우리나라 임목육종 연구동향 : 학술지 논문 키워드 분석을 중심으로

어수형(Soo Hyung Eo),이병주(Byeong-Ju Lee),강규석(Kyu-Suk Kang),강준원(Jun-Won Kang),정은주(Eun Ju Cheong),최명석(Myung Suk Choi) 한국육종학회 2020 한국육종학회지 Vol.52 No.S

Studies on forest tree breeding (FTB) in South Korea started in the 1950s and have achieved remarkable outcomes through various techniques and methods such as selective breeding, cross breeding, introduction breeding, and biotechnology. Despite these outstanding achievements, no attempt has been made to objectively and quantitatively evaluate the results of domestic FTB research. Here, we quantitatively analyzed past research trends using keywords of published journal papers and compared the current domestic research level of FTB with the international level. Using various keywords in this field, we searched for research articles published in the Journal of Korean Society of Forest Science, the Korean Journal of Breeding Science, and the journals listed on the Science Citation Index from 1962 to present. The analysis of these studies showed that the research on FTB has grown quantitatively in Korea, and has been conducted on various subjects. Research topics from Korea, in terms of purpose and species, are not significantly different from those of foreign countries. The genus Pinus has been the major subject of FTB studies both domestically and internationally. However, in foreign FTB research, the trees used for research have diversified each year, while they were not diverse in Korea. The FTB research capacity of Korean national institutions, such as the National Institute of Forest Science, continues to dramatically increase, while the research capacity of universities is relatively low. Based on the results of this analysis, it is necessary to establish a concrete and effective policy for future research and development of FTB.

조류 보호를 위한 한·일 조류학자 교류 및 공동연구의 중요성 - 한국과 일본 조류학회 공동 온라인 심포지엄 (21.03.11) 참석기

어수형(Soo Hyung Eo) 한국조류학회 2021 한국조류학회지 Vol.28 No.1

비상(非常)에서 비상(飛翔)을 꿈꾸며

어수형(Soo Hyung Eo) 한국조류학회II 2020 한국조류학회지 Vol.27 No.1

토양의 이화학적 특성 및 미생물 다양성에 대한 산림시업의 영향

이병주 ( Byeng Ju Lee ),어수형 ( Soo Hyung Eo ) 한국임학회 2014 산림과학 공동학술대회 논문집 Vol.2014 No.-

본 연구는 산림시업에 의한 토양 특성의 변화를 연구하여 지속가능한 산림시업기술 개발을 위한 기초자료를 마련을 목표로 하여 시행되었다. 충청북도 청원군 문의면 샘봉산 선도 산림경영단지의 참나무 혼효림을 연구 대상지로 선정하였다. 토양을 채취한 구역은 참나무시들음병 방제를 위해 개벌된 지역으로서, 개벌지와 주변부 미개벌지 각각에서 3지점의 토양 샘플을 채취하였다. 샘플 토양의 이화학적특성 분석을 위해 토양 입도(모래, 미사, 점토), 산도, 유기물, 전질소, 유효인산, 양이온치환용량, 치환성양이온(K+, Na+, Ca2+, Mg2+)을 측정하였으며, 개벌지와 미개벌지에 따른 분석 항목별 차이는 유효인산을 제외하고는 크게 나타나지 않았다. 샘플 토양의 미생물 메타지놈 군집 분석은 토양 미생물의 16S rRNA 염기서열을 이용하였다. 메타지놈 분석을 통해 파악된 OTUs와 미생물 종 수는 개벌지와 미개벌지에 따라 큰 차이를 보이지 않았다. 위의 분석 결과만을 통해 토양 특성에 대한 산림시업의 영향력을 판단하기는 힘들다. 완성된 연구 결과를 위해 앞으로 5년간 추가 샘플 채취 및 분석을 진행해 나갈 계획이다. This study was conducted to analyze clear cut effect on forest soil and to provide basic data for development of sustainable forest practices. For our research, the mixed oak stand forest in mt. Sambong(Chungbuk) was selected as a sampling site. The sample site with treatment had been clear-cut for prevention of oak wilt disease. We collected about 1kg of soil samples from three points of treatment(clear-cut) and control(no-cut), respectively. At first, we analyzed soil physical and chemical characteristics including soil texture(sand, silt, clay), pH, amount of organic matter, total nitrogen, available phosphate, C.E.C(Cation Exchange Capacity), exchangeable cation(K+, Na+, Ca2+, Mg2+). There is no significant differences in analyzed characteristics except available phosphate between treatment and control. At second, metagenomics was tried for analyzing microbial diversity of collected soil samples, which was conducted by using 16S rRNA sequence. OTUs and the number of species observed had no significant distinctions explaining effect of the treatment. We supposed that because of the few number of samples, the effect of clear-cut could not be analyzed obviously. therefore, additional sampling and analysis will be necessary for the next five years.

