프로그램에 대한 복잡도 측정인자 분석

이규범 ( Kyu-boem Lee ),송정영 ( Jeong-young Song ) 한국인터넷정보학회 2002 인터넷정보학회논문지 Vol.3 No.4

객체지향 프로그램에 대한 복잡도 측정에 관한 방법으로서 기존의 객체지향 패러다임 특성이라 할 수 있는 객체, 메시지, 클래스, 캡슐화 및 상속성등에 관한 연구는 이미 보고된바 있다. 본 연구에서는 측정인자로서 Halstead의 Program Volume, Program Level, Program Impurity, Macabe의 Cyclomatic Number, Handerson-Sellers의 응집도 결핍척도, Sullivan`s의 PVG측정 방법 등을 선택하였다, 시뮬레이션으로는 객체지향 프로그램의 대표적인 언어인 JAVA Program을 Design & Coding할 때 도움을 주는 척도에 대해서 JAVA Sample Program을 준비하여 프로그램 복잡도 면에서 측정인자들을 각각 비교·분석 하였다. Measurement of the objects, messages, classes, capsulation, inheritance, etc. that are conventional object-oriented paradigm characteristics as a method of measurement of the complexity of object-oriented programs has been reported. In this paper, the measures that are helpful to designing and coding of JAVA program, which is the representative language of object-oriented programs, are applied to six measures(i.e., Halstead`s Program Volume, Program Level, Program Impurity, Macabe`s Cyclomatic Number, Handerson-Seller`s lack of cohesion in method and Sullivan`s PVG.) suggested in the present study by referring to several actual programs as example for comparative analysis.

웹프로그램 언어의 정성적 평가기준ㆍ분석

이규범(Kyu-Boem Lee),송정영(Jeong-Young Song) 한국정보기술학회 2003 한국정보기술학회논문지 Vol.1 No.2

프로그래밍 언어에 대한 정성적 평가

지상훈(Sang-Hoon Chi),이규범(Kyu-Boem Lee),이수길(Sou-Kil Lee),윤석권(Seok-Kwon Youn),이경환(Kyung-Whan Lee),송정영(Jeong-Young Song) 한국정보기술학회 2003 Proceedings of KIIT Conference Vol.2003 No.-

일반적으로, 주어진 소프트웨어를 비교 분석ㆍ평가하는 방법으로는 정량적인 평가방법과 정성적인 평가 방법이 있다. 정량적 평가 방법에 비하여 정성적 평가 방법은 그 정의부터 애매한 정이 포함되어 있어서 그 평가 방법이 쉽지 않은 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 프로그래밍 언어에 대한 정성적 평가방법을 기준으로 신뢰성, 효율성, 유지보수성, 이식성에 대하여 세부항목으로 나누어 정의하고 그 정당성을 서술한다.

유전체 스크리닝으로 선별된 Nocardiopsis 균주의 대장균 접합을 통한 유전자 도입전략 최적화

전호근 ( Ho Geun Jeon ),이미진 ( Mi Jin Lee ),김현범 ( Hyun Bum Kim ),한규범 ( Kyu Boem Han ),김응수 ( Eung Soo Kim ) 한국미생물생명공학회(구 한국산업미생물학회) 2011 한국미생물·생명공학회지 Vol.39 No.2

방선균은 그램양성 토양 박테리아로서 항생제, 항암제, 항구충제, 면역억제제 등 유용한 2차 대사산물을 생산하는 유용 산업미생물이다. 비록 대부분의 방선균이 속해있는 스트렙토마이세스는 지난 수 십 년간 분자수준에서의 연구가 집중적으로 진행되어 왔으나, 최근에 분리된 잠재적 유용성을 갖는 스트렙토마이세스 이외의 희소방선균들은 유전자 조작 시스템의 부재로 그 특성이 잘 규명되지 않고 있다. 본 연구에서는 독립적으로 분리된 180 여 방선균주들 중에서 희소 방선균만을 선별하기 위하여 중합효소연쇄반응을 이용한 유전체 스크리닝 전략을 시도하였으며, 이 전략을 통하여 7종의 희소방선균을 성공적으로 분리하였다. 특히 여러 생리활성 테스트를 통하여, 항진균 및 항생제 활성을 띄는 잠재적 유용성이 높은 노카이디옵시스 균주 MMBL010을 선별하였다. 또한 전통적인 방선균 유전자 조작기법이 작동하지 않는 본 MMBL010 균주를 대장균 접합을 통한 유전자 전달 시스템도 최적화시킴으로써, 유전체 스크리닝을 통한 유용희소방선균의 선별 및 유전자 조작시스템 구축은 궁극적으로 희소방선균의 잠재적 유용성을 극대화시킬 수 있는 효율적인 전략으로 사료된다. Actinomycetes, Gram positive soil bacteria, are valuable microorganisms which produce useful secondary metabolites including antibiotics, antiparasitic substances, anti-cancer drugs, and immunosuppressants. Although a major family of actinomycetes, known as streptomycetes, has been intensively investigated at the molecular level for several decades, a potentially valuable and only recently isolated non-streptomycetes rare actinomycetes (NSRA) family has been poorly characterized due to lack of proper genetic manipulation systems. Here we report that a PCR-based genome screening strategy was performed with approximately 180 independently isolated actinomycetes strains to isolate potentially valuable NSRA strains. Thanks to this simple PCR-based genome screening strategy we were able to identify only seven NSRA strains, followed by 16S rRNA sequencing for confirmation. Through further bioassays, one potentially valuable NSRA strain (tentatively named Nocardiopsis species MMBL010) was identified which possessed both antifungal and antibacterial activities, along with the presence of polyketide synthase and non-ribosomal peptide synthase genes. Moreover, Nocardiopsis species MMBL010, which was intrinsically recalcitrant to genetic manipulation, was successfully transformed via E. coli-driven conjugation. These results suggest that PCR-based genome screening, followed by the establishment of an E. coli-driven conjugation system, is an efficient strategy to maximize potentially valuable compounds and their biosynthetic genes from NSRA strains isolated from various environments.

