Highly successful treatment outcome of multidrug‐resistant and genetic diversity of multidrug‐resistant Mycobacterium tuberculosis strains in Rwanda

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To determine prevalent MDR‐TB genotypes and describe treatment outcome and bacteriology conversion in MDR‐TB patients.
Review of laboratory records of 173 MDR‐TB patients from all over Rwanda who initiated treatment under programmatic management of MDR‐TB (PMDT) between 2014 and 2015. Fifty available archived isolates were genotyped by mycobacterial interspersed repetitive units – variable number of tandem repeats (MIRU‐VNTR) genotyping.
Of the 170 patients whose outcome was known, 114 (66.3%) were cured and 36 (21%) completed the treatment, giving a successful outcome (cured and completed) of 150 (87.3%) patients. Of 20 MDR‐TB patients with unfavourable treatment outcome, 18 died, one failed and one defaulted/stopped treatment. Of the 18 patients who died, 11 (61%) were HIV‐coinfected. The treatment outcome was successful for 93.9% among HIV negative and 81.8% among HIV‐coinfected patients (P = 0.02). Sputum smear conversion occurred in 3, 46, 57 and 78 patients before 2, 3, 4 and 6 months, respectively, with median time of sputum smear and culture conversion at 3 months. The 44 MDR‐TB isolates with MIRU‐VNTR result, showed high genetic diversity with low clustering rate (9.09%) and Uganda II being the most prevalent sub‐family lineage detected in 68.2% of isolates. Beijing family was the least common genotype detected (2.3%, 1 isolate).
The high success rates for MDR‐TB treatment achieved in Rwanda were comparable to outcomes observed in resource‐rich settings with HIV being an independent risk factor for poor treatment outcome. High genetic diversity and low clustering rate reported here suggest that reactivation of previous disease plays an important role in the transmission of MDR‐TB in Rwanda.
Déterminer les génotypes prévalents de la TB‐MDR et décrire les résultats du traitement et la conversion bactériologique chez les patients atteints de TB‐MDR.
Analyse des dossiers de laboratoire de 173 patients atteints de TB‐MDR de l'ensemble du Rwanda qui ont débuté un traitement sous prise en charge programmatique de la TB‐MDR (PMDT) entre 2014 et 2015. Cinquante isolats archivés disponibles ont été génotypés pour les unités répétitives intercalées de mycobactéries ‐ nombre variable de tandems répétés (MIRU‐VNTR).
Sur les 170 patients dont l'issue était connue, 114 (66,3%) étaient guéris et 36 (21%) avaient terminé le traitement, ce qui donne un résultat positif (guéri et complété) de 150 patients (87,3%). Sur 20 patients atteints de TB‐MDR dont l'issue du traitement était défavorable, 18 sont décédés, un a eu un échec et le dernier a abandonné/arrêté le traitement. Sur les 18 patients décédés, 11 (61%) étaient coinfectés par le VIH. Le résultat du traitement a été positif pour 93,9% des personnes VIH négatives et 81,8% pour ceux coinfectées par le VIH (p = 0,02). La conversion des frottis d'expectoration est survenue chez 3, 46, 57 et 78 patients respectivement à 2, 3, 4 et 6 mois, avec une durée médiane entre le frottis d'expectoration et la conversion de culture de 3 mois. Les 44 isolats de TB‐MDR avec un résultat MIRU‐VNTR ont montré une diversité génétique élevée avec un faible taux de regroupement (9,09%) et la sous‐famille de la lignée Ouganda II étant la plus prévalente détectée dans 68,2% des isolats. La famille Beijing était le génotype le moins fréquemment détecté (2,3%, 1 isolat).
Les taux de succès élevés du traitement de la TB‐MDR obtenus au Rwanda étaient comparables aux résultats observés dans les régions riches en ressources, le VIH étant un facteur de risque indépendant d'un mauvais résultat du traitement. La diversité génétique élevée et le faible taux de regroupement rapportés ici suggèrent que la réactivation d'une maladie antérieure joue un rôle important dans la transmission de la TB‐MDR au Rwanda.