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      • Multiplex Mini Y Short Tandem Repeat Haplotyping using Fluorescence Energy Transfer Labeled Primers

        서태석,신경진,최종영,Richard A. Mathies 한국바이오칩학회 2008 BioChip Journal Vol.2 No.3

        A fluorescence energy transfer (ET) cassette labeled mini Y short tandem repeat (STR) genotyping system is presented. A capillary electrophoretic (CE) microdevice with a cross-injector design is used to determine the fluorescence intensities of ET and single dye-labeled STR amplicons, demonstrating a 2-12 fold higher fluorescence signal of ET cassette labels than the corresponding single dye-labeled ones. Eleven extended haplotype mini Y-STRs using ET cassette labeled primers are constructed, and sensitivity and mixed sample studies are performed. Due to the improved spectroscopic properties of ET labels, multiplex mini Y-STR typing is successful with as low as 30 pg of genomic male DNA, and in the high background of female DNA. These results indicate the practical advantage of ET cassette labels for low copy number and poor-quality DNA STR genotyping to be applied for criminal investigations, paternity testing, and evolutionary studies.

      • KCI등재후보

        방사선 치료를 위한 몬테칼로 광자선 선량계산 시 통계적 불확실성 영향 평가

        서태석,조병철,정광호 대한방사선방어학회 2004 방사선방어학회지 Vol.29 No.2

        몬테칼로 모의실험을 이용하여 방사선 선량을 계산할 경우 원하는 정확도를 얻기 위해서는 계산입자(histories) 수가 많아야 하므로 시간이 오래 걸리게 된다. 그러므로 정확성을 유지할 수 있으면서 시간을 최소화할 수 있는 최적의 계산입자 수를 결정해야 할 필요가 있다. 본 연구에서는 계산입자 수에 따른 통계적 불확실성의 영향을 평가한 후 최적의 계산입자 수 결정을 위한 불확실성의 한계를 제시하고자 하였다. 몬테칼로 코드로는 BEAMnrc와 DOSXYZnrc를 사용하였으며, 모의 흉부 팬텀에 대하여 계산입자 수를 달리하면서 광자선 선량을 계산한 후 통계적 오차가 적은 벤치마크와 비교하였다. 통계적 오차의 영향을 분석하기 위하여 임상적으로 널리 이용되는 등선량 곡선 비교, DVH, RMSD 방법을 이용하였다. 연구 결과 통계적 오차의 영향은 등선량 곡선 비교와 RMSD 비교에서 크게 나타났으나 DVH에서의 영향은 크지 않은 것으로 나타났다. 방사선치료를 위한 광자선 선량계산을 할 경우 전체 통계적 불확실성 9% 또는 이상을 갖는 체적소에 대한 통계적 오차 1%, 또는 최대 선량지점에서의 통계적 불확실성 1% 정도가 적정 수준임을 확인할 수 있었다.

      • KCI등재

        하프PC 슬래브에 발생한 균열이 합성 슬래브의 휨 내력에 미치는 영향에 관한 실험적 연구

        서태석,이문성,최창식 한국구조물진단유지관리공학회 2009 한국구조물진단유지관리공학회 논문집 Vol.13 No.2

        하프PC 슬래브는 시공중에 슬래브 판에 균열이 발생하기 쉽고 이러한 균열들을 보수보강 하지 않은 상태에서 덧침콘크리트를 타설할 경우 합성슬래브의 내력에 영향을 미칠 것으로 사료된다. 하지만 하프PC 슬래브에 발생한 균열이 합성슬래브의 구조성능에 미치는 영향에 관한 연구는 아직까지 없는 실정이다. 따라서 본 연구에서는 하프PC 슬래브에 발생한 균열이 합성 슬래브의 내력에 미치는 영향을 조사하기 위하여 덧침콘크리트를 타설하기 전에 하프PC 슬래브에 균열을 발생시킨 시험체와 균열이 없는 합성슬래브 시험체를 제작하여 슬래브의 휨 성능을 검토하였다. Recently, as the concern for the development of a construction method for an environmental protection and for tall building is increasing, the use of the half precast concrete(PC) slab that has the solution of environmental problems and the advantage such as reduction of construction period is being demanded. However, there is shortcoming that the crack can occur easily while constructing, and these cracks can have a bad influence upon the structural performance of PC composite slab. However, there is little studies on the influence of these cracks on the structural performance of composite PC slab. In this study, the specimen caused the crack before pouring topping concrete in the half PC slab and the PC composite slab without the cracks were produced to investigate the structural performance of PC composite slab with crack

      • Point-of-care genetic diagnostic platform for COVID-19 identification

        서태석 한국공업화학회 2020 한국공업화학회 연구논문 초록집 Vol.2020 No.-

        In the midst of COVID-19, the molecular diagnostic technology plays a major role to prevent the spreading of COVID-19. The conventional genetic analysis process requires a prolonged reaction time, a series of analytical steps, bulky and expensive instrumentations, lacking of the point-of-care DNA testing. In this talk, I will introduce two types of the portable genetic analyzer : a fully integrated centrifugal microsystem as well as a smartphone-based molecular diagnostics for point-of-care testing to identify COVID-19.

