엽록체 Genome

김한집 한국분자생물학회 1989 분자생물학뉴스 Vol.1 No.2

Cycle Sequencing 에서 [ α- 32 P ] dATP 를 Taq DNA Polymerase 로 Primer 에 표지하는 간편한 방법

김한집,김병국 ( Hanjip Kim,Byung Kook Kim ) 생화학분자생물학회 1993 BMB Reports Vol.26 No.6

A simplified method for cycle sequencing is introduced. Previously, sequencing primers for cycle sequencing were end-labelled with γ-labelled NTPs by a polynucleotide kinase. The end-labelled primer method is effective but costly because a researcher has to purchase both the polynycleotide kinase and the γ-labelled nucleotide. In our method, we labelled the 3` end of the primer with the [a-^(32)P]dATP using a Taq DNA polymerase. During the labelling process, extension of the primer was stopped and arrested after labelling because no other dNTPs were provided except the [a -^(32)P]dATP. There was no need to add more Taq DNA polymerase to complete both primer-labelling and sequencing processes. In our laboratory, the method enabled us to routinely label primers for sequencing without the use of the polynucleotide kinase, and has eliminated the need to purchase the γ-labelled nucleotide for end-labelling. The method was also effective for sequencing directly from a bacterial colony. This would further save time and materials for sequencing.

Cycle Sequencing에서 $[{\alpha}-^{32}P]$dATP를 Taq DNA Polymerase로 Primer에 표지하는 간편한 방법

김한집,김병국,Kim, Han-Jip,Kim, Byung-Kook 생화학분자생물학회 1993 한국생화학회지 Vol.26 No.6

최근에 개발된 cycle sequencing은 thermal cycler를 사용하여 적은 양의 template DNA만으로 sequencing을 가능하게 하는 새로운 방법이다. 그러나 지금까지 소개된 방법에서는 ${\gamma}-labelled$ NTP와 polynucleotide kinase를 이용하여 end-labelled된 sequencing primer를 만들어서 사용하여야한다. end-labelled primer를 사용하여 cycle sequencing을 하면 효과적인 결과를 얻을 수 있으나 polynucleotide kinase의 구입이 필수적이다. 뿐만 아니라 국내에서 여러 종류의 동위원소를 손쉽고 저렴하게 구입하고 또한 보관하기 어렵다는 문제점을 개선하기 위해 필자들은 Taq DNA polymerase를 이용하여 ${\gamma}-labelled$ dATP로 pnmer를 표지하는 간편한 방법을 강구하였다. 즉, thermal cycler에서 Taq DNA polymerase에 의해 pnmer의 3' 말단을 단지 $[{\alpha}-^{32}P]dATP$만으로 신장하여 표지시켰다. 이때 다른 종류의 dNTP를 공급하지 않아 $[{\alpha}-^{32}P]dATP$로 표지된 primer는 신장이 중단되며 이들 primer로 cycle sequencing을 수행하였다. 이 간편한 primer 표지방법은 기존의 end-labelled primer방법만큼 효과적이므로 본 실험실에서는 end-labelling을 위한 ${\gamma}-labelled$ nucleotide와 polynucleotide kinase의 구입이 필요없게 되었다. 또한 end-labelled primer 방법과 같은 양의 Taq DNA polymerase로 primer의 표지와 sequencing의 연속반응을 할 수 있었다. 나아가서 이 방법으로 박테리아 colony로부터 직접 sequencing이 효율적으로 수행되어 sequencing을 위한 시간과 시약의 절약이 더욱 가능하게 되었다. A simplified method for cycle sequencing is introduced. Previously, sequencing primers for cycle sequencing were end-labelled with ${\gamma}-labelled$ NTPs by a polynucleotide kinase. The end-labelled primer method is effective but costly because a researcher has to purchase both the polynycleotide kinase and the ${\gamma}-labelled$ nucleotide. In our method, we labelled the 3' end of the primer with the $[{\alpha}-^{32}P]dATP$ using a Taq DNA polymerase. During the labelling process, extension of the primer was stopped and arrested after labelling because no other dNTPs were provided except the $[{\alpha}-^{32}P]dATP$. There was no need to add more Taq DNA polymerase to complete both primer-labelling and sequencing processes. In our laboratory, the method enabled us to routinely label primers for sequencing without the use of the polynucleotide kinase, and has eliminated the need to purchase the ${\gamma}-labelled$ nucleotide for end-labelling. The method was also effective for sequencing directly from a bacterial colony. This would further save time and materials for sequencing.