텍스트마이닝과 동시출현단어 분석을 이용한 국내 조류학 연구동향

진채령(Chaelyeong Jin),어수형(Soo Hyung Eo) 한국조류학회II 2018 한국조류학회지 Vol.25 No.2

국내 조류학 연구의 발전을 위해서는 지금까지 어떤 분야에서 연구를 해 왔는지 살펴보는 것이 중요하다. 우리는 텍스트마이닝과 동시출현단어 분석을 이용하여 어떤 분류군에서 어떤 주제로 조류학 연구가 진행되어 왔는지를 정량적으로 연구하였다. 한국조류학회지 논문 372편을 분석 대상으로 연구한 결과, 개체군 및 군집 모니터링, 미기록종 보고 및 번식생태, 조류 체내 중금속 오염 등의 주제와 관련한 단어가 연구 논문에서 많이 사용되었다. 또한, 청둥오리, 민물도요, 흰뺨검둥오리 등 특정 조류에 연구가 편중되었다는 것도 본 연구를 통해 알 수 있었다. 국내 조류학의 균형있는 발전을 위하여 지금까지 상대적으로 부족했던 연구주제와 분류군이 어떤 것인지 파악하였다는 점에서 본 연구는 의미가 있을 것이다. For balanced development of ornithological research in Korea, it is important to review what birds and what research topics have been studied so far. We quantitatively investigated the trends of domestic ornithological research using text-mining and co-word analysis. As a result of studying 372 articles published in the Korean Journal of Ornithology, which is the most representative ornithological journals, words related to research topics such as population and community monitoring, first record of species and breeding ecology, and heavy metal pollution in birds have been widely used in research articles. Except for subjects such as monitoring and first record of species, studies have not been conducted widely. It was also found that research were concentrated on specific birds such as Anas platyrhynchos, Calidris alpina, and Anas poecilorhyncha. The present study, which analyzed the research topics and avian taxa that were relatively active until now and those which were insufficient, suggests what we should do in the future for the balanced development of ornithological research in Korea.

차세대염기서열방법을 이용한 경북 봉화군 장군봉 소나무림의 토양 박테리아 군집 구성

이병주 ( Byeong-ju Lee ),어수형 ( Soo Hyung Eo ) 한국임학회 2017 한국산림과학회지 Vol.106 No.2

토양미생물은 산림 생태계 구성 요소로써 산림 내 물질 순환 및 식물 생장 등에 중요한 역할을 한다. 그러나 국내산림과학분야에서는 토양 균류 일부 종에 대한 연구가 주로 실시되어졌으며, 박테리아를 포함한 미생물 군집에 대한 연구는 부족한 실정이다. 본 연구에서는 16S rRNA gene 영역에 대한 차세대염기서열분석법을 통해, 장군봉 천연 소나무림 토양내 존재하는 박테리아 군집 구성을 파악하였다. 분석 결과, phylum 수준에서 Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Planctomycetes 등이 나타나, 전형적인 토양 박테리아 군집 구성을 보였다. 또한, 부영양 환경을 선호하는 Proteobacteria가 가장 높은 비율을 차지하였는데, 다른 인공림과 비교하여 장군봉 천연 소나무림 토양 유기물량이 상대적으로 풍부한 것이 원인으로 생각된다. 한편, 토양 내 질소 순환에 기여를 하는 뿌리혹박테리아 분류군을 살펴본 결과, Burkholderia, Bradyrhizobium, Rhizobium 속이 주로 존재하는 것을 확인하였다. 토양 물리 · 화학적 특성과 박테리아 군집 구성간의 상관관계를 분석한 결과, 토양 내 pH가 박테리아 군집 구성과 관련된 주요 토양 특성인 것으로 확인되었다. The soil microbiome plays important roles in material cycling and plant growth in forest ecosystem. Although a lot of researches on forest soil fungi in Korea have been performed, the studies on forest soil bacterial communities have been limited. In this study, we conducted next generation sequencing (NGS) targeting 16S rRNA gene to investigate the soil bacterial communities from natural red pine (Pinus densiflora) forest in Mt. Janggunbong, Bonghwa-gun, Gyeongbuk, Korea. Our results showed that the entire bacterial communities in the study sites include the phyla Proteobacteria, Acidobacteria, Actinobacteria, Planctomycetes, which have been typically observed in forest soils. The composition ratio of Proteobacteria was the highest in the soil bacteria community. The results reflect that Proteobacteria is copiotroph, which generally favors relatively nutrient-rich conditions with abundant organic matter. Some rhizobia species such as Burkholderia, Bradyrhizobium, Rhizobium, which are known to contribute to soil nitrogen-fixation, exist in the study sites. As a result of correlation analysis between soil physicochemical characteristics and bacteria communities, the soil pH was significantly correlated with the soil bacteria compositions.

