CNVAS: Copy Number Variation Analysis System - The analysis tool for genomic alteration with a powerful visualization module

Jinho Yoo,In Cheol Ha,장규태,Kwang Su Jung,박기정,김양석 한국바이오칩학회 2011 BioChip Journal Vol.5 No.3

Recently, Copy Number Variation (CNV) has been recognized as one of the most important genomic alterations in the study of human variation,as it can be employed as a novel marker for human disease studies. Thus, many hardware technologies have been developed to detect copy number variations, including chip-based technologies. However, owing to its complexity, relatively few analysis tools are currently available for CNV, and most public tools have only limited functions and Graphic User Interfaces (GUI). CNVAS is a powerful software package for the analysis of CNV. Two different algorithms, Smith Waterman (SW) and Circular Binary Segmentation (CBS), are implemented for the detection of CNVregions. Furthermore, in o rder to evaluate the relationship between phenotype and CNV, CNVAS can perform the Chi-square test and Fisher’s exact test. Result visualization is another strong merit of the CNVAS software. CNVAS can show the analysis results in the form of chromosome ideograms, and these can be exported in the form of an image file. Furthermore,CNVAS has a database system, which can manage the user’s data from different sources and under different experimental conditions. CNVAS is a web-based program, and users can freely access the CNVAS by connecting to http://biomi.cdc.go.kr/CNVAS/.

Energy Efficient Routing Protocol for Mobile Wireless Sensor Networks

Yoo, Jinho(유진호),Choi, Sung-Gi(최성기) 한국정보전자통신기술학회 2015 한국정보전자통신기술학회논문지 Vol.8 No.5

본 논문에서 우리는 모바일 싱크노드를 가지는 모바일 센서 네트워크를 위한 경로배정 프로토콜을 제안합니다. 제안된 논문은 모바일 싱크를 도입하는 것에 의해 확장됩니다. 모바일 싱크는 그 주변의 클러스터 헤드로부터 센싱 데이터를 수집하는 가장 많은 멤버수를 가진 클러스터 헤드로 이동합니다. 이러한 이동은 싱크에 패킷을 보내는데 필요한 에너지소모를 감소시킵니다. 모의실험 결과는 제안된 프로토콜이 에너지 효율면에서 LEACH-ME를 능가하는 것을 보여줍니다. In this paper, we propose routing protocol for mobile wireless sensor networks with a mobile sink in cluster configuration. The proposed protocol extends LEACH-ME by introducing a mobile sink. The mobile sink moves to the cluster head with the highest number of member nodes to collect sensed data from cluster heads within its vicinity, which results in reducing energy consumption in forwarding packets to the sink. The simulation results show that the proposed protocol outperform LEACH-ME in terms of energy efficiency.

블록체인 서비스에서의 Privacy by Design 적용방안

유진호(Jinho Yoo) 한국정보과학회 2020 정보과학회지 Vol.38 No.7

e-Health장비 연결을 위한 IoT구현기술

유진호(Yoo, Jinho) 한국정보전자통신기술학회 2015 한국정보전자통신기술학회논문지 Vol.8 No.5

본 논문은 IoT환경에서 의료장비를 연결하는 eHealth구현에 관련한 연구이다. 본 연구의 구현환경은 센싱노드, 게이트웨이 그리고 서버가 연결된 구조이다. 센서노드인 의료장비에서 발생한 의료정보들을 게이트웨이에 전달하고 게이트웨이에서 서버로 의료정보를 전달하여 대량데이타를 서버에 저장할 수 있게 한다. 센서노드로부터 발생하여 서버에 축적된 의료정보는 데이터베이스 형태로 저장되어 의료정보 사용에 대한 준비가 된다. 본 연구에서는 일반 상업용으로 판매하는 센서노드들을 게이트웨이에 연결하고 게이트웨이에서 센서노드를 관리하는 소프트웨어 구조를 연구하고 서버에 데이터를 어떻게 전달할 것인가를 구현한다. This paper is a study related to connecting to medical device in IoT environment for e-Health Implementation. The implementation environment of this paper consists of sensing device node, gateway and its server. The information from medical devices on sensor node is transferred to gateway. The gateway transfers the information from their devices into the server and the server saves their transferred information. The medical information from medical devices is ready to use in making medical decision which is saved in database. In this paper, we connected the gateway to the commercial sensor node for implementing gateway functions. We studied and implemented how their network entities communicate each other.

이미지 캡션 정보를 이용한 문서 검색 시스템의 설계 및 구현

유진호(JinHo Yoo),이현창(HyunChang Lee),김경창(KyungChang Kim) 한국정보과학회 1997 한국정보과학회 학술발표논문집 Vol.24 No.2Ⅰ

본 논문은 이미지가 포함된 문서를 검색하기 위해서 이미지의 캡션(Caption) 정보를 이용하거나 문서의 내용을 기반으로 문서를 검색할 수 있는 시스템을 설계하고 구현하였다. 이미지의 캡션 정보와 문서의 텍스트는 모두 키워드를 추출하기 위해 필터링(Filtering) 단계를 거치고, B+트리를 이용한 역 파일 구조를 사용하여 빠르고 대용량의 문서 검색을 할 수 있도록 설계하였다. 질의 모델은 boolean 모델을 이용한 boolean 연산과 벡터 공간 모델에서 사용되는 단어 가중치(term weight)를 이용하여 가중치가 높은 질의 결과를 순차적으로 정렬하도록 하였다.