다층모형을 활용한 신재생 에너지 사업 참여 로드맵에 미치는 영향 요인 분석

김한집 한국콘텐츠학회 2021 한국콘텐츠학회논문지 Vol.21 No.10

At this point in time when active participation in renewable energy projects is required, basic information on growth engines and substantial promotion strategies for participation in renewable energy projects is needed. According to the this study tried to provide basic information for vitalizing participation in the renewable energy business by analyzing the factors affecting the new energy business participation roadmap using the multi-layered model. As a result of this study, it can be seen that in order to achieve an effective new energy business participation roadmap, it is necessary to re-establish the new and renewable energy business participation factors by industry. Specifically, it is necessary to prepare appropriate countermeasures such as the leading organization of the project, profit distribution method, green industry financial support, project implementation method, power plant location, and comprehensive long-term strategy, and there is an institutional approach that can promote the development of related industries. found to be necessary. Above all, it suggested that in order to achieve an effective new energy project participation roadmap, an institutional approach is needed that can expand the supply of new and renewable energy while minimizing the burden on the national economy and promote the development of related industries. 신재생 에너지에 관한 적극적 사업 참여가 필요한 현 시점에서, 신재생 에너지 사업 참여의 성장동력과 내실있는 추진전략에 대한 기초정보가 필요하였다. 이에 따라 본 연구는 다층모형을 활용한 신재생 에너지 사업 참여 로드맵에 미치는 영향 요인을 분석하여, 신재생 에너지 사업 참여 활성화를 위한 기초정보를 제공하고자 하였다. 본 연구결과, 실효성있는 신재생 에너지 사업 참여 로드맵을 달성하기 위해서는 업종별 신재생 에너지 사업 참여 요소의 재정립이 필요함을 살펴볼 수 있다. 구체적으로 살펴보면, 사업의 주도 단체, 이익배분 방식, 녹색산업 금융지원, 사업 시행 방식, 발전소 위치, 포괄적 장기전략 등의 적절한 대응방안 마련이 필요하고, 관련 산업의 육성을 촉진할 수 있는 제도적 접근이 필요할 것임을 발견하였다. 무엇보다 실효성있는 신재생 에너지 사업 참여 로드맵을 달성하기 위해서는 국가경제에의 부담을 최소화하면서 신재생에너지의 보급을 확대하고 관련 산업의 육성을 촉진할 수 있는 제도적 접근이 필요함을 시사하였다.

