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      Agarase를 생산하는 Persicobacter sp. DH-3의 분리 및 β-agarase의 특성

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      https://www.riss.kr/link?id=A106050049

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      국문 초록 (Abstract)

      이 연구의 목적은 agarase를 생산하는 새로운 해양 박테리아를 분리하는 것이다. Agarase는 agarose를 가수분해하여 다양한 생리활성을 가지는 agarooligosaccharides 또는 neoagarooligosaccharides를 생성할 수 있다. 전라남도의 여수연안에서 채취한 해수로부터 DH-3 균주를 분리하였다. DH-3 균주는 16S rDNA 서열분석을 통하여 Persicobacter sp. DH-3로 명명하였다. 세포 외로 분비된 효소는 Persicobacter sp. DH-3의 배양액으로부터 얻었으며, 특성연구에 사용하였다. 20, 30, 40, 50, 60 및 70℃에서의 온도별 상대활성은 각각 50, 55, 70, 100, 90 및 50%였다. pH 5, 6, 7 및 8에서의 pH별 상대활성은 각각 75, 100, 90, 75%였다. 본 효소는 20 mM Tris-HCl 완충액에서 pH 6.0 및 50℃에서 최대활성을 나타내었다. 본 효소는 한천이 액체상태로 존재하는 50℃에서 최대활성을 나타내었으므로 산업적으로 유용한 효소로 판단된다. 본 효소는 20, 30 및 40℃에서 2시간 동안 열처리하여도 80% 이상의 잔존활성을 보였다. TLC 분석결과, Persicobacter sp. DH-3 균주의 한천분해효소는 네오한천올리고당인 neoagarohexaose와 neoagarotetraose를 생성하였으므로 β-agarase로 확인되었다. Zymogram 분석결과, Persicobacter sp. DH-3는 적어도 45, 70 및 140 kDa 크기의 3종류 이상의 한천분해효소를 생산하는 것을 확인할 수 있었다. 그러므로, Persicobacter sp. DH-3 유래 agarase는 기능성을 가진 neoagarooligosaccharides의 생산에 활용될 수 있을 것으로 기대된다.
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      이 연구의 목적은 agarase를 생산하는 새로운 해양 박테리아를 분리하는 것이다. Agarase는 agarose를 가수분해하여 다양한 생리활성을 가지는 agarooligosaccharides 또는 neoagarooligosaccharides를 생성할 ...

      이 연구의 목적은 agarase를 생산하는 새로운 해양 박테리아를 분리하는 것이다. Agarase는 agarose를 가수분해하여 다양한 생리활성을 가지는 agarooligosaccharides 또는 neoagarooligosaccharides를 생성할 수 있다. 전라남도의 여수연안에서 채취한 해수로부터 DH-3 균주를 분리하였다. DH-3 균주는 16S rDNA 서열분석을 통하여 Persicobacter sp. DH-3로 명명하였다. 세포 외로 분비된 효소는 Persicobacter sp. DH-3의 배양액으로부터 얻었으며, 특성연구에 사용하였다. 20, 30, 40, 50, 60 및 70℃에서의 온도별 상대활성은 각각 50, 55, 70, 100, 90 및 50%였다. pH 5, 6, 7 및 8에서의 pH별 상대활성은 각각 75, 100, 90, 75%였다. 본 효소는 20 mM Tris-HCl 완충액에서 pH 6.0 및 50℃에서 최대활성을 나타내었다. 본 효소는 한천이 액체상태로 존재하는 50℃에서 최대활성을 나타내었으므로 산업적으로 유용한 효소로 판단된다. 본 효소는 20, 30 및 40℃에서 2시간 동안 열처리하여도 80% 이상의 잔존활성을 보였다. TLC 분석결과, Persicobacter sp. DH-3 균주의 한천분해효소는 네오한천올리고당인 neoagarohexaose와 neoagarotetraose를 생성하였으므로 β-agarase로 확인되었다. Zymogram 분석결과, Persicobacter sp. DH-3는 적어도 45, 70 및 140 kDa 크기의 3종류 이상의 한천분해효소를 생산하는 것을 확인할 수 있었다. 그러므로, Persicobacter sp. DH-3 유래 agarase는 기능성을 가진 neoagarooligosaccharides의 생산에 활용될 수 있을 것으로 기대된다.

