Sorangium cellulosum 균주들의 에포틸론 생합성 유전자 보존

현혜숙,윤진권,조경연,Hyun, Hye-Sook,Youn, Jin-Kwon,Cho, Kung-Yun 한국미생물학회 2011 미생물학회지 Vol.47 No.2

국내에서 분리된 에포틸론 생산 점액세균 Sorangium cellulosum KYC3013의 에포틸론 생합성 유전자군(epoA~F, epoK)을 클로닝하였다. 이 유전자들이 암호화하고 있는 단백질들의 아미노산 서열을 다른 대륙 또는 나라에서 분리된 S. cellulosum SMP44, S. cellulosum So ce90, S. cellulosum So0157-2의 단백질들과 비교한 결과 서로 97.4-99.8% 동일하였다. 이러한 결과는 에포틸론 생합성 유전자들이 S. cellulosum 균주들 사이에서 잘 보존되어 있음을 보여주었다. The epothilone biosynthetic gene cluster (epoA~F, epoK) of Sorangium cellulosum KYC3013, an epothilone producing myxobacterium isolated in Korea, was cloned. When the amino acid sequences of the encoded proteins were compared with those from S. cellulosum SMP44, S. cellulosum So ce90, and S. cellulosum So0157-2, which were isolated in other continents or country, the proteins from different strains were 97.4-99.8% identical each other. This suggested that the epothilone-biosynthetic gene clusters are well conserved in S. cellulosum strains.

Myxococcus stipitatus의 자실체 형성을 위한 배지 조성

현혜숙,최주오,안동주,조경연,Hyun, Hyesook,Choi, Juo,An, Dongju,Cho, Kyungyun 한국미생물학회 2019 미생물학회지 Vol.55 No.2

점액세균 Myxococcus stipitatus는 순수분리를 위한 농화배양 과정에서는 자연기질 표면에서 자루가 달린 구형 자실체를 형성한다. 하지만 순수 분리된 균주가 이러한 형태의 자실체를 형성하도록 하는 한천배지는 알려져 있지 않다. M. stipitatus DSM 14675 균주는 CYS 평판배지에서 반구형 자실체 유사 구조물을 형성하므로 CYS 배지 성분이 자실체 형성에 미치는 영향을 조사하였다. 그리고 이를 기초로 M. stipitatus 세포들이 구에 자루가 달린 자실체를 형성하는 한천배지 조성을 개발하였다. 본 연구에서는 또 이와 함께 M. stipitatus DSM 14675 균주가 분산하여 성장하는 액체배지도 개발하였다. Myxococcus stipitatus, a myxobacterium, forms spherical fruiting bodies with stems on edaphic substrates in enrichment cultures for isolation. However, an agar medium on which purely isolated strains of M. stipitatus form this type of fruiting bodies has not been known until now. In this study, since M. stipitatus DSM 14675 forms a hemispherical fruiting body-like structure on CYS agar medium, the effects of CYS medium components on fruiting body formation were investigated. Based on the results obtained, an agar medium on which M. stipitatus forms spherical fruiting bodies with stems was developed. Additionally, a liquid medium in which M. stipitatus grows in a dispersed manner was also formulated in this investigation.

셀룰로오스 분해성 점액세균 Sorangium cellulosum의 분리

현혜숙,정진우,이한빛,윤진권,이차율,김도희,조경연,Hyun, Hye-Sook,Chung, Jin-Woo,Lee, Han-Bit,Youn, Jin-Kwon,Lee, Cha-Yul,Kim, Do-Hee,Cho, Kyung-Yun 한국미생물학회 2009 미생물학회지 Vol.45 No.1

한국의 여러 지역에서 채취한 토양으로부터 셀룰로오스를 유일한 탄소원으로 이용하여 자라는 591균주의 점액 세균을 순수 분리하였다. 세포, 집락, 그리고 자실체의 모양과 같은 형태적인 특징과 16S rRNA 염기서열은 이들 균주들이 모두 Sorangium cellulosum임을 나타내었다. 그리고 생리활성조사는 114균주 중 최소한 20균주가 Candida albicans의 성장을 저해하는 항진균물질을 생산함을 보여주었다. 591 strains of myxobacteria that grew on cellulose as a sole carbon source were isolated from soils collected from various locations in Korea. Morphological characteristics such as the shape of cells, colonies and fruiting bodies and 16S rRNA sequences of the isolates suggested that all the isolates are Sorangium cellulosum. An antifungal assay has indicated that at least 20 strains among the 114 isolates tested produce antifungal substances inhibiting growth of Candida albicans.

