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신상수(Sangsu Shin) 한국가금학회 2017 韓國家禽學會誌 Vol.44 No.2
The quail (Coturnix japonica) has been used as a model animal in many research fields and its application is still expanding in other fields. Compared to the chicken, the quail is quicker to reach sexually maturity, has short generation intervals, is easy to handle, requires less space and feed, and is sturdy. In addition, it produces many eggs and the research tools developed for chicken can be applied directly to quail or with some modifications. Due to recent advances in nextgeneration sequencing, abundant sequence data for the quail genome and transcripts have been generated. These sequence data are valuable sources for studying functional genomics using quail, which is one of the model animal used to investigate gene function and networks. Although there are some obstacles to be removed, the quail is the best optimized model to study the functional genomics of poultry. In many research fields, functional genomics study using the quail model will provide the best opportunity to understand the phenomena and principles of life. We review why, among many other birds, the quail is the best model for studying poultry functional genomics.
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메추리 Chibby Family Member 2 (CBY2) 유전자의 클로닝과 메추리 근육세포에서의 특성 분석
이인표(Inpyo Lee),신상수(Sangsu Shin) 한국가금학회 2020 韓國家禽學會誌 Vol.47 No.3
Chibby family member 2(CBY2)은 Chibby-like super family domain을 가지고 있으며, SPERT 또는 NURIT 등으로도 알려져 있지만, 그 기능이 많이 알려져 있지는 않다. 본 연구에서는 메추리 CBY2 유전자를 클로닝하여 그 서열을 분석하고, QM7 메추리 근육 세포의 근육발생에서의 역할을 분석하였다. 메추리 CBY2의 코딩 서열은 978개의 염기로 이루어져 있으며, 이는 325개의 아미노산으로 번역되어진다. 메추리 CBY2는 닭의 CBY2와 가장 유사했으며, 이들 조류의 CBY2는 진화 역사상 일찍이 포유류의 CBY2와 나뉘어진 것으로 분석되었다. 단백질 도메인 예측 분석 결과, 메추리 CBY2는 N-말단 쪽에, 포유류와 비교 시 상이한 아미노산을 많이 갖고는 있지만, 83개의 아미노산으로 이루어진 Chibbylike superfamily domain을 가진 것으로 확인되었다. 메추리의 다양한 조직 중 CBY2는 지방조직에서 가장 많이 발현했으며, 간, 심장, 신장에서는 중간 또는 낮은 정도로 발현했고, 대흉근에서는 극히 낮은 발현을 보였다. CBY2의 근육발생에서의 역할을 분석하기 위해 CBY2를 QM7 세포에 과발현시킨 결과, CBY2가 근육발생을 억제하는 것을 확인할 수 있었으며, 근관의 넓이를 수치화해 비교해본 결과, 그 면적이 대조구의 약 25%밖에 되지 않았다. 결론적으로 메추리 CBY2는 Chibby-like superfamily domain을 가지고 있으며, 근육발생을 억제하는 특성이 있다. 추후 연구는 CBY2가 근육발생을 억제하는 기작을 밝혀내는데 중점을 두어야 할 것이다. Chibby family member 2 (CBY2), also known as SPERT or NURIT, is a gene with Chibby-like super family domain, whose function is not well known. In this study, the quail CBY2 gene was cloned, its sequences were analyzed, and its role in the myogenesis of QM7 quail muscle cells was characterized. Quail CBY2 has 978 nucleotides, which are translated into 325 amino acids, and the amino acid sequences are highly similar to those of chicken CBY2. Avian CBY2 diverted from mammalian CBY2 during early evolutionary history. According to the protein domain prediction analysis, quail CBY2 has a Chibby-like superfamily domain consisting of 83 amino acids at the N-terminal of the protein, although compared to mammalian CBY2, many of the amino acids were different. CBY2 was highly expressed in the adipose tissue and moderately expressed in the liver, heart, and kidney, whereas rarely expressed in the muscle tissue in quail. To characterize the role of CBY2 in myogenesis, CBY2 was overexpressed in QM7 cells. The overexpression of CBY2 inhibited myotube formation as shown that the myotube area was approximately only 25% that of the control. Taken together, quail CBY2 has a Chibby-like superfamily domain and inhibits myogenesis. Further studies should focus on the identification of the inhibitory mechanism of CBY2 on myogenesis.
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