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      Complete genome sequence of a cold-adapted humic acid degrading bacterium Pedobacter sp. PAMC 27299 from the Antarctic seashore

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      https://www.riss.kr/link?id=A102416679

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      국문 초록 (Abstract)

      부식산(humic acid)을 이용하여 저온에서 배양된 Pedobacter sp. PAMC 27299는 남극 바톤 반도(Barton Peninsula) King George Island의 해안가 이끼(moss debris)로부터 분리되었다. 본 연구에서는 Pedobacter sp. PAMC 2729...

      부식산(humic acid)을 이용하여 저온에서 배양된 Pedobacter sp. PAMC 27299는 남극 바톤 반도(Barton Peninsula) King George Island의 해안가 이끼(moss debris)로부터 분리되었다. 본 연구에서는 Pedobacter sp. PAMC 27299의 유전체 서열을 해독하였으며 크기 6,147,290 bp, G+C 함량 40.54%의 PAMC 27299는 지구 온난화 관련 저온적응 부식산 분해 효소를 보유하는 것으로 확인되었다.

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      다국어 초록 (Multilingual Abstract)

      Pedobacter sp. PAMC 27299 with humic acid cultivated on low temperature was isolated from the moss debris on the coast of the Barton Peninsula of King George Island of the maritime Antarctic region. Here, we present the complete genome sequence of Ped...

      Pedobacter sp. PAMC 27299 with humic acid cultivated on low temperature was isolated from the moss debris on the coast of the Barton Peninsula of King George Island of the maritime Antarctic region. Here, we present the complete genome sequence of Pedobacter sp. PAMC 27299, which contains 6,147,290 bp with a G+C content of 40.54%. PAMC 27299 may possess cold-adapted humic acid degradation enzymes with implication on global warming.

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      참고문헌 (Reference)

      1 Lowe, T.M., "tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence" 25 : 955-964, 1997

      2 Kurtz, S., "Versatile and open software for comparing large genomes" 5 : R12-, 2004

      3 Park, H. J., "Temporal changes in soil bacterial diversity and humic substances degradation in subarctic tundra soil" 69 : 668-675, 2015

      4 Lagesen, K., "RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes" 35 : 3100-3108, 2007

      5 Chin, C. S., "Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data" 10 : 563-569, 2013

      6 Delcher, A. L., "Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer" 23 : 673-679, 2007

      7 Conesa, A., "Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research" 21 : 3674-3676, 2005

      1 Lowe, T.M., "tRNAscan-SE: a program for improved detection of transfer RNA genes in genomic sequence" 25 : 955-964, 1997

      2 Kurtz, S., "Versatile and open software for comparing large genomes" 5 : R12-, 2004

      3 Park, H. J., "Temporal changes in soil bacterial diversity and humic substances degradation in subarctic tundra soil" 69 : 668-675, 2015

      4 Lagesen, K., "RNAmmer: consistent and rapid annotation of ribosomal RNA genes" 35 : 3100-3108, 2007

      5 Chin, C. S., "Nonhybrid, finished microbial genome assemblies from long-read SMRT sequencing data" 10 : 563-569, 2013

      6 Delcher, A. L., "Identifying bacterial genes and endosymbiont DNA with Glimmer" 23 : 673-679, 2007

      7 Conesa, A., "Blast2GO: a universal tool for annotation, visualization and analysis in functional genomics research" 21 : 3674-3676, 2005

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      2020-01-01 평가 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) KCI등재
      2013-12-02 학술지명변경 외국어명 : The Korean Journal of Microbiology -> Korean Journal of Microbiology KCI등재
      2010-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2008-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2006-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2004-01-01 평가 등재학술지 유지 (등재유지) KCI등재
      2001-01-01 평가 등재학술지 선정 (등재후보2차) KCI등재
      1998-07-01 평가 등재후보학술지 선정 (신규평가) KCI등재후보
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      학술지 인용정보

      학술지 인용정보
      기준연도 WOS-KCI 통합IF(2년) KCIF(2년) KCIF(3년)
      2016 0.21 0.21 0.21
      KCIF(4년) KCIF(5년) 중심성지수(3년) 즉시성지수
      0.26 0.24 0.48 0.02
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