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      KCI등재

      Genetic Differences between Wild and Cultured Populations in Olive Flounder in Korea Based on Mitochondrial DNA Analysis

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      https://www.riss.kr/link?id=A82319665

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      국문 초록 (Abstract)

      우리나라의 주요 양식 대상 종이며, 년간 총 생산량 1위를 점하고 있는 넙치를 모델로 하여 양식 집단의 유전적 다양성의 변화를 확인하였다. 이를 위해, 한국에서 서식하고 있는 자연산 및 ...

      우리나라의 주요 양식 대상 종이며, 년간 총 생산량 1위를 점하고 있는 넙치를 모델로 하여 양식 집단의 유전적 다양성의 변화를 확인하였다. 이를 위해, 한국에서 서식하고 있는 자연산 및 양식산 넙치 각 29개체를 사용하여, hypervariation 영역으로 알려진 tRNA (tRNA<SUP>Thr</SUP>, tRNA<SUP>Pro</SUP>) 영역과 control region의 앞부분까지의 522 bp에 대한 염기서열의 특성을 분석하였다. 23개의 haplotype에서 522 bp의 염기 중 49곳(9.4%)에서 변이가 나타났다. 대부분의 haplotype은 자연집단에서 유일하게 나타났으며, 오직 4개의 haplotype만이 양식집단에서 나타났다. 또한, 두 집단 사이에서는 유전적으로 유의한 집단분화가 발생하였다는 사실도 확인할 수 있었다. 따라서 미토콘드리아 DNA 염기서열 분석 기법은 집단의 유전적 다양성을 평가뿐만 아니라 양식집단의 유전적 모니터링에 사용가능 할 것으로 판단된다.

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      We sequenced a 522 bp fragment including the tRNA<SUP>Thr</SUP>, tRNA<SUP>Pro</SUP> gene and the first half of the control region from 29 wild and cultured olive flounder specimens from Korea. Out of 522 nucleotide sites, 49 (9...

      We sequenced a 522 bp fragment including the tRNA<SUP>Thr</SUP>, tRNA<SUP>Pro</SUP> gene and the first half of the control region from 29 wild and cultured olive flounder specimens from Korea. Out of 522 nucleotide sites, 49 (9.4%) were variable, 23 haplotypes being found. Most haplotypes are unique in the wild population and only four were shared by cultured specimins. The nucleotide diversity and differences between wild and cultured populations were 0.025±0.013 and 0.015±0.008, and 12.94±6.00 and 7.83±3.75, respectively. Haplotype diversity was 0.98±0.02 and 0.49±0.09 in the wild and cultured populations, respectively. These results show that marked reductions of genetic variability in the hatchery strains were observed in the number of mitochondrial DNA haplotypes and haplotype diversity when compared to the wild populations. Furthermore, we detected significant population differentiation between both populations. The mtDNA sequencing technique used to evaluate the genetic variability of hatchery strains compared to that of the wild population is potential for genetic monitoring of olive flounder hatchery stocks.

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      목차 (Table of Contents)

      • Introduction
      • Materials and Methods
      • Results
      • Discussion
      • Acknowledgements
      • Introduction
      • Materials and Methods
      • Results
      • Discussion
      • Acknowledgements
      • References
      • 초록
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      참고문헌 (Reference)

      1 조은섭, "한국근해 및 외해역에 채집된 멸치의 미토콘드리아 DNA 다양성" 한국생명과학회 16 (16): 812-827, 2006

      2 Kimura, M., "simple method for estimating evolutionary rate of base substitution through comparative studies of nucleotide sequences" 116 : 111-120, 1980

      3 Tamura, K., "MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0" 24 : 1596-1599, 2007

      4 Sekino, M., "Loss of microsatellite and mitochondrial DNA variabilities in hatchery strains of Japanese flounder Paralichthys olivaceus" 213 : 101-122, 2002

      5 Allendorf, F. W., "Loss of genetic variation in a hatchery stock of cutthroat trout" 109 : 537-543, 1980

      6 Xiao, Y., "Genetic diversity in the mtDNA control region and population structure in the small yellow croaker Larimichthys polyactis" 10 : 2009

      7 Wang, M., "Genetic diversity in the mtDNA control region and population structure in the Sardinella zunasi Bleeker" 24 : 4384-4392, 2008

      8 Weir, B. S., "Estimating F-Statistics for the analysis of population structure" 38 : 1358-1370, 1984

      9 Rozas, J., "DnaSP, DNA sequence polymorphism: an interactive program for estimating Population Genetics parameters from DNA sequence data" 11 : 621-625, 1995

      10 Saitoh, K., "Complete nucleotide sequence of Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) mitochondrial genome: structural properties and cue for resolving teleostean relationships" 91 : 271-281, 2000

      1 조은섭, "한국근해 및 외해역에 채집된 멸치의 미토콘드리아 DNA 다양성" 한국생명과학회 16 (16): 812-827, 2006

      2 Kimura, M., "simple method for estimating evolutionary rate of base substitution through comparative studies of nucleotide sequences" 116 : 111-120, 1980

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      7 Wang, M., "Genetic diversity in the mtDNA control region and population structure in the Sardinella zunasi Bleeker" 24 : 4384-4392, 2008

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      9 Rozas, J., "DnaSP, DNA sequence polymorphism: an interactive program for estimating Population Genetics parameters from DNA sequence data" 11 : 621-625, 1995

      10 Saitoh, K., "Complete nucleotide sequence of Japanese flounder (Paralichthys olivaceus) mitochondrial genome: structural properties and cue for resolving teleostean relationships" 91 : 271-281, 2000

      11 Schneider, S., "Arlequin: A software for population genetic data. User manual version 2.000" iversity of Geneva 2000

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      2021-01-01 평가 등재학술지 유지 (재인증) KCI등재
      2018-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2015-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2011-08-03 학술지명변경 외국어명 : Korean Journal of Life Science -> Journal of Life Science KCI등재
      2011-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2009-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2007-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2004-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
      2003-01-01 평가 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) KCI등재후보
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      기준연도 WOS-KCI 통합IF(2년) KCIF(2년) KCIF(3년)
      2016 0.37 0.37 0.42
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.43 0.43 0.774 0.09
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