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- 저자 : Woochul Jung (검색결과 2 건)
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A Gene-Centric Perspective of Scientific and Technological Innovations
Woochul Jung Ulsan National Institute of Science and Technology 2023 국내석사
유전자와 유전자 산물에 대한 연구는 현대 생명공학의 기초가 되며, 의학, 농업, 식량산업, 에너지 공급, 환경 정화 등 여러 분야로 응용이 가능한 것으로 알려져 있다. 이러한 과학적 발견들과 기술 혁신을 유전자 중심의 관점에서 거시적으로 조사하고자, 본 논문에서는 연구 논문과 특허에 대한 대규모 선별이 진행되었다. 각 유전자가 갖는 과학적 파급력을 보기 위해서 PubMed에서 접근 가능한 연구 논문 중 제목과 초록에 유전자 또는 유전자 산물이 언급된 자료들을 수집하였다. 기술 혁신 부분에 대응하는 자료로는 미국특허청(USPTO)에서 공개된 특허 출판물이 수집되었다. 문헌 자료 선별과 함께, 유럽 생물정보학 연구소에서 관리하는 UniProt 협의체 데이터베이스 중 선별·제공되는 일부 항목들의 유전자-단백질 명칭을 수집하였고, 이는 이후 유전자 간에 지나치게 중복된 명칭이나 두문자어로 인한 혼동을 방지하기 위해 원소가 공유되지 않는 집합들로 일관되게 군집되었다. 결과적으로 제목/초록에 이러한 유전자 항목을 언급한 논문과 특허들의 연도별 수치를 바탕으로 인간 유전체 프로젝트가 시작된 이후의 추세를 보고하였다. 각 유전자 인용 추세는 연구 논문에서와 비교할 때 발명 문헌에서 변동이 더 큰 것으로 보였고, 두 부문 모두 의료 분야에서 유전자 인용에 대한 기여가 두드러졌다. 지금까지 유전자를 인용한 문헌들은 증가 추세였으나 제목이나 초록에 새롭게 언급되는 유전자의 수는 최근들어 감소하였다. 반면, 이미 연구된 유전자들의 새로운 조합들이 활발히 탐구되는 것으로 보이며, 이러한 조합에 자주 포함된 유전자일수록 단순 인용 횟수의 상위권 유전자보다 생명공학의 발전을 잘 설명히는 것으로 보인다. Research on genes and gene products is a foundation of modern biotechnology, and recognized for its applicability in medicine, agriculture, food industry, energy supply, environmental remediation, and many others. To investigate a macroscopic and gene-centric perspective of scientific discoveries and technological innovations, we employed a large-scale curation of research papers and patents. As a raw data to represent the scientific impact of each gene, we collected the entire set of research articles available on PubMed, that have the names of genes or gene products in their title or abstract. The more dedicated literature source, the United States Patent and Trademark Office (USPTO) patent publication, was retrieved as a source data to represent the counterpart in technological innovations. In parallel with this literature curation, the gene symbols were collected from curated subset of UniProt consortium database maintained by European Bioinformatics Institute, and then clustered into the non-overlapping standardized sets to eliminate the overwhelming duplicates and possible contamination by common acronyms. Based on the annual counts of papers or patents whose titles/abstracts include a given gene, we show the overall trends of genetic research since the launch of the Human Genome Project. The gene citation fluctuated more in inventive activity compared to those in the research, while both sides were largely contributed by medicinal discipline. The volume of publications mentioning genes has been increased while the debut of new genes on titles and abstracts has been deflated. In contrast, new combinations of previously-studied genes kept actively explored, and their frequently adopted genes informed biotechnology innovations rather than sheerly top-studied genes.
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