흰목물떼새와 근연종들의 동정을 위한 새로운 COI 바코딩 프라이머

진채령(Chaelyeong Jin),김인철(Incheol Kim),남형규(Hyung-Kyu Nam),허위행(Wee-Haeng Hur),어수형(Soo Hyung Eo) 한국조류학회II 2020 한국조류학회지 Vol.27 No.1

흰목물떼새(Charadrius placidus)는 모래와 자갈이 있는 하천변에서 번식하는 드문 텃새로 국내에서는 멸종위기야생동물 II급으로 지정되어 보호받고 있다. 멸종위기야생동물의 연구를 위해서는 동물을 직접 포획하여 연구에 필요한 시료를 확보하는 것보다는 깃털, 분변 등과 같은 비침습적인 방법으로 시료를 확보하는 것이 제안되고 있다. DNA 바코딩 기법은 비침습적인 방법으로 확보한 시료로부터 종 동정을 가능하게 하므로 멸종위기종의 보전 및 관리에 도움을 준다. 조류 DNA 바코딩은 미토콘드리아 유전체의 COI(cytochrome C oxidase I) 염기서열 정보를 주로 이용하며, 많은 종에 적용 가능한 PCR 프라이머가 이미 개발되어 있다. 본 연구에서는 비침습적 시료를 이용하여 흰목물떼새를 근연종으로부터 동정할 목적으로 COI 바코딩을 수행하였다. 하지만 기존의 범용 조류 COI 바코딩 프라이머를 이용하여 흰목물떼새의 COI을 증폭하는 것이 어려웠으므로 이 영역을 증폭시킬 수 있는 새로운 프라이머를 개발하였다. 흰목물떼새 한 개체의 시료로부터 미토콘드리아 유전체 염기서열을 해독한 결과, 기존의 프라이머가 부착되는 흰목물떼새의 COI 염기서열 영역에 변이를 확인하였다. 이 변이가 해당 부분에 프라이머의 부착을 어렵게 하여 증폭을 방해한 것으로 보인다. 해독한 흰목물떼새의 미토콘드리아 유전체 염기서열을 참고하여 COI 영역을 증폭시킬 수 있는 새로운 프라이머를 개발하였고, 이 프라이머를 이용하여 흰목물떼새 13개체의 COI 영역을 증폭하고 염기서열을 해독하였다. 근연종인 꼬마물떼새(C. dubius), 왕눈물떼새(C. mongolus), 흰물떼새(C. alexandrinus)의 COI 영역과 흰목물떼새의 COI 염기서열을 비교한 결과, 흰목물떼새와 근연종 간의 염기서열이 명확하게 구분되었다. 본 연구에서 개발된 COI 영역의 프라이머는 흰목물떼새의 종 동정에 활용될 수 있을 것으로 생각한다. The Long-billed plover (Charadrius placidus) is a rare bird species that inhabits riversides with sand and gravel, and has been designated and protected as a Class II Endangered Wildlife in Korea. Since the capture of endangered wildlife can stress those animals, it has been proposed as a wildlife research method to obtain samples such as feathers and feces by non-invasive methods. The DNA barcoding technique allows species identification from samples obtained by non-invasive methods, thus helping to conserve and manage endangered species. Avian DNA barcoding mainly uses the sequence information of the cytochrome C oxidase I (COI) of the mitochondrial genome, and universal PCR primers applicable to many bird species have already been developed. In this study, COI barcoding was performed for the purpose of identifying Long-billed plover using non-invasive samples. However, it was difficult to amplify the COI of the bird using the universal avian COI barcoding primer, so a new primer set for the Long-billed plover was developed. As a result of sequencing mitochondrial genome from a Long-billed plover, we identified mutations in the COI sequence region to which the existing universal primers are attached. This mutation appears to have prevented amplification by making it difficult to attach the primer to the region. We developed a new primer set that can amplify the COI region of the Long-billed plover, and using this primer to sequence the COI region of 13 birds. As a result of comparing the COI sequences of Long-billed plover with C. dubius, C. mongolus, and C. alexandrinus, the difference in the sequences between Long-billed plover and the related species is clear. We expect that the novel COI primers developed in this study could be used to identify Long-billed plovers.

