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- 저자 : 박승진 (검색결과 219 건)
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A ChIP-Seq Data Analysis Pipeline Based on Bioconductor Packages
박승진,김종환,윤병하,김선영 한국유전체학회 2017 Genomics & informatics Vol.15 No.1
Nowadays, huge volumes of chromatin immunoprecipitation-sequencing (ChIP-Seq) data are generated to increase the knowledge on DNA-protein interactions in the cell, and accordingly, many tools have been developed for ChIP-Seq analysis. Here, we provide an example of a streamlined workflow for ChIP-Seq data analysis composed of only four packages in Bioconductor: dada2, QuasR, mosaics, and ChIPseeker. ‘dada2’ performs trimming of the high-throughput sequencing data. ‘QuasR’ and ‘mosaics’ perform quality control and mapping of the input reads to the reference genome and peak calling, respectively. Finally, ‘ChIPseeker’ performs annotation and visualization of the called peaks. This workflow runs well independently of operating systems (e.g., Windows, Mac, or Linux) and processes the input fastq files into various results in one run. R code is available at github: https://github.com/ddhb/Workflow_of_Chipseq.git.
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주기적(週基的)인 압축하중을 받는 원통(円筒) Panel의 동적(動的) 불안정(不安定) 특성(特性)에 관한 연구
박승진,미카미 타카시,Park, Sung Jin,Mikami, Takashi 한국강구조학회 2000 韓國鋼構造學會 論文集 Vol.12 No.6
본 논문은 직선변이 단순지지, 원호변이 단순 또는 고정인 경계조건의 원통 Panel을 해석하였다. 해석방법은 Galerkin법을 사용하였고, 기초방정식은 Love-Timoshenko의 기초식을 이용한 진동 좌굴 및 동적문제에 관한 특성을 명확히 하였다. 특히, 고정지지를 포함한 Panel에 대해서는 시행함수로서 삼각함수만으로 나타나는 경우와 쌍곡선함수로 나타나는 보의 고유함수를 이용하여 해석하였으며 시행함수에 미치는 영향을 검토하였다. This paper presents a numerical analysis procedure and a characteristics for dynamic of cylindrical panels. The panels with simply-simply or simply-clamped edge supports are subjectes to circumferential compressive or flexural stresses. The differential equations governing vibration and dynamic for these panels are derived by using the fundamental differential equation of the Love-Timoshenko and are solved numerically by the Galerkin method. The panel with simply-clamped edge supports is used a trigonometric function or an eigen function of a beam as a trial function and the effects of trial functions on numerical solutions are displayed. Numerical results are presented to demonstrate the effects of the flexural parameters in natural frequencies and coefficients of critical buckling, and some typical mode shapes of vibration and buckling are also presented.
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역대칭 Angle-Ply 적층판의 변형에너지 특성에 관한 연구
박승진,Park, Sung Jin 한국강구조학회 2000 韓國鋼構造學會 論文集 Vol.12 No.6
두 변이 단순지지된 역대칭 Angle-Ply 적층판의 자유진동에 대하여 Yang, Norris, Stavsky의 YNS 이론을 이용하여, 적층판의 자유진동해석 및 변형에너지 해석을 하였다. 적층판의 운동방정식은 선점법을 사용하여 해석하였고, 탄성계수비와 적층수가 고유진동수에 미치는 영향을 검토하였다. 또한 변형에너지 분포 해석을 이용하여 적층판의 진동특성을 명확히 규명하였다. A powerful analytical procedure and strain energy analysis to investigate the free vibration of antisymmetric angle-ply laminated plates, having one pair of opposite edges simply supported, are develped on the basis of the Yang, Norris and Stavsky (YSN) theory. The equation of motion of the plate are solved by the use of collocation method. A range of results are presented for plates to show the effects of modulus ratio and number of layers on natural frequency. In addition, an analysis of the strain energy distributions is used as an aid for the better understanding of the vibration characteristics of the plates.
