유전자 상호작용 데이타베이스 SOAP 서버 객체 모델의 설계 및 구현 = Design and Implementation of SOAP Servers Object Model for Gene Interaction Databases

국문 초록 (Abstract)

최근 주요 생물정보학 데이타베이스 중 DDBJ, ENSEMBL, KEGG, 등의 데이타베이스는 연구자들의 편의를 위해 데이타와 분석용 도구들을 웹 서비스를 이용하여 제공한다. 이와 같이 웹 서비스를 이용하여 서비스를 제공하기 위해서는 SOAP 서버 객체와 메소드 정의가 매우 중요하다. 이 연구에서는 BIND, MINT, DIP과 같은 유전자 상호작용 데이타베이스를 위해서 필요한 SOAP 서버 객체에 대한 요구사항을 도출한다. 이어서 이 요구사항을 만족하는 SOAP 서버 객체와 메소드를 정의하였다. 이를 기반으로 프로토타입을 설계하고 구현한 것에 대하여 기술한다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

Recently main Bioinformatics databases(DDBJ, ENSEMBL, KEGG, etc.) provide analysis tools and data using web services for the convenience of bioinformaticians. Thus, defining SOAP server objects and their methods are very important to provide services for web services. We define SOAP server objects for interaction databases such as BIND, MINT and DIP.

목차 (Table of Contents)

• 요약
• Abstract
• 1. 서론
• 2. 관련연구
• 3. 유전자 상호작용 데이타베이스
• 4. 상호작용 데이타베이스를 위한 SOAP 서버 객체의 설계
• 5. SOAP 서버 객체의 효용성 분석
• 6. 결론 및 향후 연구
• 참고문헌
• 저자소개

참고문헌 (Reference)

1 "상호작용 데이타베이스의 SOAP 서버를 위한 객체 모델 설계 및 구현" 세종대학교 2004년8월

2 "www.bind.ca"

3 "http://xml.nig.ac.jp"

4 "http://www.ncbi.nlm.nih.gov"

5 "http://www.kegg.com"

6 "http://www.ebi.ac.uk"

7 "http://psidev.sourceforge.net"

8 "http://dip.doe-mbi.ucla.edu"

9 "http://cbm.bio.uniroma2.it/mint"

10 "MINT : a Molecular INTeraction database" 513 : 135-140, 2001.12

11 "INTEGRATING BIOLOGICAL DATABASES" Lincoln D 337-345, 2003.5

12 "Crosstalk Between Metabolic and Regulatory Pathways" 2003.12

13 "Creating a bioinformatics nation" Lincoln D 119-120, 2002.5

14 "Biological SOAP servers and web services provided by the public sequence data bank" 31 : 3836-3839, 2003.4

15 "BIND-a data specification for storing and describing biomolecular interactions" 16 : 465-16 477, 2000.3

16 "BIND Curation Reference Manual" 2003

17 "A Web Service Using SOAP, WSDL to Access the KEGG System" 14 : 673-674, 2003