IEEE 802.11 기반 이동 ad-hoc 망에서 TCP 성능 향상을 위한 적응적 DCF 알고리즘 설계

김한집,이재용,김병철,이기라 대한전자공학회 2006 電子工學會論文誌-TC (Telecommunications) Vol.43 No.10

TCP is the most widely used transport protocol in Internet applications that guarantees a reliable data transfer. But, in the wireless multi-hop networks, TCP performance is degraded because it is designed for wired networks. The main reasons of TCP performance degradation are contention for wireless medium at the MAC layer, hidden terminal problem, exposed terminal problem, packet losses in the link layer, unfairness problem, reordering problem caused by path disconnection, bandwidth waste caused by exponential backoff of retransmission timer due to node's mobility and so on. Specially, in the mobile ad-hoc networks, discrepancy between a station's transmission range and interference range produces hidden terminal problem that decreases TCP performance greatly by limiting simultaneous transmission at a time. In this paper, we propose a new MAC algorithm for mobile ad-hoc networks to solve the problem that a node can not transmit and just increase by hidden terminal. In the IEEE 802.11 MAC DCF, a node increases exponentially when it fails to transmit, but the proposed algorithm changes adaptively according to the reason of failure so we get a TCP performance enhancement. We show by ns-2 simulation that the proposed algorithm enhances the TCP performance by fairly distributing the transmission opportunity to the failed nodes by hidden terminal problems. TCP는 신뢰성을 보장하는 전송 프로토콜로서 인터넷 등에서 가장 널리 사용되고 있는 전송 방식이다. 하지만 TCP는 유선망에 적합하도록 설계되었기 때문에 무선망에서 TCP를 사용할 경우 성능 저하가 발생된다. TCP의 성능 저하 원인으로는 MAC 계층에서의 무선 매체 경쟁, hidden-terminal 문제와 exposed terminal 문제, 링크 계층에서의 패킷 손실, 불공정성의 문제들과 노드의 이동에 의한 경로 단절시 발생되는 패킷 순서 바뀜 문제와 경로의 단절로 인한 재전송 타이머의 exponential backoff에 의한 대역폭의 낭비 등이 있다. 특히 이동 ad-hoc 망에서는 전송 범위(transmission range)와 간섭범위(interference range)의 불일치로 인해 발생되는 hidden terminal 문제로 인해 동시에 전송할 수 있는 노드의 수가 제한되며 이로 인해 성능 저하가 크게 발생된다. 본 논문에서는 IEEE 802.11 기반 이동 ad-hoc 망에서 발생되는 hidden terminal 문제로 인해 노드가 전송을 하지 못하고 (contention window)만 크게 증가되는 문제를 해결하기 위한 MAC 알고리즘을 제안한다. 기존의 802.11 MAC의 DCF(distributed coordination function)에서는 전송에 실패할 경우 를 지수적으로 증가 시키지만 본 논문에서 제안하는 기법은 노드가 전송 실패를 하였을 경우 그 원인에 따라 를 적절하게 변화시킴으로 성능 향상을 얻을 수 있다. 이 기법을 사용하면 hidden terminal에 의해 전송을 실패하는 노드에게 공정한 전송 기회를 부여함으로써 TCP 성능 향상을 얻을 수 있음을 시뮬레이션을 통해 보였다.

기업의 감염 예방 서비스품질 개선을 위한 정보공유가 방문업체의 질병관리에 대한 만족에 미치는 영향 분석

김한집 한국콘텐츠학회 2022 한국콘텐츠학회논문지 Vol.22 No.9

This study aims to provide basic information on how to secure competitiveness of companies from a practical point of view by examining how information sharing for companies' infection prevention and service quality improvement affects revisit intentions. In order to achieve the purpose of this study, 341 visitors over the age of 19 who visited offline stores located in Busan and Gyeongnam were selected as study subjects. As a result of this study, it was found that consumers' perceived health beliefs, perceived disease infection probability, and perceived disease infection severity had a significant effect on revisit intention. In addition, it was found that the company's infection prevention information sharing and infection prevention customer management had a significant mediating effect on the relationship between perceived health beliefs and revisit intention. Based on these research results, the conclusion suggested that a company needs a series of management activities that can contribute to the sharing of information on infection prevention and customer management among members of the organization and achievement of business performance. 본 연구는 기업의 감염 예방 서비스품질 개선을 위한 정보공유가 방문업체의 질병관리에 대한 만족에 어떠한 영향을 미치는지 규명하여, 실무적인 관점에서 기업의 경쟁력 확보방안에 대한 기초정보를 제공하고자 하였다. 본 연구목적을 달성하기 위하여, 부산, 경남에 위치한 오프라인 매장에 방문한 만 19세 이상의 341명의 방문객을 연구대상자로 선정하였다. 본 연구결과, 소비자가 지각된 건강신념, 지각된 질병 감염 가능성과 지각된 질병 감염 심각성이 방문업체의 질병관리에 대한 만족에 유의미한 영향 관계가 나타났다. 아울러 기업의 감염 예방 정보공유에 대한 인식과 감염 예방 고객관리에 대한 인식은 지각된 건강신념과 방문업체의 질병관리에 대한 만족과의 관계에서 유의미한 매개효과가 있는 것으로 파악되었다. 이러한 연구 결과를 토대로 살펴본, 결론은 기업이 감염 예방 정보공유에 대한 인식과 고객관리 차원에서 조직 구성원 간 이와 관련한 정보공유와 경영성과 달성에 기여할 수 있는 일련의 경영 활동이 필요함을 제기하였다.