영화 속 오타꾸의 사회적 역할에 관한 연구

현혜숙,안혜영(토론자) 한국엔터테인먼트산업학회 2008 한국엔터테인먼트산업학회 학술대회 논문집 Vol.2 No.2

오타쿠란 만화, 애니메이션, 게임, PC, SF, 특수촬영, 피규어(figure), 그 밖에 서로 깊은 연관된 일군의 서브컬쳐(subculture)에 탐닉하는 사람의 총칭이다. 그러나 그들은 누구인가란 물음엔 한마디로 정의하기 어렵다. 정의라는 것도 주제를 어떻게 보느냐에 따라 달라지기 때문이다. 오타쿠라도 전쟁오타쿠, 애니메이션 오타쿠, 건강오타쿠 그리고 오타쿠의 킹까지(동경대에서「오카쿠문화론」을 강의하는 전임강사도 오타쿠)종류도 다양하지만 오타쿠가 세상에 드러났을 때는 엽기적인 사건 때문이었다. 첫번째는 미야자키 쓰토무의 살인사건 이었고 두 번째는 옴 진리교때문이었다. 이때부터 그들을 바라보는 시각은 정신병리로 인식되어 사회가 그들을 바라보는 시각은 아주 부정적이었고 지금도 그 시각으로부터 완전히 자유롭지는 못하다. 그러나 오타쿠를 문화적 측면에서 정의할 때 종류를 가리지 않는 특수한 ‘아이들 문화’ 로 부터 파생된, 즉 진화된 대상이 넓은 아이들 용으로 누구나 재미있어 하는 순수성에서 출발한 것으로 그 안에 있는 깊은 주제나 드라마를 이입시키는 장인의 문화라 할 수 있고 성과 허구라는 측면에서 규정할 땐허구 맥락에 대한 친화성이 높은 사람, 사랑하는 대상을 소유하기 위해 허구화라는 수단에 의존하는 사람이라 정의 할 수있다. 따라서 잘못된 인식으로 그들을 폄하하거나 편견을 배제하기 위해서는 다양한 시각으로 보는 것이 중요하였고 전차남이 에르메스를 만나기 전에 사람과 관계 맺지 않고 피규어에 관심을 두는 시각과 사회적 배경을 다루고자 하였다. 또한 오타쿠 자신이 원하는 것과 환상을 현실로 그대로 옮기는, 즉 피큐어나 인형들을 사고파는 소비의 행위가 키덜트 산업과 연관되고 내적으론 가정 환경과 사회의 가치에 의해 내재아가 존재하는 어덜트칠드런적 성향도 있다란 사실을 밝히고자 하였다. 이 논문은 근대 이성의 합리화에 대치되는 서브컬쳐인 오타쿠의 장인정신이나 예술 세계를 부정하려는 것이 아니라 아즈마 히로키가 주장한 ‘커다란 이야기’가 없는 이 시대에 고독한 폐쇄성을 가진 그들의 성과 가상, 관계성을 얘기하고자 하였다. 인간이 인간에 대한 기억은 사실 정신이 아니라 살의 기억이며 사물의 본질은 특정한 요소에 의해 결정되는 것이 아니라 그 요소들의 관계에 의해 결정된다는, 세상과 관계 맺기를 위한 제언에 의의를 두었다.

학부 미생물학실험 수업에서 분리한 미생물의 계통분류

현혜숙,이선진,조경연 호서대학교 기초과학연구소 2016 기초과학연구 논문집 Vol.24 No.1

2014 년부터 2016 년까지 호서대학교 생명공학전공 미생물학실험 수업을 통하여 학부생들이 토양 및 다양한 시료로부터 분리한 115 균주의 미생물을 16S rRNA 유전 자 염기서열에 기초하여 계통 분류하였고 , 각 미생물들의 항생제 저항성을 조사하였다 . 전체 분리 균주 중 54.8 % 에 해당하는 63 균주가 Firmicutes 문 (phylum )에 속하는 세균이었으며 , 26 균주 (22.6 % )가 Actinobacteria 문,22 균주 (19.1 % )가 Proteobacteria 문,그리고 4 균주 (3.5 % )가 Bacteriodetes 문에 속하는 세균 이었다 . 속 (genus) 별로는 20 속에 속하는 세균들이 분리된 것으로 분석 되었는데,가장 많은 균주가 분리된 속은 Bacillus 로 전체 분리 균주의 45.2 % 에 해당하는 52 균주이었다 . 그 다음으로는 Arthrobacter 15 균주 (13.0 % ), Pseudomonas 13 균주 (11.3%),M ic r o c o c c u s 53 ^(4.3%), Staphylococcus 4 균주 (3.5%) 순이 었으며,나머지 속들은 3 균주 이하로 분리된 것으로 분석되었다 . Ampicillin 에 저항성을 가진 균주는 전체 분리 균주의 36.5% 에 해당하는 42 균주이었으며, chloramphenicol 4 균주 (3.5%), kanamycin 3 균주 (2.6%), tetracyclin 3 균주 (2.6 % )이었다 .