스팸메일 관리지표 개선에 관한 연구

유진호(Jinho Yoo),임종인(Jongin Lim) 한국정보보호학회 2009 정보보호학회논문지 Vol.19 No.3

국내에서 정량적인 스팸 수신량이 실제로 줄어들고 있음에도 불구하고, 일각에서는 스팸이 늘고 있다고 피해를 호소하기도 하고, 스팸 수신량 조사 결과는 개인이 실질적으로 느끼는 체감량과 차이가 있다고 주장하는 이용자들이 있다. 본고에서는 이러한 주장이 나오는 원인에 대한 분석과 더불어 스팸메일 관리지표와 관련된 주요 쟁점들을 살펴보고, 기존의 정량적인 스팸 수신량을 보완할 수 있는 스팸메일 관리지표 모델을 제시하고자 한다. 특히, 이용자가 스팸에 대하여 느끼는 체감 스트레스를 측정하여 이를 정량적인 수신량 지표와 더불어 정성적인 산출지표로 활용하고자 한다. 또한 본고에서 제시한 모형으로 실제 국내 현실 상황에 적용한 결과를 산출하고 그 의미를 분석하여 스팸대응정책에 활용하고자 한다. Although the average amount of spam users receive a day is statistically decreasing in Korea, they still complain of spam and insist there is a gap between the amount of spam users receive in reality and the amount of spam the users feel due to spam. This study analyzes the cause of the gap and suggests the way of complementing the traditional measure of the amount of spam receipt. In addition, we provide the conceptual framework of 'spam management index' that explains the overall spam counteract performances from the users' point of view. Especially, we develop the method of measuring 'spam stress' which can be used as an qualitative output element. Finally we apply the model in Korea to develop spam counteract policies.

위치기반서비스를 위한 소형시스템

유진호(Jinho Yoo) 한국정보기술학회 2012 한국정보기술학회논문지 Vol.10 No.8

가상머신 상의 PSTR모델 수행환경연구

유진호(Jinho Yoo),한규종(Kyujong Han),김용현(Yong-Hyun Kim),안미림(Mirim Ahn),김두현(Doo-Hyun Kim) 한국정보기술학회 2013 한국정보기술학회논문지 Vol.11 No.8

해양산업 디지털전환을 위한 사이버보안 전문 인력양성 방안연구

유진호(Jinho Yoo),임정규(Jeounggye Lim),박개명(Kaemyoung Park) 한국항해항만학회 2022 한국항해항만학회 학술대회논문집 Vol.2022 No.2

해양산업 디지털 전환에 따른 사이버 위협이 증가함에 따라 선박 및 항만 종사자들에 대한 사이버보안 교육훈련과 전문인력양성 필요성이 증가하였다. 선원의 교육훈련은 IMO의 STCW 협약과 연관되어 교육훈련 관리 및 자격증명이 이루어져야 하고, 선박과 항만의 OT시스템 특성을 반영한 사이버보안 교육훈련 시스템 개발이 필요하다. 본 논문에서는 IMO 사이버 리스크 관리 가이드라인 기반 훈련모델 개발, 해양산업 위협의 특성 기반 사이버보안 훈련모델 개발, AR/VR 및 메타버스를 활용한 사이버보안 훈련 효과 향상을 목표로 해양산업 디지털전환에 따른 사이버보안 전문인력 양성 시스템 개발방안을 제시하였다. As cyber threats in the maritime industry increase due to the digital transformation, the needs for cyber security training for ship`s crew and port engineers has increased. The training of seafarers is related to the IMO's STCW convention, so cyber security training also managed and certified, and it is necessary to develop a cybersecurity training system that reflects the characteristics of the OT system of ships and ports. In this paper, with the goal of developing a training model based on the IMO cyber risk management guideline, developing a cyber security training model based on the characteristics of maritime industry threats, and improving the effectiveness of cyber security training using AR/VR and metaverse, A method for developing a system for nurturing cyber security experts is presented.

최고경영층의 정보보호 리더십에 따른 정보보호 통제활동의 차이 분석

유진호(Jinho Yoo) 한국전자거래학회 2014 한국전자거래학회지 Vol.19 No.1

본 논문에서는 정보보호 거버넌스를 강조한 선행연구들을 바탕으로, 거버넌스 측면에서 가장 첫 번째에 해당하는 최고경영층의 정보보호에 대한 리더십이 정보보호 정책수립, 정보보호 조직과 인력 구성, 정보보호 교육 및 훈련, 기술적 대책 활동, 모니터링 및 감사활동 등과 같은 정보보호 통제활동에 어떤 영향을 주는 지에 대해 실증적으로 분석하고자 한다. 뿐만 아니라 최고경영층의 리더십과 비교되는 요인으로 조직 내에서 발생한 인터넷 침해사고 피해에 의해 정보보호 통제활동에 얼마나 차이가 있는지를 분석하여 시사점을 찾고자 한다. This paper is to analyze how the information security leadership of top management affects controls of information security. Controls of information security include the activity related to making information security policy, the activity related to making up information security organizational structure and job responsibilities, the activity related to information security awareness and training, the activity related to technical measures installation and operation, and the activity related to emergency response, monitering and auditing. Additionally we will analyze how Internet incidents affect controls of information security and find implications.