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      KCI등재

      동물 모델 실험의 계산적 해석을 위한 유전자 발현 반응 데이터의 재구성 기법

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      https://www.riss.kr/link?id=A102281467

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      국문 초록 (Abstract)

      인간의 질병을 연구하기 해서 많은 동물 모델들이 실험에 사용되고 있기 때문에, 동물에서의 실험 결과를 인간의 측면에서 해석하는 이종(異種) 간의 유자 데이터 분석이 요해지고 있다. 이...

      인간의 질병을 연구하기 해서 많은 동물 모델들이 실험에 사용되고 있기 때문에, 동물에서의 실험 결과를 인간의 측면에서 해석하는 이종(異種) 간의 유자 데이터 분석이 요해지고 있다. 이러한 유자 데이터의 재분석을 해 공공장소에 집단으로 유자 발 데이터가 축되어 다른 연구자들에게 공유되고 있지만, 이를 재분석하기 해서는 매번 련 실험을 찾고, 그 실험 구성을 분석하고, 필요한 샘을 추출하고, 유자 발 데이터를 재처리하 는 등의 복잡한 처리과정을 거쳐야한다. 이 논문에서는 서로 다른 종간의 유자 발 데이터 분석을 쉽게 하기 해 공공장소에 장되어있는 데이터들을 분석에 합한 형태로 재구성하는 방법을 소개하고, 이를 통해 수집된 데 이터들을 소개한다.

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      Since animal models have been widely used to study human diseases, it is important to interpret the result of animal experiments in the view of human studies. While gene expression data have been accumulated and shared in the research community, it st...

      Since animal models have been widely used to study human diseases, it is important to interpret the result of animal experiments in the view of human studies. While gene expression data have been accumulated and shared in the research community, it still requires a lot of works to reanalyze them, which includes searching proper experiments, characterizing experiment settings, extracting data samples, and recalculating statistics. In this paper, we introduce a reconstructed database and its design for the gene expression analysis between human and animal models. We expect that this database is highly useful to analyze the gene expression data of animal experiments for human health and diseases.

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      목차 (Table of Contents)

      • 요약
      • Abstract
      • 1. 서론
      • 2. 기존 연구
      • 3. 유전자 데이터 재구성 기법
      • 요약
      • Abstract
      • 1. 서론
      • 2. 기존 연구
      • 3. 유전자 데이터 재구성 기법
      • 3.1 유전자 발현 데이터
      • 3.2 형변환부
      • 3.3 유전자 매칭부
      • 3.4 프로파일 생성부
      • 3.5 프로파일 데이터
      • 4. 결과
      • 5. 결론
      • 참고문헌
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      참고문헌 (Reference)

      1 김현우, "탠덤 질량 스펙트럼에서 추출된 갭 태그를 단백질데이터베이스에서 검색하는 효율적인 알고리즘" 한국차세대컴퓨팅학회 12 (12): 95-104, 2016

      2 최경석, "웹 서비스 기반 빅 데이터 서비스 조합 프레임워크" 한국차세대컴퓨팅학회 11 (11): 6-15, 2015

      3 이병욱, "발현 유전자 분석을 위한 고성능 클라우드 서비스 구축" 한국차세대컴퓨팅학회 11 (11): 43-55, 2015

      4 "http://cdal.korea.ac.kr/ebts/db/"

      5 Woodcock J, "The FDA critical path initiative and its influence on new drug development" 59 : 1-12,

      6 Lee M., "Network construction from a data matrix and its application to model-target gene expression data" 950-951, 2016

      7 Barret T., "NCBI GEO: archive for functional genomics data sets—update" 41 : D991-D995, 2013

      8 Bedell MA, "Mouse models of human disease. Part II: recent progress and future directions" 11 : 11-43,

      9 Troyanskaya O., "Missing value estimation methods for DNA microarrays" 17 (17): 520-525, 2001

      10 Seok J., "Gene response in mouse models poorly mimics severe human inflammatory diseases" 110 (110): 3507-3512, 2013

      1 김현우, "탠덤 질량 스펙트럼에서 추출된 갭 태그를 단백질데이터베이스에서 검색하는 효율적인 알고리즘" 한국차세대컴퓨팅학회 12 (12): 95-104, 2016

      2 최경석, "웹 서비스 기반 빅 데이터 서비스 조합 프레임워크" 한국차세대컴퓨팅학회 11 (11): 6-15, 2015

      3 이병욱, "발현 유전자 분석을 위한 고성능 클라우드 서비스 구축" 한국차세대컴퓨팅학회 11 (11): 43-55, 2015

      4 "http://cdal.korea.ac.kr/ebts/db/"

      5 Woodcock J, "The FDA critical path initiative and its influence on new drug development" 59 : 1-12,

      6 Lee M., "Network construction from a data matrix and its application to model-target gene expression data" 950-951, 2016

      7 Barret T., "NCBI GEO: archive for functional genomics data sets—update" 41 : D991-D995, 2013

      8 Bedell MA, "Mouse models of human disease. Part II: recent progress and future directions" 11 : 11-43,

      9 Troyanskaya O., "Missing value estimation methods for DNA microarrays" 17 (17): 520-525, 2001

      10 Seok J., "Gene response in mouse models poorly mimics severe human inflammatory diseases" 110 (110): 3507-3512, 2013

      11 Seok J., "Evidence-based translation for the genomic responses of murine models for the study of human immunity" 13 (13): e0118017-, 2015

      12 Lieschke GJ, "Animal models of human disease: zebrafish swim into view" 8 : 353-367,

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      2015-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2011-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
      2010-01-01 평가 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) KCI등재후보
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      기준연도 WOS-KCI 통합IF(2년) KCIF(2년) KCIF(3년)
      2016 0.68 0.68 0.62
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.56 0.51 0.557 0.26
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