읽기이해부진 아동의 관용어 유형 및 과제제시 방법에 따른 관용어 이해능력

현혜숙,김영태,임동선 한국특수교육학회 2011 특수교육학연구 Vol.46 No.1

The purpose of present study is to compare the ability of idiom comprehension in school-aged poor reading comprehenders and typically developing peers. This study tested the effects of context, transparency and familiarity on comprehension of 24 idioms. In the 1st task, idiomatic phrases were presented out of context. In the 2nd task, they were embedded in supportive story contexts. Two groups of 4- and 5-grades participated in this study: 20 poor reading comprehenders and their grade-, age-, gender-matched typically developing peers. To examine group differences based on the two tasks, 3-way repeated measures ANOVA was used. The results of this study are summarized as follows. First, the poor comprehender group scored significantly lower than the TD group and there was a significant main effect for context between two groups. TD made good use of context but poor comprehenders didn't. Second, there was a significant interaction effect transparency and group: that is poor comprehenders scored higher in transparent idioms but TD scored higher in opaque idioms. Meanwhile in terms of transparency, there was no significant differences within groups. Third, there was significant main effect of idiom familiarity within two groups: it is easier for both groups to comprehend the familiar idioms than unfamiliar ones. And there was a significant interaction effect familiarity, group and context. In context task, poor comprehenders' score of unfamiliar idiom was significantly lower than TD, that is, poor comprehenders are impaired in their ability to select appropriate cues from context and use these to derive the meaning of unfamiliar and opaque idioms. Fourth, poor comprehenders' percentage of literal interpretation errors in isolation task is significantly higher than TD. It shows that poor comprehenders have a tendency to interpret idiom word by word. These Results of the present study implies that school-aged poor comprehenders have inferior ability in idiom comprehension and do not make full use of contextual cues. 본 연구는 읽기이해부진 아동의 관용어 이해능력과 그 특징을 알아보고자 초등학교 4, 5학년 읽기이해부진 아동 20명과 일반 아동 20명을 대상으로 하였다. 관용어는 투명도와 친숙도에 따라 네 가지 유형으로 나누었으며, 실험과제는 독립과제와 문맥과제의 형태로 제시해 4개의 보기 가운데 정답을 고르도록 하였다. 두 집단의 과제제시 방법 및 관용어의 투명도 또는 친숙도에 따른 관용어 이해능력을 평가하기 위해 3요인 반복측정분산분석을 실시하였다. 연구 결과, 첫째, 읽기이해부진 아동은 과제제시 방법 및 투명도에 따른 관용어 이해능력이 일반 아동보다 유의미하게 낮았다. 관용어의 투명도에 따라서는 관용어의 이해능력에 유의미한 차이가 없었다. 읽기이해부진 아동은 투명한 관용어의 정답률이 높았던 반면에 일반 아동은 불투명한 관용어의 정답률이 더 높아 투명도와 집단 간 상호작용 효과가 나타났다. 둘째, 과제제시 방법 및 친숙도에 따른 관용어 이해능력에서도 일반 아동의 정답률이 읽기이해부진 아동보다 유의미하게 높았다. 한편 문맥과제에서 읽기이해부진 아동은 친숙하지 않은 관용어의 정답률이 일반 아동보다 유의하게 낮아 문맥으로부터 관용어의 의미를 추론해내는 능력이 결여되어 있음을 보여주었다. 셋째, 두 집단의 오답 오류 유형을 비교한 결과 읽기이해부진 아동은 문자적으로 해석하는 오류 빈도가 가장 높았던 반면에 일반 아동은 문맥관련 오류 빈도가 가장 높았다.

