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HSPF 와 AEM3D를 이용한 기후변화에 따른 상사호 유역의 수질오염 부하 및 댐 내 수질 변화 특성 분석
고나연,김재영,서동일,Goh, Nayeon,Kim, Jaeyoung,Seo, Dongil 한국수자원학회 2022 한국수자원학회논문집 Vol.55 No.11
This study was carried out to analyze how the flow and water quality of the Sangsa Lake (juam control basin) change according to future climate change and what countermeasures are needed. Aquatic Ecosystem Model) was used in conjunction. As climate change scenarios, RCP (Representative Concentration Pathways) 4.5 and RCP 8.5 scenarios of AR5 (5th Assessment Report) according to the Intergovernmental Panel on Climate Change (IPCC) were used. For the climate change scenario, detailed data on the Sangsa Lake basin were used by the Korea Meteorological Administration, and after being evaluated as a correction and verification process for the 10-year period from 2012 to 2021, the present, 2025-2036, 2045- The summer period from June to August and the winter period from December to February were analyzed separately for each year by dividing it into 2056 and 2075-2086. RCP 8.5 was higher than RCP 4.5 as an arithmetic mean for the flow rate of the watershed of the superior lake for the entire simulation period, and TN and TP also showed a tendency to be higher at RCP 4.5. However, in RCP 8.5, the outflow of pollutants decreased during the dry season and the outflow of pollutants increased during the summer, indicating that the annual pollutant outflow was concentrated during the flood season, and it is analyzed that countermeasures are needed.
고나연,임현섭,유용만,윤영남,Ko, Na Yeon,Lim, Hyoun Sub,Yu, Yong Man,Youn, Young Nam 한국응용곤충학회 2015 한국응용곤충학회지 Vol.54 No.2
담배가루이(Bemisia tabaci)는 외래해충으로 바이러스벡터로 작용하여, 토마토의 토마토황하잎말림병바이러스(TYLCV)를 비롯한 약 100여종의 바이러스를 매개하는 중요한 해충이다. 본 연구에서는 VIGS vector를 이용하여 담배가루이 방제를 위한 target 유전자들을 선발하기 위해 gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA library 제작을 시도하였다. 첫 번째 방법으로 oligo d(T) primer를 사용하였을 때, 평균 약 1 kb의 insert와 $1.4{\times}10^4cfu$의 titer를 확인하였다. 그러나 insert size가 너무 커서 적절하지 않았다. 두 번째 방법으로 attB-N25 random primer를 이용하고, sonication을 6초 실시하여 다시 진행하였다. 그러나 확인되는 insert size는 다소 컸고, 몇몇은 insert가 너무 작아서 밴드가 확인 되지않았으며, $1.04{\times}10^54cfu$의 titer를 확인할 수 있었다. 세 번째 방법으로는 oligo d(T) primer를 이용하였고, sonication을 2초 실시하였다. 그 결과 300 bp~600 bp size의 insert가 확인되었으나, electro transformation을 사용한 첫번째, 두번째 방법에 비해 heat shock transformation을 사용하여 titer가 $5.2{\times}10^24cfu$로 매우 낮은 것을 확인 할 수 있었다. 결과적으로 cDNA library를 만들 때 먼저 random primer를 사용하여 First strand를 합성하여 poly A를 제거하고, 다음으로 sonication을 1초 실시하여 300~700 bp정도의 적절한 size의 insert를 생성하고, 마지막으로 electro-transformation을 실시하여 transformation 효율을 높인다면 VIGS vector에 적합한 cDNA library를 만들 수 있을 것으로 사료 된다. The sweetpotato whitefly, Bemisia tabaci, is the major insect pest that transmitted over 100 plant viruses including tomato yellow leaf curl virus (TYLCV) of tomato plant as virus vector in the world. In this study, cDNA library of whitefly was constructed using Gateway system for selecting target gene in order to control of B. tabaci using virus-induced gene silencing (VIGS) vector with RNAi. First of all, when using oligo d(T) rimer, the calculated titer of cDNA library was confirmed with $1.4{\times}10^4$ clones and average insert sizes was confirmed with 1 kb. However, insert size was very big for construction of cDNA. Otherwise, when using attB-N25 random primer and sonication for 6 sec, the calculated titer of cDNA library was confirmed with $1.04{\times}10^5$ clones. But mostly insert band wasn't identified on the electrophoresis, because it seemed that insert size is too small (${\leq}100bp$), also the size of identified insert was somewhat big. Finally, when using oligo d(T) primer and sonication for 1 sec, cDNA insert of whitefly was appropriated for VIGS with 300-600 bp. However, cDNA sequence included a poly A and titer was very low to $5.2{\times}10^2$ clones. It was supposed that heat shock transformation was used instead of electro-transformation. It is considered that when constructing cDNA library for using VIGS vector, (1) random primer should be used for First strand cDNA synthesis in order to remove poly A and (2) sonication for 1 sec should be performed in order to get appropriated insert size and (3) electro-transformation should be performed in order to improve transformation efficiency.
