한우의 FABP4, SCD, FASN, SREBPs 유전자에서 경제형질에 영향을 미치는 우수 유전자형 선별

이제영,박재철,Lee, Jea-Young,Park, Jae-Cheol 한국통계학회 2016 응용통계연구 Vol.29 No.7

Kim과 Lee (2015)는 한우의 등급과 지방산을 향상시키는 우수한 FABP4 유전자를 선별하였다. 본 연구의 목적은 유전자를 확장하여 한우의 경제형질에 영향을 미치는 우수한 유전자형을 선별하는 것이다. 확장된 유전자는 한우의 등급과 지방산과 깊은 연관이 있다고 밝혀진 FABP4, SCD, FASN, SREBPs이다. 우리는 환경적인 요인을 제거하여 보정된 경제형질 값을 활용하여 보정된 경제형질 값에 다중인자차원축소 방법을 적용한다. 그 결과 한우의 등급, 지방산을 향상시키는 우수한 유전자와 유전자형을 선별했다. Kim and Lee (2015) identified a superior FABP4 gene that improves the grade and fatty acid of Korean cattle. This study selects a superior genotype by expanding genes that influence the economic traits of Korean cattle. Expanded genes are FABP4, SCD, FASN and SREBPs that are related to grade and fatty acid (Oh, 2014). We use the adjusted economic-trait values with environmental factors excluded. We also applied multifactor dimensionality reduction(MDR) method to data of the adjusted economic-trait values. As a result, we identified superior genes and genotypes which improved the grade and fatty acid of Korean cattle.

방사형그래프를 활용한 한우의 품질관련 주요 유전자 상호작용 효과 규명

이제영,배재영,이진목,오동엽,이성원,Lee, Jea-Young,Bae, Jae-Young,Lee, Jin-Mok,Oh, Dong-Yep,Lee, Seong-Won 한국데이터정보과학회 2013 한국데이터정보과학회지 Vol.24 No.1

최근 인간의 질병과 관련된 유전자 연구가 많이 진행 되고 있다. 인간의 질병에 관련된 유전자는 단일효과보다 상호작용에 의한 효과가 중요하다고 한다. 무수히 많은 유전자들 중에서 상호작용을 찾기 위해서 선형모형 등의 통계적 방법을 이용할 시에는 계산의 복잡성 및 비용등 여러 단점이 생긴다. 따라서 이런 수많은 유전자들 중 주요 유전자 상호작용을 찾는 방법으로 SNPHarvester가 개발되었다. 본 연구에서는 최근에 밝혀진 한우의 지방산과 경제형질에 관련된 32개의 우수 단일 염기 다형성(SNP)를 이용하여 주요 유전자 조합을 SNPHarvester방법에 적용하여 분석한 결과를 시각적으로 쉽게 확인하기위해 방사형 그래프로 나타냄으로써 한우의 맛과 육질을 높일 수 있는 단일 염기 다형성 조합을 시각적으로 찾아내고, 각 형질별 단일효과와 상호작용 효과의 차이를 비교하여 단일효과보다 상호작용에 의한 효과가 더 큰 차이를 시각적 효과로 규명하였다. It is well known that disease of human and economic traits of livestock are affected a lot by gene combination effect rather than a single gene effect. But existing methods have disadvantages such as heavy computing, many expenses and long time. In order to overcome those drawbacks, SNPHarvester was developed to find the main gene combinations among the many genes. In this paper, we used the superior gene combination which are related to the quality of the Korean beef cattle among sets of SNPs by SNPHarvester, and identified the superior genotypes using radial graph which can enhance various qualities of Korean beef among selected SNP combinations.

Q-Q 플롯에 의한 Agreement의 통계적 분석

이제영,이성원,이재우,Lee, Jae-Young,Rhee, Seong-Won,Lee, Jae-Woo 한국데이터정보과학회 1998 한국데이터정보과학회지 Vol.9 No.1

In clinical measurement comparison of a new measurement technique with an established one is often needed to see whether they agree sufficiently for the new to replace the old. Such investigations are often analysed inappropriately, notably by using the correlation coefficient(r). So, the measurement for agreement was determined by Bland & Altman's method recently. In this article, we will analyse the measurement for agreement by using Q-Q plot and by applying Bland and Altman's method through graph. And we will show characteristics for these techniques. 의학에서 새로운 치유방법으로 예전의 방법을 대신하여 교체 사용할 수 있는가 하는 물음에 대하여, 기존에는 상관계수(r)를 이용하여 결정하였으나 최근에는 Bland와 Altman식의 Agreement를 이용하여 결정한다. 본 논문에서는 이들이 표현되는 특성을 Q-Q플롯을 이용하여 살펴보고 이것을 Bland와 Altman식의 방법을 응용하여 그래프를 통한 Agreement에 대하여 분석을 하고자 한다.