번식기와 비번식기 까치의 행동 변화

임신재 ( Shin Jae Rhim ),이우신 ( Woo Shin Lee ),어수형 ( Soo Hyung Eo ) 한국환경생태학회 2001 한국환경생태학회지 Vol.15 No.2

산불피해 후 자연복원과 소나무 조림을 실시한 지역에서 설치류 3종의 개체군 밀도 차이

이은재 ( Eun Jae Lee ),손승훈 ( Seung Hun Son ),이우신 ( Woo Shin Lee ),어수형 ( Soo Hyung Eo ),임신재 ( Shin Jae Rhim ) 한국산림과학회 2010 한국산림과학회지 Vol.99 No.4

This study was conducted to clarify the differences in rodents population densities between natural restored and red pine silvicultured forests after forest tire in Samcheok, Gangwon Province, Korea from March to December 2008. One ha size of 3 study plots were set up in each natural restored and silvicultured stand. We trapped the small rodents during 4 consecutive nights every 2 months in each stand. Understory coverage and number of shrub stems were higher in silvicultured stand than in natural restored stand. Coverage of overstory, suboverstory and midstory, number of tree stem, woody seedling stems and dead wood, and amount of coarse woody debris were higher in natural restored stand than in silvicultured stand. Six hundred eighty eight individuals of four species, such as Apodemus agrarius, A. peninsulae, Eothenomys regulus and Tamias sibiricus were captured in our study. Number of captured small rodents were higher in natural restored stand than in silvicultured stand. Also, species compositions were differed in both stands. The captured number of A. agrarius and A. peninslllae were most highest in April and December. E. reglilus were shown higher number of captured in April and June, and r sibiricus were in June and October. Removal of coarse woody debris and silvicultural practice would not be good for the inhabitation of small rodents. For the conservation of small rodents diversity, management of understory and canopy would be needed in forest fired area.

현사시나무에서 Formate Dehydrogenase cDNA의 분리와 특성 구명

이효신 ( Eun Kyung Bae ),배은경 ( Hyo Shin Lee ),이재순 ( Jae Soon Lee ),최영임 ( Young Im Choi ),윤서경 ( Seo Kyung Yoon ),어수형 ( Soo Hyung Eo ) 한국산림과학회 2013 한국산림과학회지 Vol.102 No.3

Formate dehydrogenase (FDH), catalyzing the oxidation of the formate ion to carbon dioxide, is known as the stress protein in response to drought, low temperature and pathogen infection. To study the functions of FDH in poplar (Populus alba × P. glandulosa), we isolated a FDH cDNA (PagFDH1) and examined its expressional characteristics. The PagFDH1 is 1,499 base pairs long and encodes a putative 388 amino acid protein with an expected molecular mass of 42.5 kDa. The PagFDH1 protein has N-terminal mitochondria signal peptide and NAD+ binding domain. Southern blot analysis indicated that a single copy of the PagFDH1 is present in the poplar genome. PagFDH1 is expressed highly in the suspension cells (especially in the lag and early exponential phases) and moderately in roots, flowers and leaves. ABA-mediated enhanced expression of PagFDH1 in response to drought and salt stress treatments indicates that the gene product could play an important role in the development of stress resistant trees.