An Iris Processing using the Characteristic Value

Lunman Deng(등윤만),Sek-Koun Youn(윤석권),Kyu-Boem Lee(이규범),Jeong-Young Song(송정영) 한국정보기술학회 2011 한국정보기술학회논문지 Vol.9 No.8

Sebekia benihana에서 Streptomyces coelicolor SCO4967 유전자 도입을 통한 하이드록실 사이클로스포린 A의 생전환

김현범 ( Hyun Bum Kim ),이미진 ( Mi Jin Lee ),한규범 ( Kyu Boem Han ),김응수 ( Eung Soo Kim ) 한국미생물생명공학회 ( 구 한국산업미생물학회 ) 2010 한국미생물·생명공학회지 Vol.38 No.4

Actinomycetes are Gram-positive soil bacteria and one of the most important industrial microorganisms due to superior biosynthetic capabilities of many valuable secondary metabolites as well as production of various valuable bioconversion enzymes. Among them are cytochrome P450 hydroxylase (CYP), which are hemoproteins encoded by a super family of genes, are universally distributed in most of the organisms from all biological kingdoms. Actinomycetes are a rich source of soluble CYP enzymes, which play critical roles in the bioactivation and detoxification of a wide variety of metabolite biosynthesis and xenobiotic transformation. Cyclosporin A (CyA), one of the most commonly-prescribed immunosuppressive drugs, was previously reported to be hydroxylated at the position of 4th N-methyl leucine by a rare actinomycetes called Sebekia benihana, leading to display different biological activity spectrum such as loss of immunosuppressive activities yet retaining hair growth-stimulating side effect. In order to improve this regio-selective CyA hydroxylation in S. benihana, previously-identified several secondary metabolite up-regulatory genes from Streptomyces coelicolor and S. avermitilis were heterologously overexpressed in S. benihana using an ermE * promoter-containing Streptomyces integrative expression vector. Among tested, SCO4967 encoding a conserved hypothetical protein significantly stimulated region-specific CyA hydroxylation in S. benihana, implying that some common regulatory systems functioning in both biosynthesis and bioconversion of secondary metabolite might be present in different actinomycetes species.

재생 중인 흰쥐 간의 형태학적 변화 및 PCNA 발현에 미치는 rrhGM-CSF의 영향

정진주,허시현,김지현,윤광호,이영준,한규범,김완종,Jeong, Jin-Ju,Heo, Si-Hyun,Kim, Ji-Hyun,Yoon, Kwang-Ho,Lee, Young-Jun,Han, Kyu-Boem,Kim, Wan-Jong 한국현미경학회 2010 Applied microscopy Vol.40 No.2

