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Mackerell Jr., Alexander D American Chemical Society 1995 Journal of the American Chemical Society Vol.117 No.48
Influence of water and sodium on the energetics of dimethylphosphate and its implications for DNA structure
MacKerell, A. D. unknown 1997 Journal de chimie physique et de physico-chimie bi Vol.94 No.7-8
Identification and characterization of fragment binding sites for allosteric ligand design using the site identification by ligand competitive saturation hotspots approach (SILCS-Hotspots)
MacKerell, Alexander D., Jo, Sunhwan, Lakkaraju, S Elsevier Science B.V., Amsterdam. 2020 Biochimica et Biophysica Acta General Subjects Vol.1864 No.4
Structure, force, and energy of a double-stranded DNA oligonucleotide under tensile loads
MacKerell, A. D. SPRINGER VERLAG KG 1999 European Biophysics Journal Vol.28 No.5
Ions Everywhere? Mg2+ in the μ-Opioid GPCR and Atomic Details of Their Impact on Function
MacKerell, Alexander D. Elsevier Science B.V., Amsterdam 2020 Biophysical journal Vol.118 No.4
Development and Current Status of the CHARMM Force Field for Nucleic Acids
MacKerell, A. D., Banavali, N., Foloppe, N. JOHN WILEY & SONS LTD 2001 Biopolymers Vol.56 No.4
Molecular dynamics simulations of nucleic acid-protein complexes
MacKerell, A. D., Nilsson, L. Elsevier Science B.V., Amsterdam. 2008 Current opinion in structural biology Vol.18 No.2
Optimizing Ligand-Protein Interactions Via Silcs: Site Identification by Ligand Competitive Saturation
MacKerell, A. Elsevier Science B.V., Amsterdam 2010 Biophysical journal Vol.98 No.3//SUP1
All-Atom Empirical Force Field for Nucleic Acids: II. Application to Molecular Dynamics Simulations of DNA and RNA in Solution
Mackerell, A. D. JOHN WILEY & SONS LTD 2000 Journal of Computational Chemistry Vol.21 No.2
Contribution of the Intrinsic Mechanical Energy of the Phosphodiester Linkage to the Relative Stability of the A, B~I, and B~I~I Forms of Duplex DNA
MacKerell, A.D. AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 2009 The Journal of physical chemistry B Vol.113 No.10
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