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      The purpose of this study was to isolate a new marine agarase-producing bacterium. Agarase can hydrolyze agar and agarose to produce agarooligosaccharides or neoagarooligosaccharides, which possess many physiological functions. Strain DH-3 was isolated from seawater collected from the coast of Yeosu at Jeollanam province, Korea. A 16S rDNA sequence analysis showed this strain to be Persicobacter sp. DH-3. Extracellular agarase was prepared from culture media of Persicobacter sp. DH-3 and used for characterization. Relative activities at 20, 30, 40, 50, 60, and 70℃ were 50, 55, 70, 100, 90, and 50%, respectively. Relative activities at pH 5, 6, 7, and 8 were 75, 100, 90, and 75%, respectively. The enzyme showed maximum activity at 50℃ in a 20 mM Tris-HCl buffer at pH 6. This enzyme could be useful, as agar is in liquid state at 50℃. Agarase activities were maintained at 80% or more for 2 hr at 20, 30, and 40℃. Thin layer chromatography analysis suggested that Persicobacter sp. DH-3 produced extracellular β-agarases as it hydrolyzed agarose to produce neoagarohexaose and neoagarotetraose. In addition, zymogram analysis confirmed that Persicobacter sp. DH-3 produces at least three agar-degrading enzymes with molecular weights of 45, 70, and 140 kDa. Therefore, it is expected that agarases from Persicobacter sp. DH-3 could be used to produce functional neoagarooligosaccharides.
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      The purpose of this study was to isolate a new marine agarase-producing bacterium. Agarase can hydrolyze agar and agarose to produce agarooligosaccharides or neoagarooligosaccharides, which possess many physiological functions. Strain DH-3 was isolate...

      The purpose of this study was to isolate a new marine agarase-producing bacterium. Agarase can hydrolyze agar and agarose to produce agarooligosaccharides or neoagarooligosaccharides, which possess many physiological functions. Strain DH-3 was isolated from seawater collected from the coast of Yeosu at Jeollanam province, Korea. A 16S rDNA sequence analysis showed this strain to be Persicobacter sp. DH-3. Extracellular agarase was prepared from culture media of Persicobacter sp. DH-3 and used for characterization. Relative activities at 20, 30, 40, 50, 60, and 70℃ were 50, 55, 70, 100, 90, and 50%, respectively. Relative activities at pH 5, 6, 7, and 8 were 75, 100, 90, and 75%, respectively. The enzyme showed maximum activity at 50℃ in a 20 mM Tris-HCl buffer at pH 6. This enzyme could be useful, as agar is in liquid state at 50℃. Agarase activities were maintained at 80% or more for 2 hr at 20, 30, and 40℃. Thin layer chromatography analysis suggested that Persicobacter sp. DH-3 produced extracellular β-agarases as it hydrolyzed agarose to produce neoagarohexaose and neoagarotetraose. In addition, zymogram analysis confirmed that Persicobacter sp. DH-3 produces at least three agar-degrading enzymes with molecular weights of 45, 70, and 140 kDa. Therefore, it is expected that agarases from Persicobacter sp. DH-3 could be used to produce functional neoagarooligosaccharides.

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      목차 (Table of Contents)

      • 서론
      • 재료 및 방법
      • 결과 및 고찰
      • References
      • 초록
      • 서론
      • 재료 및 방법
      • 결과 및 고찰
      • References
      • 초록
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      참고문헌 (Reference)

      1 지원재, "홍조류로부터 신규 한천분해미생물 Alteromonas macleodii subsp. GNUM08120의 분리 및 동정" 한국미생물·생명공학회 41 (41): 8-16, 2013

      2 이솔지, "해양성 Simiduia sp. SH-1 균주의 분리 및 한천분해효소의 특성조사" 한국생명과학회 25 (25): 1273-1279, 2015

      3 조정권, "해양성 Marinomonas sp. SH-2 균주가 생성하는 agarase의 분리 및 특성조사" 한국생명과학회 26 (26): 198-203, 2016