RNAi에 적용하기 위한 Gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA library construction.
고나연,김정규,권혜리,류태희,강찬영,정유빈,김현승,서미자,임현섭,유용만,윤영남 한국응용곤충학회 2014 한국응용곤충학회 학술대회논문집 Vol.2014 No.10
담배가루이(Bemisia tabaci)의 약제에 대한 저항성 문제를 해결하기 위한 방편 의 일환으로 RNA interference(RNAi)를 이용한 해충방제가 시도되고 있다. 본 연 구에서는 RNAi를 이용하여 담배가루이 방제를 위한 target 유전자들을 선발하기 위해 gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA library 제작하고, RNAi에 적절 한 약 100-400bp의 insert를 확인하였다. 또한, blast search 및 EST database 비교 분석 결과, 대부분이 담배가루이 관련 유전자임을 확인하였고, 최종적으로 1.75⨉ 106 titer의 담배가루이 cDNA library를 완성하였다. 완성한 cDNA library를 att site 를 가지는 TRV(tobacco rattle virus) RNA2 vector에 LR recombination한 다음 Agrobacterium tumefaciens (EHA105)에 transformation 후 sequencing을 통해 redundancy를 확인하였다. A. tumefaciens (EHA105)에 transformation된 cell을 토 마토에 Agro-infiltration 시킨 후 담배가루이가 섭식하여 체내에서도 RNAi의 발현 을 유도하면 담배가루이 살충 또는 기피효과를 행동학적 변화로 확인하고, 또한 이 와 관련된 target 유전자를 선발하는데 이용될 수 있을 것으로 사료된다.
Gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA Library Construction
고나연,박상은,류태희,김정곤,신효섭,권혜리,김정규,서미자,임현섭,유용만,윤영남 한국응용곤충학회 2013 한국응용곤충학회 학술대회논문집 Vol.2013 No.10
담배가루이(Bemisia tabaci)는 외래해충으로 바이러스벡터로 작용하여, 토마토 에 토마토황하잎말림병바이러스(TYLCV)를 비롯한 약 100여종의 바이러스를 매 개하는 중요한 해충이다. 담배가루이는 화학합성 작물보호제에 대한 저항성 발현 이 빨라서 이들의 방제에 어려움을 겪고 있다. 이러한 저항성 문제를 조금이라도 해 결하기 위한 방편의 일환으로 최근에 RNA interference(RNAi)를 이용한 해충방제 가 시도되고 있다. 뿐만 아니라, RNAi를 이용하면 target 유전자를 연구하는데 도 움이 될 수 있다. 본 연구에서는 RNAi 를 이용하여 담배가루이 방제를 위한 target 유전자들을 선발하기 위해 gateway system을 이용한 담배가루이 cDNA library 제 작을 시도하였다. 첫 번째 방법으로 oligo d(T) primer를 사용하였을 때, 약 1.10kb, 1.28kb의 insert size와 1.4⨉10 4 colony/ml의 titer를 확인하였다. 그러나 insert size 가 너무 커서 적절하지 않았다. 두 번째 방법으로 attB-N25 random primer를 이용 하고, sonication을 6초 실시하여 다시 진행하였다. 그러나 몇몇은 insert size가 다 소 컸고, 몇몇은 insert가 vector에 삽입되지 않았다. 세 번째 방법으로는 attB-N6 random primer를 이용하였고, sonication을 2초 실시하여 더 작은 size의 cDNA insert를 가지는 library 제작을 진행 하였다. 그 결과 몇몇을 제외하고는 300bp~ 500bp size의 insert가 확인 되었으나, titer가 낮아 세 번째 방법을 이용하여 titer를 높이는 방향으로 연구를 수행 중에 있다.
RNAi에 의한 담배가루이(Bemisia tabaci, 가루이과, 노린재목)의 개체군 밀도변화
고나연(Na-Yeon Ko),윤영남(Young-Nam Youn) 충남대학교 농업과학연구소 2015 농업과학연구 Vol.42 No.1
Ninety genes randomly selected from tobacco whitefly (Bemisia tabaci) cDNA library was studied for selecting target gene in order to control of tobacco whitefly using TRV-VIGS vector (tobacco rattle virus-virus induced gene silencing vector) with RNAi. First of all, the occurrence of B. tabaci adult according to agro-infiltration of TRV was no significant difference. And that of TRV inserted tobacco whitefly cDNA showed a significant difference in each sample. P CV and N CV sample were more than 80% could be confirmed in 5 samples, for example, wh11, wh36, wh46, wh50 and wh71. Lastly, the occurrence of nymph and egg also showed a significant difference in each sample. That could be confirmed in 11 samples, for example, wh01, wh09, wh10, wh15, wh16, wh23, wh24, wh48, wh64 and wh66. In case of wh46, wh50 and wh71 sample could be confirmed that occurrence of B. tabaci adult was many, but occurrence of B. tabaci nymph and egg was a little. So sample showed a physioecological good effect to control of whitefly need to be investigated variation of gene expression in whitefly body using qRT-PCR through individual test.