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조직 분석을 위한 최적 Quadrature Polar Separable 필터의 설계
박승진,문용선,박종안 조선대학교 생산기술연구소 1991 生産技術硏究 Vol.13 No.1
조직 프로세씽을 위한 개선된 2-D QRS(Quadrature Polar Separable)필터와 그의 응용이 본 논문에서 고찰된다. 필터의 주파수 응답은 독립된 2부분 즉 PPS(Prolate Spheroidal Sequence)에 근거한 라이얼 웨이팅 함수와 Kuntsson 필터에서의 방향각 함수로 구성된다. 필터는 2PSS로 구성되는 2-D Cartesian 필터와 같이 각 함수를 라디얼 웨이팅 함수에 근사화 시키기 때문에 에너지 손실면에서 최적화되며, 설계 명세 조건이 대역폭, 방향각, 그리고 중심 주파수에만 의존하므로 제어하기가 쉽다. 또한 주파수 영역에서 Kuntsson 필터보다 순환적 대칭 특성을 갖는다. 주파수 영역에서 로칼조직의 방향과 주파수 성분을 평가하기 위하여, 조직 합성, 방향각 측정, 그리고 조직 세그멘테이션과 같은 몇 가지 응용이 고찰된다. An improved 2-D quadrature polar separable(QPS) filter and its applications to texture processing are discussed in this paper. The frequency response of the filter consists of two independent parts. The first is a radial weighting function based on the prolate spheroidal sequence(PSS). The second is the same orientational function of the angle as in the Knutsson filter. The new filter is suboptimal in the energy loss because we let the polar angle function approximate the radial weighting function as in the 2-D Cartesian filer composed of two PSS's. It is easy to control as it depends only upon the design specifications of the bandwidth, the directional angle, and the central frequency, Also the filter is circularly more symmetric in the frequency domain than the Knutsson filter, In order to estimate the orientatation and the frequency component of local textures in the frequency domain, some applications of the new filter, such as the generation of synthetic textures, the estimation of texture orientations, and texture segmentations, are discussed.
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박승진,Park, Seung-Jin 한국정보통신집흥협회 1998 정보화사회 Vol.122 No.-
사이버마켓이란 인터넷 등 전자적 매체를 통하여 마케팅, 재화 및 서비스의 매매, 대금결재 등 일체의 상거래가 직접 이루어지는 사이버 스페이스(가상공간)상에서 형성된 새로운 시장이다.
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강화학습을 이용한 자율주행 트랙터의 가변형 전방주시거리 튜닝 알고리즘 개발
박승진,전찬우,김학진 제어·로봇·시스템학회 2022 제어·로봇·시스템학회 논문지 Vol.28 No.11
Robust path tracking is important for an autonomous tractor to accurately track a path, including straight and curved paths, with headland turning in farmlands. To improve the performance of a path-tracking method developed on the basis of fixed look-ahead distances, this paper presents a look-ahead distance tuning algorithm based on reinforcement learning (RL). The RL architecture is designed to provide variable look-ahead distances in real time based on navigation conditions caused by changes in the lateral deviations and heading errors. The RL agent performed self-learning in the simulation while following C-type turning-based paths. For more effective RL, a simulation model was built by applying the actual responses of a tractor steering system measured using a data acquisition system. An evaluation test was conducted in terms of the lateral deviation in response to the reference path. The proposed method improved the path-tracking accuracy of the lateral deviation by a root mean-squared error of about 62% compared to a path-tracking controller with fixed look-ahead distances. .
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선점법에 의한 기하학적 비선형을 고려한 보의 동적문제 해석 연구
박승진,손지현 한국재난정보학회 2015 한국재난정보학회 학술대회 Vol.2015 No.11
본 연구에서는 다른 해법과 비교하여, 비선형 진동문제 선점법 적용성, 유효성을 확인하고, F.E.M 결과와의 응답 곡선에 비교하여, 비선형 동적응답문제의 선점법 적용성을 연구한다. 또한 축방향 관성은 세장비가 크기에 따라 그 영향이 어떻게 나타나는지 연구한다.
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박승진,양수정 한국재난정보학회 2015 한국재난정보학회 학술대회 Vol.2015 No.11
본 연구에서는 충격 문제를 거론하며 Mindlin 판 이론을 확장한 1차 전단 변형 이론에 근거하 여 충격 하중을 받는 임의의 형상 라미네이트 응답 특성의 해명을 목적으로 아이소파라메트릭요 소에 의한 정식화를 시도한다.
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