점액세균의 이차대사산물

현혜숙,조경연,Hyun, Hyesook,Cho, Kyungyun 한국미생물학회 2018 미생물학회지 Vol.54 No.3

점액세균은 포식활동, 자기방어, 세포 간 신호전달 및 아직까지 알려지지 않은 다른 기능을 위해 다양한 이차대사산물을 생산한다. 점액세균에서 분리된 많은 이차대사산물들은 독특한 작용기작을 가지며 항암, 항세균, 항진균 등과 같은 약학적으로 유용한 생리활성을 보인다. 따라서 전 세계적으로 많은 점액세균 균주들이 분리되었고 이들로부터 다양한 생리활성물질들이 탐색되었다. 하지만 16S rRNA 데이터베이스 분석에 의하면 야생에는 지금까지 분리된 종류 이외에도 다양한 점액세균 종류들이 존재할 것으로 추정되며, 유전체 서열 분석에 의하면 각 점액세균들은 기존에 알려진 물질보다 더 많은 물질을 생산할 수 있는 능력이 있는 것으로 나타났다. 본 총설에서는 점액세균 유래 이차대사산물들과 이들의 유전자, 점액세균에서의 기능, 생합성 유전자의 발현을 조절하는 전사조절인자 등에 대한 최근까지의 연구 현황을 살펴보았다. Myxobacteria produce diverse secondary metabolites for predation, self-defense, intercellular signaling, and other unknown functions. Many secondary metabolites isolated from myxobacteria show pharmaceutically useful bioactivity such as anticancer, antibacterial, and antifungal activities with a unique mechanism of action. Therefore, a large number of myxobacterial strains have been isolated globally and many bioactive compounds have been purified from them. However, 16S rRNA database analysis indicates that there are far more types of myxobacterial species in the wild than have ever been isolated, and genome sequence analysis suggests that each myxobacterium is capable of producing much more metabolites than already known. In this article, the current status of studies on the secondary metabolites from myxobacteria, their biosynthetic genes, biological functions, and transcriptional regulatory factors governing gene expression were reviewed.

hsfA와 MYSTI_05387 유전자의 불활성이 Myxococcus stipitatus의 이차대사산물 생산과 자실체 형성에 미치는 영향

현혜숙,조경연 한국미생물학회 2023 미생물학회지 Vol.59 No.4

Myxococcus stipitatus DSM 14675 is a myxobacterium that produces bioactive secondary metabolites such as DKxanthene, melithiazol, and phenalamide. To explore transcriptional regulators of secondary metabolism in M. stipitatus, we searched the genome of the M. stipitatus DSM 14675 strain for homologs of the hsfA and MXAN_4899 genes, which are known as secondary metabolism transcriptional regulator genes in Myxococcus xanthus, and discovered the MYSTI_05929 (hsfA) and MYSTI_ 05387 genes. Inactivation of the MYSTI_05929 (hsfA) gene in the M. stipitatus DSM 14675 strain decreased the production of DKxanthene, melithiazol, and phenalamide by 82.7%, 100%, and 60.3%, respectively, compared to the wild type. Inactivation of the MYSTI_05387 gene increased the production of DKxanthene by 12.9% compared to the wild type but decreased the production of melithiazol and phenalamide by 100% and 69.2%, respectively. Thus, the proteins encoded by the MYSTI_05929 (hsfA) and MYSTI_05387 genes appear to be involved in the regulation of secondary metabolism in M. stipitatus. Furthermore, the MYSTI_05929 (hsfA) gene appeared to be essential for S-motility and fruiting body formation, as S-motility and fruiting body formation were defective when inactivated.

Myxococcus stipitatus DSM 14675의 melithiazol 생합성 유전자 분석

현혜숙 ( Hyesook Hyun ),박수현 ( Soohyun Park ),조경연 ( Kyungyun Cho ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2016 한국미생물·생명공학회지 Vol.44 No.3

