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- 저자 : 허문수 ( Heo Mun Su ) (검색결과 2 건)
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16S-3S rRNA Intergenic Spacer Region을 이용한 Vibrio fluvialis의 검출
강현실 ( Kang Hyeon Sil ),허문수 ( Heo Mun Su ),이제희 ( Lee Je Hui ) 한국환경생물학회 2003 환경생물 : 환경생물학회지 Vol.21 No.1
본 연구는 위장관염을 일으키는 Vibrio fluvialis의 16S 23S rRNA intergenic spacer region을 분석하였다. ISR을 PCR 증폭 후 plasmid vector에 클로닝하여 염기서열을 분석하였다. 그 결과, ISR의 염기서열은 tRNA gene 조성과 크기에 따라 총 6개의 type으로 분류되었다. 각 type은 tRNA gene 조성과 수에 따라 ISR-A, ISR-E, ISR-E1, ISR-ⅠA, ISR-EKV, ISR-EKAV로 명명하였으며, ISR-A는 tRNA^(Ala); ISR-ⅠA, tRNA^(Ⅱe)-tRNA^(Ala); ISR-EKV, tRNA^(Glu)-tRNA^(Lvs)-tRNA^(Val); ISR-EKAV, tRNA^(Glu)-tRNA^(Lys)-tRNA^(Ala)-tRNA(Val); ISR-E와 E1은 tRNA^(Glu)를 갖고 있었다. 이 중 ISR-EKV type은 minor type으로 존재하고 있으며, 여러 Vibrio종에서 V.Fluvialis를 검출하기 위한 species-speific primer 제작에 이용하였다. 제작된 primer의 특이성은 여러 Vibrio의 genomic DNA를 분리하여 PCR 반응으로 확인하였다. 그 결과, 제작된 primer는 V. fluvialis에 종 특이성이 있으며 여러 Vibrio종으로부터 빠른 검출이 가능함을 확인하였다. We have examined the 16S rRNA intergenic spacer regions(ISR) of Vibrio Fluvialis. ISRs were PCR amplified, cloned into a plasmid vector and then sequenced. As results of ISR nucleotide sequence analysis, total of 6 clones were isolated depending on the size. The clones were different in both the number and the composition of the tRNA genes, and were designated ISR-A, ISR-E, ISR-E1, ISR-IA, ISR-EKV, ISR-EKAV. ISR-A contains tRNA^(Ala) ; ISR-IA, tRNA^(Ile)-tRNA^(Ala) ; ISR-EKV, tRNA^(Glu)-tRNA^(Lys)-tRNA^(Val) ; ISE-EKAV, tRNA^(Glu)-tRNA^(Lys)-tRNA^(Ala)-tRNA^(Val) ; ISR-E and E1, tRNA^(Glu) clusters. ISR-EKV was shown to be a minor type out of the six ISR tyoes and showed a very limited homology between ISR-EKV from V. Fluvialis and ISRs from other Vibrio species. Therefore ISR-EKV sequence was used to design species-specific primers to detect V. fluvialis from other Vibrio species by PCR reaction . The specificity of the primers was examined using genomic DNA of other Vibrios as Templates for PCR reaction. The result showed that PCR can be a useful method to detect V. fluvialis among Vibrio species in a single PCR reaction.
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단보 : 제주도 양식넙치, Paralichthys olivaceus의 스쿠티카충병 발생 동향
진창남 ( Jin Chang Nam ),이창훈 ( Lee Chang Hun ),오상필 ( O Sang Pil ),정용욱 ( Jeong Yong Ug ),송춘복 ( Song Chun Bog ),이제희 ( Lee Je Hui ),허문수 ( Heo Mun Su ) 한국어병학회 2003 한국어병학회지 Vol.16 No.2
The research was carried out to know the occurrence trend of scuticoeiliatosis and mortality of fingerlings in flounder. The diseased fish were collected from on-land rearing farms and hatcheries of flounder in Jeju Island from January l99l to December 20
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