광경화 나노 실리카 잉크의 합성 및 잉크젯 프린팅 적층 특성평가

이제영,이지현,박재현,남산,황광택,김진호,한규성,Lee, Jae-Young,Lee, Ji-Hyeon,Park, Jae-Hyeon,Nahm, Sahn,Hwang, Kwang-Taek,Kim, Jin-Ho,Han, Kyu-Sung 한국결정성장학회 2019 한국결정성장학회지 Vol.29 No.6

디지털 잉크젯 프린팅 기술은 고해상도, 빠른 인쇄 속도, 높은 잉크 효율과 같은 장점과 함께 다양한 소재 적용이 용이하여 반도체, 디스플레이, 세라믹 타일 등의 산업 분야에서 주목을 받고 있다. 최근에는 전통적인 잉크 소재에서 벗어나 우수한 내열성, 내광성, 내화학성 등을 보이는 기능성 소재도 잉크젯 프린팅 공정에 적용하려는 시도가 활발히 진행되고 있다. 특히 2차원 인쇄뿐만 아니라 3차원 적층인쇄에 관한 연구도 시작되고 있으며 이를 위해서는 토출되는 잉크의 유변학적 물성과 프린트되는 기판과의 상호작용를 제어하는 것이 필수적이다. 본 연구에서는 나노 실리카 입자가 포함된 광경화성 세라믹 잉크를 합성하고 잉크의 물성과 프린팅 기판의 표면특성을 제어하였다. 나노 실리카 입자가 포함된 광경화성 세라믹 잉크의 퍼짐현상을 억제하고 기판과의 접촉각 특성을 개선함으로써 결과적으로 프린팅 해상도 및 적층성을 향상시켰으며 잉크젯 프린팅을 이용한 광경화 나노 실리카 잉크의 3D 프린팅에 대한 가능성을 확인하였다. Recently, ink-jet printing technology has been applied for various industries such as semiconductor, display, ceramic tile decoration. Ink-jet printing has advantages of high resolution patterning, fast printing speed, high ink efficiency and many attempts have been made to apply functional materials with excellent physical and chemical properties for the ink-jet printing process. Due to these advantages, research scope of ink-jet printing is expanding from conventional two-dimensional printing to three-dimensional printing. In order to expand the application of ink-jet printing, it is necessary to optimize the rheological properties of the ink and the interaction with the substrate. In this study, photo curable ceramic complex ink containing nano silica particles were synthesized and its printability was characterized. Contact angle of the photo curable silica ink were modified by control of the ink composition and the surface property of the substrate. Effects of contact angle on printing resolution and three-dimensional printability were investigated in detail.

유전자 알고리즘에 의한 우수 유전자형 선별

이제영,고진영,Lee, Jae-Young,Goh, Jin-Young 한국데이터정보과학회 2009 한국데이터정보과학회지 Vol.20 No.4

컴퓨터공학의 발전으로 인해, 여러 개의 변수가 존재하는 비선형 문제와 같은 최적해 탐색과 최적화에 사용되는 유전자 알고리즘은 많은 분야에서 활발하게 응용되고 있다. 그 중, 데이터마이닝분야에서 유전자 알고리즘을 이용하여 정확도를 최대로 하는 입력변수 선택방법과 여러 예측모형을 통합하는 방법 등이 제시되었다. 한편, 우리나라 축산업을 대표하는 한우의 유전자원 보존과 능력향상을 위해서는 다음세대에 유전이 되는 단일염기다형성에서 특정 유전자형을 가진 한우가 경제형질이 우수한지를 찾아낼 필요가 있다. 이에 따라, 유전자 알고리즘을 이용하여 한우의 경제형질에 가장 많은 영향을 주는 단일염기다형성 조합마커의 유전자형을 선택하는 방법을 제시하였다. 그리고 실제 한우 유전 데이터에 적용하여 주요 단일염기다형성 조합마커에서 우수 유전자형들을 선별하였다. From development of computer science, genetic algorithm has been applied to many fields for search like non-linear problem based on various variables and optimization process. Among others, in the data mining field, there are methods to select the best input variables for model accuracy and various predict models which were merged by using the genetic algorithm. In the meantime, to improve and preserve quality of the Hanwoo (Korean cattle) which is represented the agricultural industry in our country, we need to find out outstanding economical traits of Hanwoo in having specific genotype of single nucleotide polymorphism (SNP) which is inherited to next generation. According to, This research proposed the selecting method to find genotype of SNPs marker which affects economical traits of the Hanwoo by using the genetic algorithm. And we selected the best genotypes of the principal SNPs marker by applying to real data on Hanwoo genetic.

정규성 그래프의 검정력 비교

이제영,이성원,Lee, Jae-Young,Rhee, Seong-Won 한국데이터정보과학회 1999 한국데이터정보과학회지 Vol.10 No.2

정규분포에 관한 검정에 있어서 P-P 플롯과 Q-Q 플롯에서 정규분포에서의 기대 직선의 잔차들을 이용한 두 가지 통계량을 제시하고, 이 통계량들의 경험적 분위수(empirical quantile)를 구하였다. 그리고 이들 통계량의 검정력을 Shapiro-Wilk의 W 통계량과의 비교를 통하여 분석하였다. We suggest test statistics for normality using Q-Q plot and P-P plot and obtain empirical quantities of these statistics. Also the power comparison with Shapiro-Wilk's W is conducted by Monte Carlo study.

