국내 해양생물 유전체정보의 체계적 관리를 위한 프로세스 모델 및 데이터베이스 구축 = A Development of Process model and Database for Systematic Management of Domestic Marine Genome Information

국문 초록 (Abstract)

나고야의정서의 발효는 전 세계적으로 유전자원에 이용 및 이익 공유에 대한 관심을 높이게 되었다. 따라서 자국의 실물자원뿐만 아니라 유전정보의 관리가 필요하다. 국내의 경우 해양생물 유전체 연구가 초기단계로서 활발히 진행되고 있으나 체계적인 유전체정보관리를 못하고 있는 것이 현실이다. 본 연구에서는 SOP(Standard Operating Procedure)를 이용하여 해양생물 유전체정보의 등록 및 검증 프로세스를 정의하였고 국외 선진사례를 분석하여 원천데이터를 구분하고 메타데이터 모델을 설계하였다. 또한 등록자의 편의를 고려한 웹기반의 원천데이터 등록시스템을 구축하여 정보를 체계적으로 관리 할 수 있도록 하였다. 시스템의 파일공유는 유전체정보의 빠른 분석과 동시 접속이 가능하도록 GPFS(General Parallel File System) 방식을 사용하여 네트워크 및 로컬시스템 방식보다 나은 성능을 구현하였다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

The effectuation of the Nagoya protocol has increased worldwide interest in using and sharing of genetic resources. Therefore, It is necessary to manage genetic information as well as domestic resources. In the case of Korea, Marine genomic research is early stage. but it has not systemic management about genomic information. In this study, The Standard Operating Procedure(SOP) was used to define the registration and verification process of marine genome information. We divided hierarchy of NGS Raw-data and designed metadata models through analysis of advanced cases. It also developed a Web-based data registration system to systematically manage marine genome information. Network system is equipped with a General Parallel File System (GPFS) for faster sharing of data between multiple servers.

목차 (Table of Contents)

• 제 1 장 Introduction 1
• 1.1 연구의 배경 1
• 1.2 연구의 목적 2
• 1.3 연구의 필요성 2
• 제 2 장 Materials and Methods 4
• 2.1 Next-Generation Sequencing 4
• 2.1.1 Raw-data 6
• 2.1.2 De novo Assembly data 9
• 2.2 Standard Operating Procedure(SOP) 9
• 2.3 유전체 데이터베이스 선진사례 분석 10
• 2.4 General Parallel File System(GPFS) 12
• 제 3 장 Result 13
• 3.1 해양생물 유전체정보 표준관리 지침 13
• 3.1.1 유전체정보 등록 프로세스 모델 14
• 3.1.2 Metadata 15
• 3.2 해양생물 유전체정보 등록 시스템 구축 19
• 3.2.1 시스템 구성 20
• 3.2.2 자료수집 및 등록 23
• 3.2.3 데이터베이스 구축 25
• 3.2.4 상세정보 및 정보 통계 26
• 제 4 장 Conclusion 28
• 참고문헌 29