환상(環狀)및 선상(線狀)감자 걀쪽바이로이드 RNA분자의 전기영동적(電氣泳動的) 분리(分離)를 위한 효과적인 조건에 관한 연구

김한집,이재열 한국식물병리학회 1987 Plant Pathology Journal Vol.3 No.4

지식공유 코칭이 혁신 활동 성과에 미치는 영향분석 : 팀 응집력 매개효과 중심으로

김한집 한국문화융합학회 2022 문화와 융합 Vol.44 No.2

In this study, there is a need to efficiently manage knowledge sharing coaching in order to create stable and continuous performance of companies. Based on this, the relationship between knowledge sharing coaching and innovation activities at the corporate level was empirically identified. In order to achieve this purpose, this study empirically analyzed the effect of knowledge provision and knowledge pursuit coaching, which are sub-factors of knowledge sharing coaching, on the performance of innovation activities, using a structural equation model as a mediating effect of team cohesion. As a result of analyzing 344 employees working in various industries, it was found that there is a positive (+) relationship between major variables. Based on the results of this study, this study presented implications that can promote the performance of innovation activities at the practical corporate level. In addition, the limitations of this study and future research tasks are presented.

벼 엽록체 DNA 내의 151 bp 반복염기서열에 의한 유전자 재배열

김한집,남백희 한국농화학회 1993 Applied Biological Chemistry (Appl Biol Chem) Vol.36 No.3

To investigate the gene rearrangement via short repeated sequences in chloroplast DNA, the pattern of heterologous gene clusters containing the 151 by repeated sequence with the development of plastid was compared in rice and the homologous gene clusters from various plant sources were searched for comparative analysis. Southern blot analysis of rice DNA using rp12 gene containing 151 by repeated sequence as a probe showed the presence of heterologous gene clusters. Such heterologous gene clusters varied with the development of plastid. Also it was observed that the heterologous gene clusters were observed in all of the rice cultivars used in this work. Finally the comparative analysis of DNA sequence of the homologous gene clusters from various plants showed the evolutionary gene rearragngement via short repeated sequence among plants. These results suggest the possible relationship between the plastid development and gene rearrangement through short repeated sequences.

Cloned Nuclear Gene Encoding Ribulose - 1 , 5 - Bisphosphate Carboxylase Small Subunit of Pea(Pisum sativum L .)

김한집,구용범 한국유전학회 1988 Genes & Genomics Vol.10 No.4

A nuclear gene, rbcS, encoding the small subunit of ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase was isolated from a genomic library of pea which was constructed in bacteriophage EMBL3. The bacteriophage clone contained an Eco RI fragment of 8.4 Kbp and was screened by a cDNA probe encoding the precursor to the small subunit of ribulose-1, 5-bisphosphate carboxylase. Southern blot analysis of genomic DNA showed four Eco RI fragments (13.8 Kbp, 8.4 Kbp, 6.8 Kbp and 3.7 Kbp) when hybridized with a rbcS RNA probe. The cloned rbcS gene was analyzed by RNase mapping and transferred into tobacco callus using Ti vectors of Agrobacterium tumefaciens.