베이지안 네트워크와 방사형 그래프를 이용한 섬망의 효과 규명

이제영,배재영,Lee, Jea-Young,Bae, Jae-Young 한국데이터정보과학회 2011 한국데이터정보과학회지 Vol.22 No.5

최근 의학에서는 정신 질환과 관련된 위험 인자를 찾는 것이 중요해지고 있다. 인자들을 찾아서 인자들의 특성과 관련성을 파악하면 병을 사전에 예방 할 수 있다. 또한 이 연구는 의학 발전에 많은 도움을 줄 수 있다. 정신 질환에 대한 위험요인은 주로 로지스틱 회귀모형을 사용하여 찾아 왔다. 하지만 이 논문에서는 데이터마이닝 기법 중 CART, C5.0, 로지스틱, 신경망, 베이지안 네트워크 방법을 이용한다. 정신장애 질병인 섬망자료를 적용하여, 최적의 모형인 베이지안 네트워크 방법을 선택하였다. 이 베이지안 네트워크 기법을 위험 요소를 찾는데 사용하고, 이 위험인자 간의 관계를 방사형 그래프를 통해서 규명하였다. In recent medical analysis, it becomes more important to looking for risk factors related to mental illness. If we find and identify their relevant characteristics of the risk factors, the disease can be prevented in advance. Moreover, the study can be helpful to medical development. These kinds of studies of risk factors for mental illness have mainly been discussed by using the logistic regression model. However in this paper, data mining techniques such as CART, C5.0, logistic, neural networks and Bayesian network were used to search for the risk factors. The Bayesian network of the above data mining methods was selected as most optimal model by applying delirium data. Then, Bayesian network analysis was used to find risk factors and the relationship between the risk factors are identified through a radial graph.

한우의 지방산 조성에 영향을 미치는 SREBPs와 FABP4의 유전자 조합 규명

이제영,장지은,오동엽,Lee, Jae-Young,Jang, Ji-Eun,Oh, Dong-Yep 한국데이터정보과학회 2015 한국데이터정보과학회지 Vol.26 No.3

Disease of human and economic traits of livestocks are affected a lot by gene combination effect rather than a single gene effect. In this study, we used SNPHarvester method that supplement existing method in order to investigate the interaction of these genes. The used genes are SREBPs (g.3270+10274 C>T, g.13544 T>C) and FABP4 (g.2634+1018 A>T, g.2988 A>G, g.3690 G>A, g.3710 G>C, g.3977-325 T>C, g.4221 A>G) that are closely related to the fatty acid composition affecting the meatiness of Korean cattle. The economic traits which are used are oleic acid (C18:1), monounsaturated fatty acid (MUFA), marbling score (MS). First, we have utilized the SNPHarvester method in order to find excellent gene combination, and then used the multifactor dimensionality reduction method in order to identify excellent genotype in gene combination. 인간의 질병 또는 가축의 경제적인 특성은 단일 유전자보다는 여러 유전자들의 상호작용에 의한 영향을 많이 받는다. 본 연구에서는 이러한 유전자들의 상호작용을 규명하기 위해 기존에 사용되었던 방법들의 단점을 보완한 에스엔피 하비스트 방법을 이용하였다. 사용된 유전자는 최근 한우의 육질에 영향을 미치는 지방산 조성과 깊은 연관이 있다고 밝혀진 단일염기다형성 중 SREBPs (g.3270+10274 C>T, g.13544 T>C)와 FABP4 (g.2634+1018 A>T, g.2988 A>G, g.3690 G>A, g.3710 G>C, g.3977-325 T>C, g.4221 A>G)이며, 경제형질은 한우의 맛과 향에 영향을 주는 올레인산, 불포화지방산, 근내지방도를 이용하였다. 먼저 에스엔피 하비스트 방법을 이용하여 경제형질에 영향을 주는 우수 유전자 조합을 찾은 뒤 다중인자차원축소방법을 이용하여 단일염기다형성 조합 내의 우수 유전자형도 함께 규명하였다.

A Major DNA marker Mining of ILST035 microsatellite loci in Hanwoo Chromosome 6

이제영,여정수,김재우,이용원,Lee, Jea-Young,Yeo, Jung-Sou,Kim, Jae-Woo,Lee, Yong-Won 한국데이터정보과학회 2002 한국데이터정보과학회지 Vol.13 No.2

K-Means modelling has been tried for finding major DNA marker of ILST035 microsatellite loci in Hanwoo Chromosome 6 linkage map. Major DNA markers are obtained from the ILST035 microsatellite through quantitative trait loci(QTL) and data mining modelling.

Lpg 배관망 지원사업 비용편익분석을 통한 기후변화대응전략의 허와 실

이제영(Jae Young, Lee),김준성(Junseong, Kim),엔크자르갈(Enkhjargal Volodya) 한국환경정책학회 2018 한국환경정책학회 학술대회논문집 Vol.2018 No.2