      • SCOPUSKCI등재

        Measurement of Dose Distribution in Small Beams of Philips 6 and 8 MVX Linear Accelerator

        서태석,윤세철,신경섭,박용휘,Suh Tae-suk,Yoon Sei Chul,Shinn Kyung Sub,Park Yong Whee The Korean Society for Radiation Oncology 1991 Radiation Oncology Journal Vol.9 No.2

        본 논문에서는 소조사면에 대한 X-선의 선량분포를 일반실험식으로 계산될 수 있도록 beam 측정 데이타를 종합 처리하는 방법에 대하여 기술하고 있다. Beam 데이타는 philips LINAC 6 MV, 8 MV X-ray에 대하여 측정 되었으며, 측정된 요소는 tissue maximum ratio (TMR), off-axis-ratio (OAH), 그리고 relative output factor (ROF)를 포함한다. 소조사면에 의한 방사선 치료를 위하여 isocenter에서 지름이 1 내지 3cm되도록 실린더 형태의 특수 collimator가 2 mm 간격으로 제작되었다. 본 측정을 위하여 다이오드 detector가 이용되었으며 Film 및 TLO 측정기로 측정된 값과 비교검토 되었다. 제한된 조사면으로 측정된 TMR, OAR data로부터 beam 데이타를 나타내는 실험식을 유도하였으며 이 실험식은 임의의 Set-UP조건에 따른 측정값을 예상할 수 있는 일반 실험식으로 확장되었고 측정된 TMR과 OAR 값들은 잘 일치되었다. The work suggested in this paper addresses a method for collecting beam data for small circular fields. Beam data were obtained from philips 6 and 8 MV LINAC at Dept. Radiation Therapy at Gainesville Incorporated and Shands Teaching Hospital. Specific quantities measured include tissue maximum ratio (TMR), off-axis ratio (OAR) and relative output factor (ROF) In small field irradiation, special collimators were used to produce circular fields of 1 cm to 3 cm diameter in 2 mm steps, measured at SAO (soura axis distance) of 100 cm. Diode detector was chosen for primary beam measurement and compared with measurements made with photographic film and TLD dosimeters. The measured TMRs and OARs were formulated from limited measurements to generate basic beam data for reference set-up. The empirical formula were later, extended and generalized for any possible set-up using the trends of fitting parameters. The measured TMRs and OARs were well represented by the fitting formula developed.

      • 연직파이프쿨링 공법에 의한 매스콘크리트 온도균열 제어

        서태석,임창근,조윤구,Seo, Tae-Seok,Lim, Chang-Keun,Cho, Yun-Gu 한국건설순환자원학회 2014 한국건설순환자원학회 논문집 Vol.2 No.3

        합벽, 옹벽, 교량 주탑과 같이 세장한 매스콘크리트 구조물의 경우 온도균열 제어를 위해 저발열 콘크리트 배합의 적용 및 균열유발줄눈의 설치 등이 주로 적용되고 있다. 하지만 이러한 대책이 적용되어도 세장한 매스 구조물들은 내부구속에 비해 외부구속이 크기 때문에 완벽한 균열제어가 불가능하고, 특히 균열이 발생하게 되면 거의 관통을 하기 때문에 온도균열제어를 위한 특별한 관리가 필요하다. 합벽, 옹벽, 교량 주탑과 같이 세장한 매스콘크리트 구조물의 적극적인 온도균열 제어를 위하여 기존의 파이프쿨링 공법을 개선시킨 연직파이프쿨링 공법을 개발하였으며, 현장 우수조/중수조 합벽 콘크리트에 적용이 되었다. 그 결과 합벽의 중심부 최고 온도를 10도 이상 낮츨 수 있는 것으로 나타났으며, 균열은 50% 이상 감소시킬 수 있는 것으로 나타났다. In case of the slender mass concrete like attached wall, retaining wall and bridge tower, the low heat cement and the control joint are mainly used for thermal cracking control. However, even if these cracking control methods are considered, it is impossible to control thermal cracks perfectly, because the external restraint is largely in these mass concrete. Because these cracks occurring in slender mass concrete members almost penetrate concrete member, the special cracking control is demanded in these mass concretes. The vertical pipe cooling method improving existing pipe cooling method was developed for the active thermal cracking control of slender mass concrete, and applied at the field attached wall. In results, the maximum temperature dropped more than $10^{\circ}C$ by vertical pipe cooling method, and the cracks decreased about more than 50%.

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