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간세포암에서 representational difference analysis를 이용한 다양하게 발현되는 유전자의 발견
탁원영 ( W. Y. Tak ),조창민 ( C. M. Cho ),권영오 ( Y. O. Kweon ),김성국 ( S. K. Kim ),최용환 ( Y. H. Choi ),정준모 ( J. M. Chung ),정은영 ( E. J. Chung ),( Mohammad Farooq ),황선영 ( S. Y. Hwang ),김영희 ( Y. H. Kim ),임상욱 ( S. 대한소화기학회 2002 대한소화기학회 춘계학술대회 Vol.2002 No.-
<Introduction> Representational difference analysis (RDA) combined with cDNA arrays is an effective approach to identify differentially expressed genes. To identify differentially expressed genes in human hepatocellular carcinoma (HCC), we used RDA for a
인체세포주에서 저선량 99mTc 에 의해 발현되는 방사선 적응반응에 관련된 유전자에 관한 연구
권안성(An Sung Kwon),범희승(Hee Seung Bom),최찬(Chan Choi),김지열(Ji Yeul Kim),임욱빈(Wook Bin Lim) 대한핵의학회 2001 핵의학 분자영상 Vol.35 No.5
N/A Purpose: The purpose of this study was to search activated genes that could be related to radiation adaptive response (RAR) induced by low-level radiation from 99mTc in human cell lines. Methods : We used gene discovery array (GDA) and representational difference analysis (RDA) methods. 99mTc-pertechnetate was added to 2 x 106/mL NC-37 cells (human lymphoblastic cells) to make concentrations ranging from 148 MBq/mL to 148 Bq/mL by serial 10 fold dilutions. After 44 hours, 2 Gy gamma irradiation was given to them using a Cs-137 cell irradiator. Results: As compared to the control (Con) group to which no 99mTc was added, those cells to which 148 and 14.8 KBq of 99mTc were added showed significantly lower damage to chromosomes, which was evaluated by metaphase analysis. Cells with 148 KBq 99mTc (T148 group) showed most significant protection. Activated genes in the T148 group as compared to Con group were evaluated by GDA and RDA methods. GDA revealed genes of casein kinase 2 (CK2) beta chain, immunoglobulins (Ig), human leukocyte antigen (HLA)-B, and two novel genes. Twenty RAR related clones were selected by RDA method. The size of those genes was from 234 to 603 base pairs. Conclusions: RAR was induced by low dose irradiation from 99mTc in NC-37 cell lines. Genes related to the response included CK2, Ig, HLA-B in human lymphoblastic cell lines. (Korean J Nucl Med 2001:35: 313-323)
Su-Ryun Kim,Hyun-Joo Park,Soo-Kyung Bae,Ji-Hyun Park,Hyo-Sun Kim,Tae Hyeon Koo,Moon-Kyoung Bae KOREAN ACADAMY OF ORAL BIOLOGY 2008 International Journal of Oral Biology Vol.33 No.4
Porphyromonas gingivalis, a major periodontal pathogen, has been implicated in the initiation and progression of periodontal disease. Endothelial dysfunction (Editor note: Aberrant and dysfunction are somewhat redundant. The authors may want to choose one or the other.) contributes to chronic periodontal inflammation. Using cDNA-representational difference analysis, we found that P.gingivalis lipopolysaccharide differentially induces a number of genes in human microvascular endothelial cells. Among these upregulated genes, we focused on intercellular adhesion molecule-1 (VCAM-1), which is crucial for leukocyte recruitment during vascular inflammation. P. gingivalis LPS significantly increased the expression of vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1) as well as ICAM-1. Promoter assays revealed that the transcription of these cell adhesion molecules was mainly regulated by nuclear factor-κB (NF-κB) in endothelial cells. Furthermore, P. gingivalis LPS significantly increased leukocyte adhesiveness to microvascular endothelial cells and to aortic endothelium. Taken together, our results demonstrate that P. gingivalis LPS activates microvascular endothelial cells through NF-κB-dependent expression of cell adhesion molecules.
표상 유사성 분석을 이용한 연령별 얼굴 정서 차원 비교
김종완 한국감성과학회 2023 감성과학 Vol.26 No.1
기존의 연령별 얼굴정서 인식 비교 연구에서는 정서별로 연령 간에 어떤 차이가 있는지 밝혔다. 이에 Kim(2021) 연구에서는 개별 정서가 아닌 정서공간에서 표상된 정서를 연령 간 비교하였다는 점에서 의의가 있으나, 기술적(descriptive) 비교만 시행하였을 뿐, 통계적 유의미 검증을 하지 않았다는 한계가 있다. 본 연구에서는 표상 유사성분석(representational similarity analysis) 방법을 통해 연령간 실제 데이터 및 정서 모델 유사성행렬을 직접적으로비교하였다. 또한 개인차 다차원척도법(individual differences multidimensional scaling)을 통해 연령간 정서 차원에대한 비중을 비교하였다. 그 결과 실제 데이터 비교에서 노년 집단은 청년 및 중년 집단과 가장 유사하지 않았으며, 쾌불쾌 차원이 포함된 정서 모델과의 유사성 비교에서도 가장 유사하지 않았다. 또한 노년 집단은 각성 차원에 대한비중이 청년 및 중년 집단과 유사하지 않음이 발견되었다. 본 연구는 실제 데이터, 정서 모델, 그리고 정서 차원비중이라는 세 가지 측정치에 대해 노년 집단과 청년 및 중년 집단과의 차이를 통계적으로 검증하였다는 점에서의의가 있다.