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      Cluster analysis of incomplete microarray data with fuzzy clustering

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      https://www.riss.kr/link?id=A103984347

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      In this paper, we present a method for clustering incomplete Microarray data using alternating optimization in which a prior imputation method is not required. To reduce the influence of imputation in preprocessing, we take an alternative optimization...

      In this paper, we present a method for clustering incomplete Microarray data using alternating optimization in which a prior imputation method is not required. To reduce the influence of imputation in preprocessing, we take an alternative optimization approach to find better estimates during iterative clustering process. This method improves the estimates of missing values by exploiting the cluster information such as cluster centroids and all available non-missing values in each iteration. The clustering results of the proposed method are more significantly relevant to the biological gene annotations than those of other methods, indicating its effectiveness and potential for clustering incomplete gene expression data.

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      참고문헌 (Reference)

      1 F.D.Gibbons, "the quality of geneexpression-based clustering methods using gene an-notation" 12 : 1574-1581, 2002

      2 "accu-rate estimation of missing values in microarray datawith least square methods"

      3 formatics 19 CLICK andEXPANDER, "a system for clustering and visualiz-ing gene expression data"

      4 K.Yeung, "Validating clus-tering for gene expression data" 17 : 309-318, 2001

      5 S. Chu, "The transcrip-tional program of sporulation in budding yeastence282" 699-705, 1998

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      7 L.Issel-Tarver, "Sac-charomyces genome database" 350 : 329-346, 2002

      8 "S231- Fuzzy c-means method forclustering microarray data" -18, 2002

      9 Welsh, "Research Guassianmixture clustering and imputation of microarray data" o20u0y4a

      10 "Novel clustering algorithm for mi-croarray expression data in a truncated SVD space" bori : 2003

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      3 formatics 19 CLICK andEXPANDER, "a system for clustering and visualiz-ing gene expression data"

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      6 S.Tavazoie, "Sys-tematic determination of genetic network architec-ture" 22 : 281-285, 1999

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      19 M. Eisen, "Cluster analysis and display of genome-wide expression pat-terns14868" 95 : 1998

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      2015-12-01 평가 등재후보로 하락 (기타) KCI등재후보
      2011-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2009-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2008-02-20 학술지명변경 한글명 : 한국퍼지및지능시스템학회 논문지 -> 한국지능시스템학회 논문지
      외국어명 : 미등록 -> Journal of Korean Institute of Intelligent Systems
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      2008-02-18 학회명변경 한글명 : 한국퍼지및지능시스템학회 -> 한국지능시스템학회
      영문명 : Korea Fuzzy Logic And Intelligent Systems Society -> Korean Institute of Intelligent Systems
      KCI등재
      2007-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2005-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2002-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
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      2016 0.62 0.62 0.63
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.56 0.49 0.866 0.2
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