조사를 통하여 석호 식생에 대한 안정적인 보전계획 수립을 위한 기초자료를 제시하고자 한다. 17개소의 석호에 대한 식물상 조사결과, 관속식물은 118과 378속 655종 13아종 46변종 6교잡종, 총 720분류군이 확인되었다. 이중에서 한반도 고유종이 11분류군, 멸종우려 식물이 18분류군, 식물구계학적 특정식물인 IV-V등급 식물이 23분류 군이었다. 남방계식물은 4분류군, 북방계식물은 8분류군으로 조사되었고, 특히 남한 내 희귀식물인 갯활량나물(Thermopsis lupinoides), 기름당귀(Ligusticum hultenii), 벼룩아재비(Mitrasacme alsinoides), 통발(Utricularia australis), 검정납작골풀(Juncus fauriei), 새방울사초(Carex vesicaria), 천도미꾸리광이(Puccinellia kurilensis) 등이 동해안 석호에서 생육하고 있었다. 외래식물은 96분류군이 발견되었다. 한반도 석호는 식물다양성이 풍부하고, 희귀식물 및 식물지리학적 중요한 식물이 관찰된다. 석호의 효과적인 관리와 생물다양성 보전을 위해 체계적인 사항들이 논의되었다. Eastern coastal lagoons are a particular type of estuarine systems where seawater mixes with fresh water from their catchments. With the development of aquatic vegetation, this area shows high level of biodiversity. The purpose of this study is to produce a strategy for the comprehensive conservation of the vegetation of coastal lagoons through studies of the floristics and plant species compositions in 17 eastern coastal lagoons in Korea. Vascular plants were collected 109 times, from June of 2010 to November of 2014. The results showed that there were 720 taxa in total, including 118 families, 378 genera, 655 species, 13 subspecies, 46 varieties, and 6 hybrids. Korean endemic species numbered 11 taxa, and vascular plants listed in the red list according to the International Union for Conservation of Nature (IUCN) numbered 18 taxa. Indicator species of fourth (IV) and fifth (V) degree, as specified by floristic subregions, numbered 23 taxa. Among the species investigated in this survey, there were 4 taxa of plants of southern origin and 8 taxa of plants of northern originin the Korean peninsula. Several rare plants, Thermopsis lupinoides, Ligusticum hultenii, Mitrasacme alsinoides, Utricularia australis, Juncus fauriei, Carex vesicaria, and Puccinellia kurilensis, were distributed in eastern coastal lagoons. In all, 96 alien plants were recorded in the investigated area. The coastal lagoons on the eastern coast of Korea showed high plant diversity with many rare plants and phytogeographically important plants. Conservation strategies to ensure biodiversity and effective management of coastal lagoons are discussed in detail.

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