Melithiazol은 점액세균 Melitangium lichenicola, Archangium gephyra, Myxococcus stipitatus에 의해 생산되는 항진균 물질이다. M. lichenicola의 melithiazol 생합성 유전자는 이미 알려져 있지만, A. gephyra와 M. stipitatus의 melithiazol 생합성 유전자들은 아직까지 밝혀져 있지 않다. 본 연구에서는 유전체 서열 분석과 돌연변이 분석을 통해 M. stipitatus DSM 14675 균주로부터 37.3 kb 크기의 melithiazol 생합성 유전자군을 발견하였다. 이 유전자군은 9개(MYSTI_04973-MYSTI_04965)의 유전자로 구성되어 있는데, 4개의 polyketide synthase 모듈과 3개의 nonribosomal peptide synthase 모듈, 그리고 fumarylacetoacetate hydrolase, S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase, nitrilase를 암호화하는 것으로 분석되었다. 플라스미드 삽입 돌연변이를 통해 MYSTI_04972 유전자 또는 MYSTI_04973를 불활성화시켰을 때 melithiazol 생산능이상실되었다. MYSTI_04972부터 MYSTI_04965까지의 8개 유전자가 암호화하는 melithiazol 생합성 모듈의 구성은 M. lichenicola Me l46에서와 유사하였다. 하지만 첫 번째 유전자(MYSTI_04973)에 의해 암호화되는 로딩 모듈의 구성은 M. lichenicola Me l46과 달랐는데, 이러한 차이는 M. stipitatus 균주들이 어떻게 M. lichenicola Me l46과는 다른구조의 melithiazol 유도체들을 생산하는지 설명해준다. Melithiazols are antifungal substances produced by the myxobacteria Melitangium lichenicola, Archangium gephyra, and Myxococcus stipitatus. Melithiazol biosynthetic genes have been identified in M. lichenicola, but not in A. gephyra and M. stipitatus until now. We identified a 37.3-kb melithiazol biosynthetic gene cluster from M. stipitatus DSM 14675 using genome sequence analysis and mutational analysis. The cluster is comprised of 9 genes (MYSTI_04973 to MYSTI_04965) that encode 4 polyketide synthase modules, 3 nonribosomal peptide synthase modules, a putative fumarylacetoacetate hydrolase, a putative S adenosylmethionine- dependent methyltransferase, and a putative nitrilase. Disruption of the MYSTI_04972 or MYSTI_ 04973 gene by plasmid insertion resulted in defective melithiazol production. The organization of the melithiazol biosynthetic modules encoded by 8 genes from MYSTI_04972 to MYSTI_04965 was similar to that in M. lichenicola Me l46. However, the loading module encoded by the first gene (MYSTI_04973) was different from that of M. lichenicola Me l46, explaining the difference in the production of melithiazol derivatives between the M. lichenicola Me l46 and M. stipitatus strains.

영화 속 오타꾸의 사회적 역할에 관한 연구

현혜숙(Hae-Sook Hyun) 한국엔터테인먼트산업학회 2009 한국엔터테인먼트산업학회논문지 Vol.3 No.1

오타꾸가 이 세상에 드러났을 때는 미야자키 쓰토무의 살인사건과 옴 진리교 사건 때문이었다. 따라서 그들을 바라보는 사회적 시각은 정신병리로 인식되었고 지금도 그 부정적인 시각으로 부터 완전히 자유롭지는 못하다. 사회적 변화에 따른 집단과 개인, 그 관계와 성향을 분석해 볼 때 오타꾸의 성적대상은 사람이기 보다는 상징적 매개물이다. 그들은 인형이나 애니메이션, 피규어에 애정을 쏟는다. 인형들을 사고파는 그들의 소비 행위는 키덜트 현상이란 유행으로 확산되고 있다. 이 논문은 근대 이성의 합리화에 대치되는 서브컬쳐인 오타꾸의 장인정신이나 예술 세계를 부정하려는 것이 아니라 아즈마 히로키가 주장한 ‘커다란 이야기’가 없는 이 시대에 고독한 폐쇄성을 가진 그들의 성과 가상, 관계성에 대해 이야기하고자 하였다. 사실 인간이 인간에 대한 기억은 정신이 아니라 살의 기억이다. 사물의 본질은 특정한 요소에 의한 것이 아니라 관계에 의해 결정된다란 의미에서 세상과 관계 맺기를 위한 제언에 의의를 두었다. Otaku was exposed to the world due to the murder of MIYAZAKI TSUTOMU and the case of Omu Shinriky. Therefore, the viewpoint of the general public on them was one of psychopathology at the time and they are not completely free from such view even now. When analyzing the relationship and propensity between groups and individuals in social change, sex objects of otaku are symbolic medium rather than people. They give great affection to dolls, animation and figures. Their consumptive behavior of buying and selling dolls is being proliferated into the popularity of kidult phenomenon. This thesis, rather than denying the artisan spirit or artistic world of otaku, which is the subculture that confronts rationalization of modern reasoning, deals with their sex and fabrication, and relationship of otaku with solitary obturation in this era of "absence of significant story" that AZUMA HIROKI asserted. In fact, the memory of man on another man is that of physical contact rather than spiritual. Significance has been placed on the proposal for establishment of relationship with the world from the perspective that "essence of matter is determined by the relationship of their elements rather than by particular element." Key Word : Psychopathology, Sex and fabrication, Symbolic medium, Consumptive behavior, Solitary obturation, Relationship, Establishment of relationship