미디에이터 기반 생물정보원 통합시스템을 위한 XML 질의 인터페이스 설계 및 구현

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

This paper presents a query interface that talks to a mediator system based on XML data model. Due to using XMLView concept, a mediator system considers every biological source as an XML document. Therefore, the user makes query and search to the XMLView and in addition to receives an XML document as a result.
A query interface graphically presents biological sources in the integrated system as tree structure and processes the user query as workflow. A query interface has two major functions. First, if the user inputs search conditions and keyword, a query interface automatically makes XQuery and sends it to the mediator. second, it is to execute query sequencely among the sources. If the source frames are connected with lines, the search result in pre-source sends to the next source then automatically add to the next query.

목차 (Table of Contents)

• 목차
• Abstract = 1
• Ⅰ. 서론 = 2
• 1. 연구배경 = 2
• 2. 연구 목적 = 4
• 3. 논문 구성 = 5
• Ⅱ. 관련연구 = 7
• 1. K2/BioKleisli = 7
• 2. TAMBIS = 8
• 3. DiscoveryLink = 8
• 4. BACIIS = 8
• 5. MIX = 9
• 6. XMF = 9
• Ⅲ. 질의 인터페이스 구조 = 10
• 1. 시스템 구조 = 10
• 2. 질의 인터페이스에 포함된 정보원 = 12
• 1) BLAST = 12
• 2) GenBank = 12
• 3) PDB = 13
• 4) PubMed = 13
• Ⅳ. 질의 인터페이스 설계 = 14
• 1. 질의 인터페이스 구성 요소 = 14
• 1) Main Frame = 14
• (1) Menu Frame = 14
• (2) WorkSpace = 14
• (3) RUN = 15
• 2) MenuTree = 15
• (1) Sources = 15
• (2) Filter = 16
• (3) View = 16
• (4) DataMinig = 16
• 3) WorkSpace Internal Frame = 16
• (1) 하나의 정보원에 대한 검색 = 17
• (2) 다수의 정보원에 대한 순차검색 = 17
• (3) 보완관계 정보원의 순차통합검색 = 19
• 2. 질의 인터페이스 생성 및 처리 과정 = 20
• 1) 개요 = 20
• 2) 처리 단계 = 21
• 3. XQuery 생성과정 및 결과문서 처리 = 23
• 1) XQuery 생성기의 구성 = 23
• 2) XQuery 생성과정 = 23
• (1) Query 입력기 = 23
• (2) XQuery 생성기 = 24
• (3) SAXParser = 24
• 3) 결과문서 처리 = 24
• Ⅴ. 질의 인터페이스 구현 = 26
• 1. 구현환경 = 26
• 2. 구현결과 = 26
• 1) 초기화면 = 26
• 2) 정보원의 선택 = 27
• 3) 검색 조건 및 검색어 입력 = 28
• 4) 정보원의 개별 항목 연결 = 29
• (1) 정보원과 결과 View 프레임의 연결 = 29
• (2) 정보원과 정보원의 순차 연결 = 30
• (3) 보완관계 정보원의 연결 = 31
• 3. 프로그램 수행 = 32
• 1) 수행개요 = 32
• 2) 수행 단계 = 33
• (1) 정보원 선택 = 33
• (2) Line 연결 = 33
• (3) 검색 조건 지정 = 34
• (4) 검색어 입력 = 35
• (5) 실행 = 36
• (6) 정보원별 XQuery 질의어의 순차적 생성 결과 = 36
• 3) 수행 결과 = 38
• Ⅵ. 결론 및 향후 과제 = 39
• 참고문헌 = 40