Granulocyte macrophage-colony stimulating factor (GM-CSF)는 과립구 및 대식세포뿐만 아니라 상피세포의 증식과 분화를 자극하는 당단백질이며, 최근 생산된 벼세포 유래 재조합 GMCSF(rrhGM-CSF)는 감염원으로부터 안전하고 당사슬이 매우 풍부하여 물질의 안정성 혹은 효과의 지속성을 높여 주는 것으로 알려졌다. 본 실험에서는 간 재생 능력이 우수한 흰쥐를 실험모델로 하여 간의 78%를 제거한 후, 간 재생을 유도하는 과정에서 rrhGM-CSF를 처리하고, 시간 경과에 따라 형태변화의 차이와 더불어 단백질 발현 분석법과 면역조직화학법을 이용하여 PCNA 발현에 미치는 효과에 대해서 알아보고자 하였다. rrhGMCSF는 간 재생 속도를 뚜렷이 증가시키지는 못하였으나, 대조군에 비해 실험군에서는 재생 초기에 간 세포판의 붕괴와 재구성 시기를 다소 앞당기는 것으로 관찰되었다. 증식 중인 세포에서 증가하는 것으로 알려져 있는 핵단백질인 proliferating cell nuclear antigen (PCNA)의 간 조직에서의 분포와 발현 정도를 보면 부분간절제 후 12시간과 24시간에서는 PCNA 단백질이 두 그룹에서 조금씩 발현되다가 간 절제 3일과 5일이 경과한 실험군에서 단백질이 높게 발현되었다. 간 재생이 진행될수록 간 조직 전체에서 고르게 PCNA 양성반응이 나타났으며, 대조군 보다 실험군에서 반응성이 더 뚜렷한 것으로 나타났다. 이러한 결과들로 보아 부분 간절제 후 간 재생을 유도하는 과정에서 rrhGM-CSF가 세포분열을 촉진시키는 인자들 중의 하나로 작용하여 간 재생에 효과를 나타낼 수 있을 것으로 사료된다. Liver regeneration is a result of highly coordinated proliferation of hepatocytes and nonparenchymal liver cells. Partial hepatectomy (PH) is the most often used stimulus to study liver regeneration because, compared with other methods that use hepatic toxins, it is not associated with the tissue injury and inflammation, and the initiation of the regenerative stimulus is precisely defined. Granulocyte macrophage-colony stimulating factor (GM-CSF), which is a cytokine able to regulate the proliferation and differentiation of epithelial cells, was first identified as the most potent mitogen for bone marrow. Particularly, rrhGM-CSF, which is highly glycosylated and sustained longer than any other types of GM-CSF in the blood circulation, was specifically produced from rice cell culture. In this experiment, effects of rrhGM-CSF administration were evaluated in the regenerating liver after 78% PH of rats. Morphological changes induced by PH were characterized by destroyed hepatocyte plate around the central vein and enlarged nuclear cytoplasmic ratio and increased hepatocytes with two nuclei. And then, proliferation of liver cells (parenchymal and nonparenchymal) and rearrangement of plates and lobules seemed to be carried out during liver regeneration. These alterations in the experimental group preceded those of the control. Since proliferating cell nuclear antigen (PCNA) is known to be a nuclear protein maximally elevated in the S phase of proliferating cells, the protein was used as a marker of liver regeneration after PH in rats. PCNA levels by western blot analysis and immunohistology were compared between the two groups. PCNA protein expression of two groups at 12 hr and 24 hr after injury showed similar pattern. The protein expression showed the peak at 3 days in both groups, however, the protein level of the experimental group was higher than that of the control. On immunohistochemical observations, the reaction product of PCNA was localized at the nuclei of proliferating cells and the positive reaction in experimental group at 3 days was clearly stronger than that in control group. The results by Western blotting and immunohistology for PCNA showed similar pattern in terms of the protein levels. In conclusion, rrhGM-CSF administration during liver regeneration after 78% PH accelerated breakdown and restoration of the hepatic plate and expression of PCNA. These results suggest that rrhGM-CSF might play an important role during liver regeneration in rats.

상용 워드프로세서 제품의 사용성 평가에 관한 연구

이규범,윤성일 공주영상정보대학 1999 논문집 Vol.6 No.-

본 연구에서는 상용 소프트웨어 제품의 사용성 평가에 관한 연구이다. 상용 워드 프로세서로 일상생활에서 많이 사용되고 있는 한글 97과 MS-Word 97의 사용성 평가에 대하여 텍스트 모드, 수식 모드, 표 모드, 단편집과 OLE기능 모드, 차트 모드 등을 다음과 같이 비교·분석하였다. 텍스트 모드에서 한글 97은 완성형과 조합형을 지원하는 반면 MS-Word 97에서는 완성형만을 지원함을 알 수 있다. 수식 Mode에서는 한글 97은 수식 입력도구를 사용하므로 작성하기에 편리한 반면 MS-Word 97은 개체 삽입으로 인한 수식모드의 작성이 편리하지 않음을 알 수 있으며, 편집 시간 면에서 한글 97보다 MS-Word 97이 약 2배정도 많이 소요됨을 알 수 있고, 또한 파일 크기도 약 6배정도로 MS-Word 97이 더 많이 필요함을 알 수 있다. Table Mode에서 한글 97은 도표 캡션을 지정할 수 있는 반면 MS-Word 97에서는 도표 캡션을 직접 작성해야 하는 불편함을 알 수 있다. OLE기능 모드에서 MS-Word 97은 Drag & Drop 기능이 있는 반면, 한글 97에서는 직접적인 Drag & Drop 대신에 복사 기능과 붙여 넣기로 같은 결과를 얻어낼 수 있음을 확인하였다. Chart Mode에서 한글 97은 자체적으로 필요한 차트기능이 지원되는 반면 MS-Word 97은 엑셀 등의 차트기능이 있는 소프트웨어를 불러와서 사용해야함을 알 수 있다.