      4 장혜지, "해양성 Flammeovirga sp. mbrc-1 균주의 분리 및 한천분해기능의 특성조사" 한국생물공학회 26 (26): 552-556, 2011

      5 이동근, "한천분해효소를 생산하는 해양유래 세균 Glaciecola sp. SL-12의 분리 및 특성" 한국생명과학회 18 (18): 58-62, 2008

      6 이상현, "한천분해효소를 생산하는 해양세균 Thalassomonas sp. SL-5의 분리 및 특성" 한국생명과학회 17 (17): 70-75, 2007

      7 Lee, D. G., "Over-production of a glycoside hydrolase family 50 β-agarase from Agarivorans sp, JA-1 in Bacillus subtilis and the whitening effect of its product" 30 : 911-918, 2008

      8 이창은, "Isolation of a New Agar Degrading Bacterium, Maribacter sp. SH-1 and Characterization of its Agarase" 한국미생물·생명공학회 44 (44): 156-162, 2016

      9 Han, W., "Isolation identification and agarose degradation of a polysaccharide-degrading marine bacterium Persicobacter sp, JZB09" 52 : 776-783, 2012

      10 김재덕, "Cloning, Expression, and Characterization of a Thermotolerant β-agarase from Simiduia sp. SH-4" 한국생물공학회 23 (23): 525-531, 2018

      1 지원재, "홍조류로부터 신규 한천분해미생물 Alteromonas macleodii subsp. GNUM08120의 분리 및 동정" 한국미생물·생명공학회 41 (41): 8-16, 2013

      2 이솔지, "해양성 Simiduia sp. SH-1 균주의 분리 및 한천분해효소의 특성조사" 한국생명과학회 25 (25): 1273-1279, 2015

      3 조정권, "해양성 Marinomonas sp. SH-2 균주가 생성하는 agarase의 분리 및 특성조사" 한국생명과학회 26 (26): 198-203, 2016

      4 장혜지, "해양성 Flammeovirga sp. mbrc-1 균주의 분리 및 한천분해기능의 특성조사" 한국생물공학회 26 (26): 552-556, 2011

      5 이동근, "한천분해효소를 생산하는 해양유래 세균 Glaciecola sp. SL-12의 분리 및 특성" 한국생명과학회 18 (18): 58-62, 2008

      6 이상현, "한천분해효소를 생산하는 해양세균 Thalassomonas sp. SL-5의 분리 및 특성" 한국생명과학회 17 (17): 70-75, 2007

      7 Lee, D. G., "Over-production of a glycoside hydrolase family 50 β-agarase from Agarivorans sp, JA-1 in Bacillus subtilis and the whitening effect of its product" 30 : 911-918, 2008

      8 이창은, "Isolation of a New Agar Degrading Bacterium, Maribacter sp. SH-1 and Characterization of its Agarase" 한국미생물·생명공학회 44 (44): 156-162, 2016

      9 Han, W., "Isolation identification and agarose degradation of a polysaccharide-degrading marine bacterium Persicobacter sp, JZB09" 52 : 776-783, 2012

      10 김재덕, "Cloning, Expression, and Characterization of a Thermotolerant β-agarase from Simiduia sp. SH-4" 한국생물공학회 23 (23): 525-531, 2018

      11 이솔지, "Alteromonas sp. SH-1균 유래의 α-agarase의 특성조사" 한국생물공학회 31 (31): 113-119, 2016

      12 Furusawa, G., "Agarolytic bacterium Persicobacter sp, CCB-QB2 exhibited a diauxic growth involving galactose utilization pathway" 6 : e00405-, 2017

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      2021-01-01 평가 등재학술지 유지 (재인증) KCI등재
      2018-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2015-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2011-08-03 학술지명변경 외국어명 : Korean Journal of Life Science -> Journal of Life Science KCI등재
      2011-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2009-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2007-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2004-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
      2003-01-01 평가 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) KCI등재후보
      2001-07-01 평가 등재후보학술지 선정 (신규평가) KCI등재후보
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      기준연도 WOS-KCI 통합IF(2년) KCIF(2년) KCIF(3년)
      2016 0.37 0.37 0.42
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.43 0.43 0.774 0.09
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